MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Granulicella tundricola plasmid pACIX903

Total Repeats: 292

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015058	AT	3	6	1331	1336	50 %	50 %	0 %	0 %	322433175
2	NC_015058	TG	3	6	2989	2994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015058	CA	3	6	3230	3235	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015058	AG	4	8	3646	3653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015058	AG	3	6	3976	3981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015058	CT	3	6	4002	4007	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015058	TG	3	6	4201	4206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015058	GC	3	6	5273	5278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015058	CG	3	6	5694	5699	0 %	0 %	50 %	50 %	322433177
10	NC_015058	AG	3	6	6635	6640	50 %	0 %	50 %	0 %	322433177
11	NC_015058	AC	3	6	6767	6772	50 %	0 %	0 %	50 %	322433177
12	NC_015058	AC	3	6	6931	6936	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015058	GC	3	6	7073	7078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015058	AG	3	6	7566	7571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015058	AC	3	6	8562	8567	50 %	0 %	0 %	50 %	322433179
16	NC_015058	AG	3	6	9126	9131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015058	GC	3	6	10565	10570	0 %	0 %	50 %	50 %	322433181
18	NC_015058	CG	3	6	11334	11339	0 %	0 %	50 %	50 %	322433181
19	NC_015058	TC	3	6	11342	11347	0 %	50 %	0 %	50 %	322433181
20	NC_015058	GC	3	6	11453	11458	0 %	0 %	50 %	50 %	322433181
21	NC_015058	TC	3	6	12271	12276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015058	GC	3	6	12552	12557	0 %	0 %	50 %	50 %	322433182
23	NC_015058	TG	3	6	12739	12744	0 %	50 %	50 %	0 %	322433182
24	NC_015058	CA	3	6	12859	12864	50 %	0 %	0 %	50 %	322433182
25	NC_015058	TG	3	6	13320	13325	0 %	50 %	50 %	0 %	322433182
26	NC_015058	GT	3	6	14774	14779	0 %	50 %	50 %	0 %	322433182
27	NC_015058	GC	3	6	15127	15132	0 %	0 %	50 %	50 %	322433182
28	NC_015058	AG	3	6	16158	16163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015058	GA	3	6	16317	16322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015058	GA	3	6	16813	16818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015058	GA	3	6	16855	16860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015058	CG	4	8	19587	19594	0 %	0 %	50 %	50 %	322433184
33	NC_015058	CT	3	6	21297	21302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015058	CG	3	6	22001	22006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015058	GA	3	6	22472	22477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015058	GT	3	6	23142	23147	0 %	50 %	50 %	0 %	322433186
37	NC_015058	GC	3	6	24891	24896	0 %	0 %	50 %	50 %	322433188
38	NC_015058	AC	3	6	25242	25247	50 %	0 %	0 %	50 %	322433188
39	NC_015058	AT	3	6	25556	25561	50 %	50 %	0 %	0 %	322433188
40	NC_015058	GC	3	6	25691	25696	0 %	0 %	50 %	50 %	322433189
41	NC_015058	AG	3	6	25778	25783	50 %	0 %	50 %	0 %	322433189
42	NC_015058	CT	3	6	27387	27392	0 %	50 %	0 %	50 %	322433190
43	NC_015058	TG	3	6	27871	27876	0 %	50 %	50 %	0 %	322433190
44	NC_015058	AC	3	6	28038	28043	50 %	0 %	0 %	50 %	322433190
45	NC_015058	CA	3	6	28655	28660	50 %	0 %	0 %	50 %	322433191
46	NC_015058	CT	3	6	28787	28792	0 %	50 %	0 %	50 %	322433191
47	NC_015058	TC	3	6	29200	29205	0 %	50 %	0 %	50 %	322433191
48	NC_015058	CG	3	6	29282	29287	0 %	0 %	50 %	50 %	322433191
49	NC_015058	GC	3	6	31143	31148	0 %	0 %	50 %	50 %	322433192
50	NC_015058	CT	3	6	32149	32154	0 %	50 %	0 %	50 %	322433193
51	NC_015058	CG	3	6	32725	32730	0 %	0 %	50 %	50 %	322433193
52	NC_015058	GC	3	6	32764	32769	0 %	0 %	50 %	50 %	322433193
53	NC_015058	TC	3	6	32863	32868	0 %	50 %	0 %	50 %	322433193
54	NC_015058	CT	3	6	33147	33152	0 %	50 %	0 %	50 %	322433193
55	NC_015058	TC	3	6	34764	34769	0 %	50 %	0 %	50 %	322433194
56	NC_015058	CG	3	6	35892	35897	0 %	0 %	50 %	50 %	322433196
57	NC_015058	CG	3	6	37033	37038	0 %	0 %	50 %	50 %	322433197
58	NC_015058	GC	3	6	38342	38347	0 %	0 %	50 %	50 %	322433199
59	NC_015058	GT	3	6	39717	39722	0 %	50 %	50 %	0 %	322433200
60	NC_015058	TC	3	6	40903	40908	0 %	50 %	0 %	50 %	322433201
61	NC_015058	AG	3	6	41375	41380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015058	AG	3	6	41853	41858	50 %	0 %	50 %	0 %	322433202
63	NC_015058	AG	3	6	42136	42141	50 %	0 %	50 %	0 %	322433202
64	NC_015058	TC	3	6	42302	42307	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015058	TG	3	6	42785	42790	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015058	TC	3	6	43214	43219	0 %	50 %	0 %	50 %	322433203
67	NC_015058	GA	3	6	44061	44066	50 %	0 %	50 %	0 %	322433206
68	NC_015058	AG	3	6	44436	44441	50 %	0 %	50 %	0 %	322433206
69	NC_015058	GA	3	6	44732	44737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015058	GA	3	6	44751	44756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015058	CT	3	6	46562	46567	0 %	50 %	0 %	50 %	322433210
72	NC_015058	TC	3	6	47625	47630	0 %	50 %	0 %	50 %	322433210
73	NC_015058	GC	3	6	48460	48465	0 %	0 %	50 %	50 %	322433211
74	NC_015058	AC	4	8	48956	48963	50 %	0 %	0 %	50 %	322433211
75	NC_015058	CG	3	6	49291	49296	0 %	0 %	50 %	50 %	322433211
76	NC_015058	GA	3	6	49577	49582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015058	CT	3	6	49677	49682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015058	AG	3	6	50502	50507	50 %	0 %	50 %	0 %	322433212
79	NC_015058	TC	3	6	50936	50941	0 %	50 %	0 %	50 %	322433213
80	NC_015058	GA	3	6	51250	51255	50 %	0 %	50 %	0 %	322433213
81	NC_015058	AG	3	6	51832	51837	50 %	0 %	50 %	0 %	322433214
82	NC_015058	CG	3	6	52573	52578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015058	CT	3	6	53340	53345	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015058	AG	3	6	53832	53837	50 %	0 %	50 %	0 %	322433218
85	NC_015058	GA	3	6	54575	54580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015058	CT	3	6	54719	54724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015058	TG	3	6	54814	54819	0 %	50 %	50 %	0 %	322433219
88	NC_015058	CT	3	6	54872	54877	0 %	50 %	0 %	50 %	322433219
89	NC_015058	AG	3	6	55203	55208	50 %	0 %	50 %	0 %	322433220
90	NC_015058	GA	3	6	55616	55621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015058	AG	3	6	56228	56233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015058	CT	3	6	57640	57645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015058	CT	3	6	58614	58619	0 %	50 %	0 %	50 %	322433226
94	NC_015058	CA	3	6	59075	59080	50 %	0 %	0 %	50 %	322433228
95	NC_015058	CG	3	6	59367	59372	0 %	0 %	50 %	50 %	322433229
96	NC_015058	CT	4	8	59489	59496	0 %	50 %	0 %	50 %	322433229
97	NC_015058	TG	3	6	60631	60636	0 %	50 %	50 %	0 %	322433230
98	NC_015058	GA	3	6	61214	61219	50 %	0 %	50 %	0 %	322433230
99	NC_015058	GA	3	6	61428	61433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015058	GC	3	6	61853	61858	0 %	0 %	50 %	50 %	322433231
101	NC_015058	TG	3	6	62116	62121	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015058	GA	3	6	62348	62353	50 %	0 %	50 %	0 %	322433232
103	NC_015058	CG	3	6	63556	63561	0 %	0 %	50 %	50 %	322433232
104	NC_015058	CG	3	6	63575	63580	0 %	0 %	50 %	50 %	322433232
105	NC_015058	GC	3	6	64013	64018	0 %	0 %	50 %	50 %	322433233
106	NC_015058	GT	3	6	64857	64862	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015058	GA	3	6	67152	67157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015058	TC	3	6	67588	67593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015058	GA	3	6	68636	68641	50 %	0 %	50 %	0 %	322433235
110	NC_015058	AG	3	6	68721	68726	50 %	0 %	50 %	0 %	322433235
111	NC_015058	TC	3	6	70005	70010	0 %	50 %	0 %	50 %	322433236
112	NC_015058	GT	4	8	70105	70112	0 %	50 %	50 %	0 %	322433236
113	NC_015058	TC	3	6	70926	70931	0 %	50 %	0 %	50 %	322433236
114	NC_015058	TC	3	6	71187	71192	0 %	50 %	0 %	50 %	322433236
115	NC_015058	CT	3	6	72977	72982	0 %	50 %	0 %	50 %	322433236
116	NC_015058	CT	3	6	73654	73659	0 %	50 %	0 %	50 %	322433236
117	NC_015058	CG	3	6	74876	74881	0 %	0 %	50 %	50 %	322433237
118	NC_015058	CG	3	6	76675	76680	0 %	0 %	50 %	50 %	322433238
119	NC_015058	AG	3	6	76945	76950	50 %	0 %	50 %	0 %	322433238
120	NC_015058	GC	3	6	77187	77192	0 %	0 %	50 %	50 %	322433238
121	NC_015058	AG	3	6	77324	77329	50 %	0 %	50 %	0 %	322433238
122	NC_015058	CT	3	6	78763	78768	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015058	AT	3	6	78884	78889	50 %	50 %	0 %	0 %	322433239
124	NC_015058	CA	3	6	79404	79409	50 %	0 %	0 %	50 %	322433239
125	NC_015058	TG	3	6	79565	79570	0 %	50 %	50 %	0 %	322433239
126	NC_015058	AG	3	6	79679	79684	50 %	0 %	50 %	0 %	322433239
127	NC_015058	AC	3	6	80067	80072	50 %	0 %	0 %	50 %	322433240
128	NC_015058	TC	3	6	80284	80289	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015058	GT	3	6	82362	82367	0 %	50 %	50 %	0 %	322433242
130	NC_015058	AG	3	6	82723	82728	50 %	0 %	50 %	0 %	322433243
131	NC_015058	CA	3	6	82770	82775	50 %	0 %	0 %	50 %	322433243
132	NC_015058	GT	3	6	83197	83202	0 %	50 %	50 %	0 %	322433244
133	NC_015058	CT	4	8	83742	83749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015058	AC	3	6	84854	84859	50 %	0 %	0 %	50 %	322433245
135	NC_015058	CA	3	6	85135	85140	50 %	0 %	0 %	50 %	322433245
136	NC_015058	TC	3	6	85308	85313	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015058	CG	3	6	87247	87252	0 %	0 %	50 %	50 %	322433248
138	NC_015058	AC	3	6	87254	87259	50 %	0 %	0 %	50 %	322433248
139	NC_015058	GA	3	6	87874	87879	50 %	0 %	50 %	0 %	322433250
140	NC_015058	CT	3	6	88092	88097	0 %	50 %	0 %	50 %	322433250
141	NC_015058	TC	3	6	88217	88222	0 %	50 %	0 %	50 %	322433250
142	NC_015058	GC	3	6	88661	88666	0 %	0 %	50 %	50 %	322433250
143	NC_015058	CA	3	6	89061	89066	50 %	0 %	0 %	50 %	322433250
144	NC_015058	GA	3	6	92016	92021	50 %	0 %	50 %	0 %	322433251
145	NC_015058	GC	3	6	92225	92230	0 %	0 %	50 %	50 %	322433251
146	NC_015058	GA	3	6	92410	92415	50 %	0 %	50 %	0 %	322433252
147	NC_015058	CA	4	8	92466	92473	50 %	0 %	0 %	50 %	322433252
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290	NC_015058	GA	3	6	186982	186987	50 %	0 %	50 %	0 %	322433337
291	NC_015058	CT	3	6	187631	187636	0 %	50 %	0 %	50 %	322433338
292	NC_015058	CT	3	6	187948	187953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.