MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Geobacillus sp. Y4.1MC1 plasmid pGY4MC101

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014651	TGAAA	2	10	699	708	60 %	20 %	20 %	0 %	312193407
2	NC_014651	TTGTT	2	10	1715	1724	0 %	80 %	20 %	0 %	312193410
3	NC_014651	TCATA	2	10	2055	2064	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014651	TGCAT	2	10	4006	4015	20 %	40 %	20 %	20 %	312193413
5	NC_014651	GATGC	2	10	4107	4116	20 %	20 %	40 %	20 %	312193413
6	NC_014651	TTTCA	2	10	4126	4135	20 %	60 %	0 %	20 %	312193413
7	NC_014651	TTATT	2	10	4701	4710	20 %	80 %	0 %	0 %	312193414
8	NC_014651	TCCTT	2	10	5062	5071	0 %	60 %	0 %	40 %	312193414
9	NC_014651	ATGGC	2	10	6659	6668	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014651	GCTAA	2	10	7383	7392	40 %	20 %	20 %	20 %	312193415
11	NC_014651	CCCGA	2	10	7974	7983	20 %	0 %	20 %	60 %	312193416
12	NC_014651	AATAA	2	10	10400	10409	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014651	TTTAC	2	10	14879	14888	20 %	60 %	0 %	20 %	312193422
14	NC_014651	AAAGA	2	10	15922	15931	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014651	TCCCG	2	10	16664	16673	0 %	20 %	20 %	60 %	312193424
16	NC_014651	GCGCT	2	10	16983	16992	0 %	20 %	40 %	40 %	312193424
17	NC_014651	ACGAA	2	10	17031	17040	60 %	0 %	20 %	20 %	312193424
18	NC_014651	TTATA	2	10	17750	17759	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014651	TTTTA	2	10	18412	18421	20 %	80 %	0 %	0 %	312193427
20	NC_014651	TCAAA	2	10	18495	18504	60 %	20 %	0 %	20 %	312193427
21	NC_014651	AAACG	2	10	21092	21101	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014651	AAGAA	2	10	22506	22515	80 %	0 %	20 %	0 %	312193431
23	NC_014651	GATTT	2	10	25004	25013	20 %	60 %	20 %	0 %	312193432
24	NC_014651	TGCGC	2	10	25945	25954	0 %	20 %	40 %	40 %	312193433
25	NC_014651	ATTGG	2	10	27932	27941	20 %	40 %	40 %	0 %	312193434
26	NC_014651	AAGCA	2	10	27964	27973	60 %	0 %	20 %	20 %	312193434
27	NC_014651	GGGAA	2	10	30495	30504	40 %	0 %	60 %	0 %	312193436
28	NC_014651	GCGCG	2	10	31466	31475	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
29	NC_014651	AAGGA	2	10	31661	31670	60 %	0 %	40 %	0 %	312193438
30	NC_014651	GGACA	2	10	32101	32110	40 %	0 %	40 %	20 %	312193440
31	NC_014651	TTTCC	2	10	32138	32147	0 %	60 %	0 %	40 %	312193440
32	NC_014651	CGGAA	2	10	32704	32713	40 %	0 %	40 %	20 %	312193441
33	NC_014651	GTTTT	2	10	33049	33058	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014651	ATCCT	2	10	33493	33502	20 %	40 %	0 %	40 %	312193442
35	NC_014651	CAAGC	2	10	33854	33863	40 %	0 %	20 %	40 %	312193442
36	NC_014651	GTTTC	2	10	34366	34375	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_014651	CAAAT	2	10	35138	35147	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014651	TTTTA	2	10	37314	37323	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014651	GGCGC	2	10	37537	37546	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_014651	GCGGG	2	10	37574	37583	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014651	CATTG	2	10	39199	39208	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014651	TGCCT	2	10	40077	40086	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_014651	CAAAA	2	10	40531	40540	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014651	TTCAT	2	10	41465	41474	20 %	60 %	0 %	20 %	312193445
45	NC_014651	TAACG	2	10	42970	42979	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014651	AATAA	2	10	44211	44220	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014651	AGGAA	2	10	44900	44909	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014651	AGATG	2	10	46161	46170	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014651	ATCGT	2	10	46591	46600	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014651	ATAAA	2	10	47344	47353	80 %	20 %	0 %	0 %	312193450
51	NC_014651	AGAAT	2	10	47487	47496	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014651	AAATG	2	10	49898	49907	60 %	20 %	20 %	0 %	312193453
53	NC_014651	ATTTT	2	10	50994	51003	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014651	TCTAT	2	10	52878	52887	20 %	60 %	0 %	20 %	312193455
55	NC_014651	TTTGT	2	10	53132	53141	0 %	80 %	20 %	0 %	312193455
56	NC_014651	CTAAG	2	10	55425	55434	40 %	20 %	20 %	20 %	312193457
57	NC_014651	CGATG	2	10	55492	55501	20 %	20 %	40 %	20 %	312193457
58	NC_014651	TTGGT	2	10	55618	55627	0 %	60 %	40 %	0 %	312193457
59	NC_014651	TTCCC	2	10	56494	56503	0 %	40 %	0 %	60 %	312193458
60	NC_014651	ACGTA	2	10	56908	56917	40 %	20 %	20 %	20 %	312193458
61	NC_014651	CCTCG	2	10	57214	57223	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
62	NC_014651	TCTTT	2	10	58174	58183	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_014651	GGGAG	2	10	58432	58441	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014651	CAAAA	2	10	59005	59014	80 %	0 %	0 %	20 %	312193460
65	NC_014651	CAAAC	2	10	59789	59798	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_014651	TTTTC	2	10	60458	60467	0 %	80 %	0 %	20 %	312193461
67	NC_014651	CAATG	2	10	61467	61476	40 %	20 %	20 %	20 %	312193462
68	NC_014651	TCCGG	2	10	64759	64768	0 %	20 %	40 %	40 %	312193465
69	NC_014651	CGTAT	2	10	65857	65866	20 %	40 %	20 %	20 %	312193466
70	NC_014651	CTGGA	2	10	66611	66620	20 %	20 %	40 %	20 %	312193466
71	NC_014651	TTTCC	2	10	66692	66701	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_014651	GGAAA	2	10	66830	66839	60 %	0 %	40 %	0 %	312193467
73	NC_014651	TTAAG	2	10	68444	68453	40 %	40 %	20 %	0 %	312193469
74	NC_014651	GAAAA	2	10	69143	69152	80 %	0 %	20 %	0 %	312193469
75	NC_014651	ATTTT	2	10	70573	70582	20 %	80 %	0 %	0 %	312193470
76	NC_014651	AACCG	2	10	71197	71206	40 %	0 %	20 %	40 %	312193470

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.