MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gardnerella vaginalis 409-05 chromosome

Total Repeats: 34316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013721	T	6	6	15	20	0 %	100 %	0 %	0 %	283782521
2	NC_013721	ATT	2	6	46	51	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782521
3	NC_013721	GC	3	6	91	96	0 %	0 %	50 %	50 %	283782521
4	NC_013721	CGAT	2	8	111	118	25 %	25 %	25 %	25 %	283782521
5	NC_013721	AAT	2	6	196	201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782521
6	NC_013721	CTAC	2	8	214	221	25 %	25 %	0 %	50 %	283782521
7	NC_013721	AT	3	6	226	231	50 %	50 %	0 %	0 %	283782521
8	NC_013721	ACG	2	6	245	250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782521
9	NC_013721	TCT	2	6	325	330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782521
10	NC_013721	AAG	2	6	414	419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782521
11	NC_013721	AC	3	6	441	446	50 %	0 %	0 %	50 %	283782521
12	NC_013721	TCT	2	6	535	540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782521
13	NC_013721	AAGT	2	8	597	604	50 %	25 %	25 %	0 %	283782521
14	NC_013721	AC	3	6	623	628	50 %	0 %	0 %	50 %	283782521
15	NC_013721	ACT	2	6	634	639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782521
16	NC_013721	TCT	2	6	655	660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782521
17	NC_013721	TAA	2	6	715	720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782521
18	NC_013721	TCCC	2	8	727	734	0 %	25 %	0 %	75 %	283782521
19	NC_013721	T	6	6	801	806	0 %	100 %	0 %	0 %	283782521
20	NC_013721	GA	3	6	830	835	50 %	0 %	50 %	0 %	283782521
21	NC_013721	GCC	2	6	850	855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283782521
22	NC_013721	CTTC	2	8	865	872	0 %	50 %	0 %	50 %	283782521
23	NC_013721	C	6	6	921	926	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24	NC_013721	ATT	2	6	927	932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013721	ATA	2	6	939	944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013721	ATT	2	6	955	960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782522
27	NC_013721	GCA	2	6	1002	1007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782522
28	NC_013721	CAG	2	6	1066	1071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782522
29	NC_013721	TAA	2	6	1111	1116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782522
30	NC_013721	ATT	2	6	1127	1132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782522
31	NC_013721	GA	3	6	1133	1138	50 %	0 %	50 %	0 %	283782522
32	NC_013721	ATT	2	6	1142	1147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782522
33	NC_013721	CAA	2	6	1204	1209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782522
34	NC_013721	TCA	2	6	1224	1229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782522
35	NC_013721	TAC	2	6	1273	1278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782522
36	NC_013721	TAC	2	6	1291	1296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782522
37	NC_013721	GCA	2	6	1302	1307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782522
38	NC_013721	TAA	2	6	1312	1317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782522
39	NC_013721	ACC	2	6	1389	1394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283782522
40	NC_013721	AGC	2	6	1427	1432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782522
41	NC_013721	CCG	2	6	1449	1454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283782522
42	NC_013721	CAA	2	6	1456	1461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782522
43	NC_013721	ACA	2	6	1464	1469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782522
44	NC_013721	TCT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782522
45	NC_013721	AAT	2	6	1580	1585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782522
46	NC_013721	CGAG	2	8	1660	1667	25 %	0 %	50 %	25 %	283782522
47	NC_013721	CTG	2	6	1726	1731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782522
48	NC_013721	GAT	2	6	1807	1812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782522
49	NC_013721	GCA	2	6	1860	1865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782522
50	NC_013721	AGC	2	6	1868	1873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782522
51	NC_013721	CCG	2	6	1878	1883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283782522
52	NC_013721	T	6	6	1921	1926	0 %	100 %	0 %	0 %	283782522
53	NC_013721	GAA	2	6	1947	1952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782522
54	NC_013721	ATT	2	6	1964	1969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782522
55	NC_013721	GGA	2	6	2045	2050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283782522
56	NC_013721	CTG	2	6	2074	2079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782522
57	NC_013721	CTT	2	6	2107	2112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782522
58	NC_013721	TAA	2	6	2158	2163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782522
59	NC_013721	ATGT	2	8	2220	2227	25 %	50 %	25 %	0 %	283782522
60	NC_013721	TG	3	6	2236	2241	0 %	50 %	50 %	0 %	283782522
61	NC_013721	TCA	2	6	2271	2276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782522
62	NC_013721	ATT	3	9	2450	2458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782522
63	NC_013721	CTT	2	6	2497	2502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782522
64	NC_013721	T	6	6	2577	2582	0 %	100 %	0 %	0 %	283782522
65	NC_013721	ATG	2	6	2608	2613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782522
66	NC_013721	CAA	2	6	2618	2623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782522
67	NC_013721	CTTC	2	8	2636	2643	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013721	GAT	2	6	2715	2720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013721	A	7	7	2726	2732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013721	TTC	2	6	2798	2803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782523
71	NC_013721	TGC	2	6	2858	2863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782523
72	NC_013721	AGC	2	6	2877	2882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782523
73	NC_013721	TCG	2	6	2883	2888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782523
74	NC_013721	TACTT	2	10	3042	3051	20 %	60 %	0 %	20 %	283782523
75	NC_013721	CATGC	2	10	3073	3082	20 %	20 %	20 %	40 %	283782523
76	NC_013721	AGA	3	9	3208	3216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782523
77	NC_013721	ACTT	2	8	3248	3255	25 %	50 %	0 %	25 %	283782523
78	NC_013721	CAA	2	6	3256	3261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782523
79	NC_013721	GAA	2	6	3295	3300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782523
80	NC_013721	TG	3	6	3303	3308	0 %	50 %	50 %	0 %	283782523
81	NC_013721	ATT	2	6	3372	3377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013721	TA	3	6	3410	3415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013721	A	6	6	3463	3468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013721	CAA	2	6	3473	3478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013721	ATTT	2	8	3480	3487	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013721	TGA	2	6	3524	3529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013721	GGC	2	6	3551	3556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013721	AAAT	2	8	3558	3565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013721	TA	3	6	3577	3582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013721	GTC	2	6	3623	3628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013721	TTG	2	6	3637	3642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013721	GGA	2	6	3666	3671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013721	ATGC	2	8	3714	3721	25 %	25 %	25 %	25 %	283782524
94	NC_013721	CAA	2	6	3758	3763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782524
95	NC_013721	CTG	2	6	3794	3799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782524
96	NC_013721	AAG	2	6	3874	3879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782524
97	NC_013721	TACACT	2	12	3937	3948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782524
98	NC_013721	TTA	2	6	3963	3968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782524
99	NC_013721	ATG	2	6	3988	3993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782524
100	NC_013721	CGATGG	2	12	4002	4013	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	283782524
101	NC_013721	GAT	2	6	4099	4104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782524
102	NC_013721	ATAA	2	8	4111	4118	75 %	25 %	0 %	0 %	283782524
103	NC_013721	GGA	2	6	4234	4239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283782524
104	NC_013721	TGTTT	2	10	4248	4257	0 %	80 %	20 %	0 %	283782524
105	NC_013721	GAT	3	9	4342	4350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782524
106	NC_013721	TTGA	2	8	4402	4409	25 %	50 %	25 %	0 %	283782524
107	NC_013721	GGA	2	6	4465	4470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283782524
108	NC_013721	AAAGGC	2	12	4501	4512	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	283782524
109	NC_013721	ATTCA	2	10	4539	4548	40 %	40 %	0 %	20 %	283782524
110	NC_013721	GTTG	2	8	4577	4584	0 %	50 %	50 %	0 %	283782524
111	NC_013721	TGGA	2	8	4810	4817	25 %	25 %	50 %	0 %	283782524
112	NC_013721	AAC	2	6	4825	4830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782524
113	NC_013721	TAAT	2	8	4862	4869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013721	ATT	2	6	4871	4876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013721	ATAG	2	8	4891	4898	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013721	TTA	2	6	4913	4918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013721	GAT	2	6	4944	4949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013721	TTA	2	6	5051	5056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013721	GTT	2	6	5092	5097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013721	TGT	2	6	5131	5136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013721	GCT	2	6	5137	5142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013721	AGTA	2	8	5208	5215	50 %	25 %	25 %	0 %	283782525
123	NC_013721	CA	3	6	5221	5226	50 %	0 %	0 %	50 %	283782525
124	NC_013721	CAA	2	6	5291	5296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782525
125	NC_013721	AGA	2	6	5307	5312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782525
126	NC_013721	GATT	2	8	5394	5401	25 %	50 %	25 %	0 %	283782525
127	NC_013721	GCGACG	2	12	5444	5455	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	283782525
128	NC_013721	GAA	2	6	5460	5465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782525
129	NC_013721	A	6	6	5490	5495	100 %	0 %	0 %	0 %	283782525
130	NC_013721	TTA	2	6	5531	5536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782525
131	NC_013721	CGACGG	2	12	5544	5555	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	283782525
132	NC_013721	AAG	2	6	5657	5662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782525
133	NC_013721	ACT	2	6	5669	5674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782525
134	NC_013721	ATT	2	6	5689	5694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782525
135	NC_013721	TTA	2	6	5825	5830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782525
136	NC_013721	ATG	2	6	5891	5896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782525
137	NC_013721	CTTG	2	8	5898	5905	0 %	50 %	25 %	25 %	283782525
138	NC_013721	GCT	2	6	5929	5934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782525
139	NC_013721	TGA	2	6	5952	5957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782525
140	NC_013721	AGT	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782525
141	NC_013721	AT	3	6	6110	6115	50 %	50 %	0 %	0 %	283782525
142	NC_013721	ACTA	2	8	6156	6163	50 %	25 %	0 %	25 %	283782525
143	NC_013721	AAG	2	6	6164	6169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782525
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145	NC_013721	TTA	2	6	6392	6397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782525
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152	NC_013721	A	6	6	6759	6764	100 %	0 %	0 %	0 %	283782525
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156	NC_013721	CAAA	2	8	6854	6861	75 %	0 %	0 %	25 %	283782525
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165	NC_013721	A	6	6	7539	7544	100 %	0 %	0 %	0 %	283782525
166	NC_013721	AT	3	6	7630	7635	50 %	50 %	0 %	0 %	283782525
167	NC_013721	CTT	2	6	7648	7653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782525
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171	NC_013721	AAT	2	6	7849	7854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782525
172	NC_013721	AAT	2	6	7878	7883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782525
173	NC_013721	TGTT	2	8	7913	7920	0 %	75 %	25 %	0 %	283782525
174	NC_013721	AAGAAA	2	12	7941	7952	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	283782525
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176	NC_013721	ACAAG	2	10	8203	8212	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
177	NC_013721	CAA	2	6	8219	8224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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253	NC_013721	TTC	2	6	11561	11566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782528
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268	NC_013721	GCACA	2	10	12645	12654	40 %	0 %	20 %	40 %	283782528
269	NC_013721	TCA	2	6	12706	12711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782528
270	NC_013721	ATT	2	6	12720	12725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782528
271	NC_013721	TCCAT	2	10	12727	12736	20 %	40 %	0 %	40 %	283782528
272	NC_013721	TGC	2	6	12777	12782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782528
273	NC_013721	AGAT	2	8	12795	12802	50 %	25 %	25 %	0 %	283782528
274	NC_013721	ACA	2	6	12859	12864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782528
275	NC_013721	CAA	2	6	12914	12919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782528
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277	NC_013721	ATA	2	6	13012	13017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782528
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282	NC_013721	AC	3	6	13266	13271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
283	NC_013721	TTTA	2	8	13345	13352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_013721	ATT	2	6	13359	13364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_013721	TGA	2	6	13379	13384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
286	NC_013721	A	6	6	13415	13420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_013721	CAA	2	6	13437	13442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_013721	ATT	2	6	13463	13468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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305	NC_013721	ATCA	2	8	14050	14057	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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383	NC_013721	TTG	2	6	17978	17983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782533
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389	NC_013721	AAC	2	6	18152	18157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
390	NC_013721	TAA	2	6	18162	18167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
391	NC_013721	CTA	2	6	18213	18218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782534
392	NC_013721	GGC	2	6	18271	18276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283782534
393	NC_013721	AAT	2	6	18283	18288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782534
394	NC_013721	TCT	2	6	18359	18364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782534
395	NC_013721	ATT	2	6	18425	18430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782534
396	NC_013721	AAC	2	6	18520	18525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782534
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398	NC_013721	A	6	6	18612	18617	100 %	0 %	0 %	0 %	283782534
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400	NC_013721	AAC	2	6	18679	18684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782534
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