MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Granulicella tundricola plasmid pACIX904

Total Repeats: 2179

< Previous12345Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015059	TTC	2	6	105641	105646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322433426
2002	NC_015059	TTA	2	6	105820	105825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322433426
2003	NC_015059	ATT	2	6	105936	105941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322433426
2004	NC_015059	GAA	2	6	105986	105991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322433426
2005	NC_015059	TTG	2	6	106036	106041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322433426
2006	NC_015059	GT	3	6	106054	106059	0 %	50 %	50 %	0 %	322433426
2007	NC_015059	GGA	2	6	106137	106142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322433426
2008	NC_015059	AAAT	2	8	106162	106169	75 %	25 %	0 %	0 %	322433426
2009	NC_015059	TTGTGG	2	12	106173	106184	0 %	50 %	50 %	0 %	322433426
2010	NC_015059	GTT	2	6	106238	106243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322433426
2011	NC_015059	AGG	2	6	106318	106323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322433426
2012	NC_015059	AAG	2	6	106370	106375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322433426
2013	NC_015059	GTC	2	6	106384	106389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322433426
2014	NC_015059	TCCT	2	8	106393	106400	0 %	50 %	0 %	50 %	322433426
2015	NC_015059	TGC	2	6	106457	106462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322433426
2016	NC_015059	CGC	2	6	106466	106471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322433426
2017	NC_015059	CGT	2	6	106641	106646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322433426
2018	NC_015059	ATT	2	6	106806	106811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322433426
2019	NC_015059	CGC	2	6	106895	106900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322433426
2020	NC_015059	GTC	2	6	106962	106967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322433426
2021	NC_015059	CAA	2	6	106981	106986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322433426
2022	NC_015059	G	7	7	107007	107013	0 %	0 %	100 %	0 %	322433426
2023	NC_015059	CGC	2	6	107080	107085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322433426
2024	NC_015059	ATT	2	6	107144	107149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322433426
2025	NC_015059	AT	3	6	107204	107209	50 %	50 %	0 %	0 %	322433426
2026	NC_015059	CTT	2	6	107277	107282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322433426
2027	NC_015059	GCT	2	6	107410	107415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322433426
2028	NC_015059	AT	3	6	107431	107436	50 %	50 %	0 %	0 %	322433426
2029	NC_015059	ACA	2	6	107467	107472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322433426
2030	NC_015059	GA	3	6	107561	107566	50 %	0 %	50 %	0 %	322433426
2031	NC_015059	AGCC	2	8	107651	107658	25 %	0 %	25 %	50 %	322433427
2032	NC_015059	TCG	2	6	107686	107691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322433427
2033	NC_015059	ACCA	2	8	107692	107699	50 %	0 %	0 %	50 %	322433427
2034	NC_015059	CT	3	6	107717	107722	0 %	50 %	0 %	50 %	322433427
2035	NC_015059	CAC	2	6	107725	107730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322433427
2036	NC_015059	GAC	2	6	107765	107770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322433427
2037	NC_015059	GTTC	2	8	107798	107805	0 %	50 %	25 %	25 %	322433427
2038	NC_015059	ATG	4	12	107925	107936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322433427
2039	NC_015059	CTG	3	9	107988	107996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322433427
2040	NC_015059	GCC	2	6	107999	108004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322433427
2041	NC_015059	AAAGC	2	10	108054	108063	60 %	0 %	20 %	20 %	322433427
2042	NC_015059	CAT	2	6	108103	108108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322433427
2043	NC_015059	GTT	2	6	108118	108123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322433427
2044	NC_015059	ATG	2	6	108150	108155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322433427
2045	NC_015059	GCG	2	6	108173	108178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322433427
2046	NC_015059	ACAG	2	8	108397	108404	50 %	0 %	25 %	25 %	322433427
2047	NC_015059	TTG	2	6	108447	108452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322433427
2048	NC_015059	CTAT	2	8	108485	108492	25 %	50 %	0 %	25 %	322433427
2049	NC_015059	T	8	8	108492	108499	0 %	100 %	0 %	0 %	322433427
2050	NC_015059	TGC	2	6	108549	108554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322433427
2051	NC_015059	TTC	2	6	108560	108565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322433427
2052	NC_015059	GAC	2	6	108662	108667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2053	NC_015059	AGT	2	6	108687	108692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2054	NC_015059	TGA	2	6	108705	108710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2055	NC_015059	TGT	2	6	108765	108770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2056	NC_015059	GCC	2	6	108869	108874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2057	NC_015059	ACA	2	6	108985	108990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322433428
2058	NC_015059	TTA	3	9	109096	109104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322433428
2059	NC_015059	TTA	2	6	109156	109161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322433428
2060	NC_015059	GTG	2	6	109176	109181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322433428
2061	NC_015059	CGAT	2	8	109247	109254	25 %	25 %	25 %	25 %	322433428
2062	NC_015059	CAA	2	6	109258	109263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322433428
2063	NC_015059	TTC	2	6	109335	109340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322433428
2064	NC_015059	TGC	2	6	109351	109356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322433428
2065	NC_015059	TAGA	2	8	109405	109412	50 %	25 %	25 %	0 %	322433428
2066	NC_015059	TCA	2	6	109471	109476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322433428
2067	NC_015059	CTA	2	6	109537	109542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322433428
2068	NC_015059	TCG	2	6	109555	109560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322433428
2069	NC_015059	TCCG	2	8	109571	109578	0 %	25 %	25 %	50 %	322433428
2070	NC_015059	CGA	2	6	109619	109624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322433428
2071	NC_015059	CTC	2	6	109635	109640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322433428
2072	NC_015059	ATT	2	6	109665	109670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322433428
2073	NC_015059	TTAT	2	8	109744	109751	25 %	75 %	0 %	0 %	322433428
2074	NC_015059	AT	4	8	109759	109766	50 %	50 %	0 %	0 %	322433428
2075	NC_015059	AGC	2	6	109786	109791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322433428
2076	NC_015059	GTC	2	6	109863	109868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322433428
2077	NC_015059	TC	3	6	109901	109906	0 %	50 %	0 %	50 %	322433428
2078	NC_015059	GTT	2	6	109910	109915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322433428
2079	NC_015059	TCG	2	6	109927	109932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322433428
2080	NC_015059	TTC	2	6	109962	109967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322433428
2081	NC_015059	TGA	2	6	110153	110158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322433428
2082	NC_015059	G	6	6	110185	110190	0 %	0 %	100 %	0 %	322433428
2083	NC_015059	TAG	2	6	110200	110205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322433428
2084	NC_015059	TC	3	6	110235	110240	0 %	50 %	0 %	50 %	322433428
2085	NC_015059	TC	3	6	110373	110378	0 %	50 %	0 %	50 %	322433428
2086	NC_015059	TGC	2	6	110398	110403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322433428
2087	NC_015059	CAT	2	6	110474	110479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322433429
2088	NC_015059	G	8	8	110516	110523	0 %	0 %	100 %	0 %	322433429
2089	NC_015059	GAG	2	6	110538	110543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322433429
2090	NC_015059	ACA	2	6	110548	110553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322433429
2091	NC_015059	CA	3	6	110811	110816	50 %	0 %	0 %	50 %	322433429
2092	NC_015059	GA	3	6	110855	110860	50 %	0 %	50 %	0 %	322433429
2093	NC_015059	AGG	2	6	110870	110875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322433429
2094	NC_015059	GGC	2	6	110975	110980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322433429
2095	NC_015059	CTG	2	6	111007	111012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322433429
2096	NC_015059	CCG	2	6	111024	111029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322433429
2097	NC_015059	TC	3	6	111054	111059	0 %	50 %	0 %	50 %	322433429
2098	NC_015059	ATT	2	6	111070	111075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322433429
2099	NC_015059	TGT	2	6	111077	111082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322433429
2100	NC_015059	GTG	2	6	111156	111161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322433429
2101	NC_015059	AAG	2	6	111192	111197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322433429
2102	NC_015059	GAA	2	6	111291	111296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322433429
2103	NC_015059	CGG	2	6	111328	111333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322433429
2104	NC_015059	CAA	2	6	111340	111345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322433429
2105	NC_015059	GTT	2	6	111378	111383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322433429
2106	NC_015059	TCT	2	6	111400	111405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322433429
2107	NC_015059	GAC	2	6	111416	111421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322433429
2108	NC_015059	GAA	2	6	111423	111428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322433429
2109	NC_015059	GCG	2	6	111542	111547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322433429
2110	NC_015059	AAG	2	6	111568	111573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322433429
2111	NC_015059	GGC	2	6	111580	111585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2112	NC_015059	GTC	2	6	111631	111636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322433430
2113	NC_015059	GCG	2	6	111650	111655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322433430
2114	NC_015059	GTT	2	6	111691	111696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322433430
2115	NC_015059	TAGA	2	8	111697	111704	50 %	25 %	25 %	0 %	322433430
2116	NC_015059	TCG	2	6	111755	111760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322433430
2117	NC_015059	GTC	2	6	111766	111771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322433430
2118	NC_015059	TGCA	2	8	111856	111863	25 %	25 %	25 %	25 %	322433430
2119	NC_015059	ATC	3	9	111955	111963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322433430
2120	NC_015059	GGA	2	6	112053	112058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322433430
2121	NC_015059	CGAT	2	8	112103	112110	25 %	25 %	25 %	25 %	322433430
2122	NC_015059	ACC	2	6	112151	112156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322433430
2123	NC_015059	CGA	2	6	112158	112163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322433430
2124	NC_015059	CA	4	8	112192	112199	50 %	0 %	0 %	50 %	322433430
2125	NC_015059	GAACC	2	10	112248	112257	40 %	0 %	20 %	40 %	322433430
2126	NC_015059	AGG	2	6	112262	112267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322433430
2127	NC_015059	CGAT	2	8	112296	112303	25 %	25 %	25 %	25 %	322433430
2128	NC_015059	AGC	2	6	112322	112327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322433430
2129	NC_015059	CCA	2	6	112386	112391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322433430
2130	NC_015059	ATT	2	6	112456	112461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2131	NC_015059	ATGC	2	8	112637	112644	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2132	NC_015059	GGA	2	6	112652	112657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2133	NC_015059	TTG	2	6	112704	112709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2134	NC_015059	GA	3	6	112793	112798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2135	NC_015059	TGT	2	6	112817	112822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322433431
2136	NC_015059	CTG	2	6	112904	112909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322433431
2137	NC_015059	TGG	2	6	112995	113000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322433431
2138	NC_015059	CAC	2	6	113001	113006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322433431
2139	NC_015059	CTC	2	6	113009	113014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322433431
2140	NC_015059	TGA	2	6	113106	113111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322433431
2141	NC_015059	GCC	2	6	113149	113154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322433431
2142	NC_015059	CAA	2	6	113164	113169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322433431
2143	NC_015059	TCC	2	6	113173	113178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322433431
2144	NC_015059	GCT	3	9	113224	113232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322433431
2145	NC_015059	CAA	2	6	113282	113287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322433431
2146	NC_015059	TCGA	2	8	113323	113330	25 %	25 %	25 %	25 %	322433431
2147	NC_015059	G	6	6	113332	113337	0 %	0 %	100 %	0 %	322433431
2148	NC_015059	AGC	2	6	113349	113354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322433431
2149	NC_015059	CTG	2	6	113546	113551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322433431
2150	NC_015059	ATC	2	6	113563	113568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322433431
2151	NC_015059	GAT	2	6	113599	113604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322433431
2152	NC_015059	CAG	3	9	113645	113653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322433431
2153	NC_015059	GCA	2	6	113675	113680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322433431
2154	NC_015059	GAA	2	6	113800	113805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322433432
2155	NC_015059	GGC	2	6	113819	113824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322433432
2156	NC_015059	TG	3	6	113839	113844	0 %	50 %	50 %	0 %	322433432
2157	NC_015059	AGC	2	6	113860	113865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322433432
2158	NC_015059	TTAGGT	2	12	113873	113884	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	322433432
2159	NC_015059	GCG	2	6	113904	113909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322433432
2160	NC_015059	TGG	2	6	113923	113928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322433432
2161	NC_015059	CGA	2	6	113994	113999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322433432
2162	NC_015059	CGG	2	6	114025	114030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322433432
2163	NC_015059	GCT	2	6	114105	114110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322433432
2164	NC_015059	CCG	2	6	114207	114212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322433432
2165	NC_015059	GGA	2	6	114260	114265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322433432
2166	NC_015059	GCT	2	6	114450	114455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322433432
2167	NC_015059	CGG	2	6	114484	114489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322433432
2168	NC_015059	TC	3	6	114511	114516	0 %	50 %	0 %	50 %	322433432
2169	NC_015059	CCA	2	6	114534	114539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322433432
2170	NC_015059	CTT	2	6	114551	114556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322433432
2171	NC_015059	GGA	2	6	114614	114619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322433432
2172	NC_015059	ACA	2	6	114655	114660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322433432
2173	NC_015059	CTGC	2	8	114689	114696	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2174	NC_015059	ACG	2	6	114740	114745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322433433
2175	NC_015059	AGT	2	6	114798	114803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322433433
2176	NC_015059	ATG	2	6	114965	114970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322433433
2177	NC_015059	C	6	6	115016	115021	0 %	0 %	0 %	100 %	322433433
2178	NC_015059	CCCG	2	8	115150	115157	0 %	0 %	25 %	75 %	322433433
2179	NC_015059	TGC	2	6	115390	115395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

< Previous12345Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.