MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Geobacillus sp. Y4.1MC1 plasmid pGY4MC101

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014651	TA	3	6	380	385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014651	TA	3	6	552	557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014651	GC	3	6	1054	1059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014651	AT	3	6	1809	1814	50 %	50 %	0 %	0 %	312193410
5	NC_014651	TA	3	6	2266	2271	50 %	50 %	0 %	0 %	312193411
6	NC_014651	AG	3	6	4505	4510	50 %	0 %	50 %	0 %	312193413
7	NC_014651	AC	3	6	5042	5047	50 %	0 %	0 %	50 %	312193414
8	NC_014651	AG	3	6	5560	5565	50 %	0 %	50 %	0 %	312193414
9	NC_014651	TA	3	6	5579	5584	50 %	50 %	0 %	0 %	312193414
10	NC_014651	TG	3	6	6538	6543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014651	AT	3	6	6580	6585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014651	CG	3	6	7287	7292	0 %	0 %	50 %	50 %	312193415
13	NC_014651	GC	3	6	7329	7334	0 %	0 %	50 %	50 %	312193415
14	NC_014651	GC	3	6	7433	7438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014651	GC	3	6	7517	7522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014651	CG	3	6	8038	8043	0 %	0 %	50 %	50 %	312193416
17	NC_014651	GC	3	6	8547	8552	0 %	0 %	50 %	50 %	312193416
18	NC_014651	CG	3	6	9206	9211	0 %	0 %	50 %	50 %	312193417
19	NC_014651	AT	3	6	9392	9397	50 %	50 %	0 %	0 %	312193417
20	NC_014651	AT	3	6	11702	11707	50 %	50 %	0 %	0 %	312193419
21	NC_014651	CG	3	6	12934	12939	0 %	0 %	50 %	50 %	312193420
22	NC_014651	CG	3	6	13950	13955	0 %	0 %	50 %	50 %	312193421
23	NC_014651	TA	3	6	14184	14189	50 %	50 %	0 %	0 %	312193421
24	NC_014651	GC	3	6	15092	15097	0 %	0 %	50 %	50 %	312193422
25	NC_014651	TC	3	6	15149	15154	0 %	50 %	0 %	50 %	312193422
26	NC_014651	GT	3	6	15380	15385	0 %	50 %	50 %	0 %	312193423
27	NC_014651	GC	3	6	15440	15445	0 %	0 %	50 %	50 %	312193423
28	NC_014651	CG	3	6	16136	16141	0 %	0 %	50 %	50 %	312193424
29	NC_014651	CG	3	6	16559	16564	0 %	0 %	50 %	50 %	312193424
30	NC_014651	GC	3	6	16973	16978	0 %	0 %	50 %	50 %	312193424
31	NC_014651	TC	3	6	18398	18403	0 %	50 %	0 %	50 %	312193427
32	NC_014651	AT	3	6	18659	18664	50 %	50 %	0 %	0 %	312193427
33	NC_014651	TC	4	8	18741	18748	0 %	50 %	0 %	50 %	312193427
34	NC_014651	TA	3	6	19673	19678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014651	AG	3	6	20438	20443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014651	TA	4	8	22384	22391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014651	GA	3	6	22498	22503	50 %	0 %	50 %	0 %	312193431
38	NC_014651	AT	3	6	22701	22706	50 %	50 %	0 %	0 %	312193431
39	NC_014651	GA	3	6	23275	23280	50 %	0 %	50 %	0 %	312193431
40	NC_014651	AT	3	6	23586	23591	50 %	50 %	0 %	0 %	312193431
41	NC_014651	TC	3	6	23715	23720	0 %	50 %	0 %	50 %	312193431
42	NC_014651	TA	3	6	23990	23995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014651	CG	3	6	24141	24146	0 %	0 %	50 %	50 %	312193432
44	NC_014651	GA	3	6	24694	24699	50 %	0 %	50 %	0 %	312193432
45	NC_014651	AT	3	6	24812	24817	50 %	50 %	0 %	0 %	312193432
46	NC_014651	AT	3	6	24919	24924	50 %	50 %	0 %	0 %	312193432
47	NC_014651	TG	3	6	25535	25540	0 %	50 %	50 %	0 %	312193433
48	NC_014651	CG	3	6	25847	25852	0 %	0 %	50 %	50 %	312193433
49	NC_014651	AT	3	6	26386	26391	50 %	50 %	0 %	0 %	312193433
50	NC_014651	GA	3	6	28009	28014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014651	AG	3	6	28612	28617	50 %	0 %	50 %	0 %	312193435
52	NC_014651	GC	3	6	28970	28975	0 %	0 %	50 %	50 %	312193435
53	NC_014651	GC	3	6	29375	29380	0 %	0 %	50 %	50 %	312193436
54	NC_014651	CG	3	6	30818	30823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014651	TA	3	6	30865	30870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014651	GC	3	6	32013	32018	0 %	0 %	50 %	50 %	312193439
57	NC_014651	GC	3	6	32350	32355	0 %	0 %	50 %	50 %	312193441
58	NC_014651	CG	4	8	32481	32488	0 %	0 %	50 %	50 %	312193441
59	NC_014651	GA	3	6	32652	32657	50 %	0 %	50 %	0 %	312193441
60	NC_014651	AG	3	6	33181	33186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014651	GC	3	6	33423	33428	0 %	0 %	50 %	50 %	312193442
62	NC_014651	CG	3	6	33648	33653	0 %	0 %	50 %	50 %	312193442
63	NC_014651	TC	3	6	34053	34058	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014651	CG	3	6	34065	34070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014651	GC	3	6	34295	34300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014651	CG	3	6	34316	34321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014651	AT	4	8	34885	34892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014651	GC	3	6	36229	36234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014651	CA	3	6	36290	36295	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014651	GC	3	6	37639	37644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014651	GA	4	8	37649	37656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014651	TC	3	6	38200	38205	0 %	50 %	0 %	50 %	312193444
73	NC_014651	AT	3	6	38253	38258	50 %	50 %	0 %	0 %	312193444
74	NC_014651	CA	3	6	40449	40454	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014651	TG	3	6	40653	40658	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014651	TG	3	6	41654	41659	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014651	TG	4	8	41667	41674	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014651	AT	3	6	42695	42700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014651	AC	3	6	43182	43187	50 %	0 %	0 %	50 %	312193446
80	NC_014651	AT	3	6	43280	43285	50 %	50 %	0 %	0 %	312193446
81	NC_014651	CT	3	6	44081	44086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014651	TA	3	6	44160	44165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014651	GT	3	6	44306	44311	0 %	50 %	50 %	0 %	312193448
84	NC_014651	TA	4	8	44626	44633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014651	TA	3	6	44658	44663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014651	GA	3	6	45171	45176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014651	GT	3	6	45789	45794	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014651	TA	3	6	46553	46558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014651	GC	3	6	46882	46887	0 %	0 %	50 %	50 %	312193449
90	NC_014651	GA	3	6	47306	47311	50 %	0 %	50 %	0 %	312193450
91	NC_014651	GA	3	6	48308	48313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014651	TA	3	6	49044	49049	50 %	50 %	0 %	0 %	312193453
93	NC_014651	TC	3	6	49287	49292	0 %	50 %	0 %	50 %	312193453
94	NC_014651	TA	3	6	49602	49607	50 %	50 %	0 %	0 %	312193453
95	NC_014651	TA	4	8	49712	49719	50 %	50 %	0 %	0 %	312193453
96	NC_014651	TA	3	6	50106	50111	50 %	50 %	0 %	0 %	312193453
97	NC_014651	TA	3	6	50960	50965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014651	AT	3	6	51060	51065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014651	TG	3	6	51190	51195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014651	GT	3	6	51662	51667	0 %	50 %	50 %	0 %	312193454
101	NC_014651	AT	3	6	51753	51758	50 %	50 %	0 %	0 %	312193454
102	NC_014651	TG	3	6	52079	52084	0 %	50 %	50 %	0 %	312193454
103	NC_014651	AT	3	6	52918	52923	50 %	50 %	0 %	0 %	312193455
104	NC_014651	TA	3	6	53359	53364	50 %	50 %	0 %	0 %	312193455
105	NC_014651	CT	3	6	54047	54052	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_014651	TC	3	6	56116	56121	0 %	50 %	0 %	50 %	312193458
107	NC_014651	AT	4	8	58084	58091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014651	AT	3	6	58198	58203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014651	AT	3	6	58902	58907	50 %	50 %	0 %	0 %	312193460
110	NC_014651	AG	3	6	59759	59764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014651	TA	3	6	60653	60658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014651	TA	5	10	61817	61826	50 %	50 %	0 %	0 %	312193462
113	NC_014651	TA	3	6	62238	62243	50 %	50 %	0 %	0 %	312193463
114	NC_014651	CG	3	6	63068	63073	0 %	0 %	50 %	50 %	312193464
115	NC_014651	TG	3	6	63606	63611	0 %	50 %	50 %	0 %	312193464
116	NC_014651	CT	3	6	64228	64233	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014651	TA	3	6	64459	64464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014651	AT	3	6	65371	65376	50 %	50 %	0 %	0 %	312193466
119	NC_014651	GC	3	6	65579	65584	0 %	0 %	50 %	50 %	312193466
120	NC_014651	AT	3	6	66466	66471	50 %	50 %	0 %	0 %	312193466
121	NC_014651	AT	3	6	66793	66798	50 %	50 %	0 %	0 %	312193467
122	NC_014651	GA	3	6	67824	67829	50 %	0 %	50 %	0 %	312193468
123	NC_014651	TA	3	6	69153	69158	50 %	50 %	0 %	0 %	312193469
124	NC_014651	AT	3	6	69402	69407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014651	AT	3	6	69867	69872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014651	AT	3	6	70478	70483	50 %	50 %	0 %	0 %	312193470
127	NC_014651	CT	3	6	71558	71563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.