MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gardnerella vaginalis 409-05 chromosome

Total Repeats: 34316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013721	TAAC	2	8	182924	182931	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4002	NC_013721	AACA	2	8	182932	182939	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4003	NC_013721	GAA	2	6	182955	182960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782671
4004	NC_013721	TAA	2	6	182961	182966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782671
4005	NC_013721	ATG	2	6	182968	182973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782671
4006	NC_013721	GCTG	2	8	183013	183020	0 %	25 %	50 %	25 %	283782671
4007	NC_013721	GAC	2	6	183082	183087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782671
4008	NC_013721	GAC	2	6	183094	183099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782671
4009	NC_013721	GAG	2	6	183121	183126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283782671
4010	NC_013721	CCAG	2	8	183189	183196	25 %	0 %	25 %	50 %	283782671
4011	NC_013721	AAGC	2	8	183236	183243	50 %	0 %	25 %	25 %	283782671
4012	NC_013721	GCG	2	6	183356	183361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283782671
4013	NC_013721	AAG	2	6	183484	183489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782671
4014	NC_013721	CGA	2	6	183564	183569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782671
4015	NC_013721	CTC	2	6	183581	183586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283782671
4016	NC_013721	TAA	2	6	183609	183614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_013721	ATTA	2	8	183621	183628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_013721	ATA	2	6	183642	183647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_013721	AGG	2	6	183659	183664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_013721	GCT	2	6	183702	183707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782672
4021	NC_013721	TAAT	2	8	183857	183864	50 %	50 %	0 %	0 %	283782672
4022	NC_013721	TTA	2	6	183875	183880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782672
4023	NC_013721	TGC	2	6	183918	183923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782672
4024	NC_013721	ATT	2	6	183925	183930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782672
4025	NC_013721	T	6	6	183938	183943	0 %	100 %	0 %	0 %	283782672
4026	NC_013721	CA	3	6	183944	183949	50 %	0 %	0 %	50 %	283782672
4027	NC_013721	ATA	2	6	183952	183957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782672
4028	NC_013721	A	6	6	183957	183962	100 %	0 %	0 %	0 %	283782672
4029	NC_013721	CG	3	6	184117	184122	0 %	0 %	50 %	50 %	283782672
4030	NC_013721	TGC	2	6	184146	184151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782672
4031	NC_013721	ATT	2	6	184234	184239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782672
4032	NC_013721	GCA	2	6	184248	184253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782672
4033	NC_013721	TTTC	2	8	184310	184317	0 %	75 %	0 %	25 %	283782672
4034	NC_013721	TAAT	2	8	184334	184341	50 %	50 %	0 %	0 %	283782672
4035	NC_013721	CTG	3	9	184388	184396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782672
4036	NC_013721	TAA	2	6	184403	184408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782672
4037	NC_013721	GCA	2	6	184441	184446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782672
4038	NC_013721	AGCG	2	8	184460	184467	25 %	0 %	50 %	25 %	283782672
4039	NC_013721	GCT	2	6	184510	184515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782672
4040	NC_013721	TAT	2	6	184551	184556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782672
4041	NC_013721	ATTA	2	8	184618	184625	50 %	50 %	0 %	0 %	283782672
4042	NC_013721	TAT	2	6	184683	184688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782672
4043	NC_013721	TGG	2	6	184713	184718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283782672
4044	NC_013721	TTGGA	2	10	184730	184739	20 %	40 %	40 %	0 %	283782672
4045	NC_013721	GCG	2	6	184754	184759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283782672
4046	NC_013721	CTA	2	6	184767	184772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782672
4047	NC_013721	ATT	2	6	184789	184794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782672
4048	NC_013721	AATT	2	8	184815	184822	50 %	50 %	0 %	0 %	283782672
4049	NC_013721	GGT	2	6	184843	184848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283782672
4050	NC_013721	CTG	2	6	184904	184909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782672
4051	NC_013721	TAAG	2	8	184935	184942	50 %	25 %	25 %	0 %	283782672
4052	NC_013721	ATG	2	6	184960	184965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782673
4053	NC_013721	GT	3	6	185006	185011	0 %	50 %	50 %	0 %	283782673
4054	NC_013721	GCGT	2	8	185038	185045	0 %	25 %	50 %	25 %	283782673
4055	NC_013721	TGT	2	6	185148	185153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782673
4056	NC_013721	TGC	2	6	185256	185261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782673
4057	NC_013721	AAAAAT	2	12	185262	185273	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	283782673
4058	NC_013721	AAT	2	6	185313	185318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782673
4059	NC_013721	TCT	2	6	185344	185349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782673
4060	NC_013721	TAT	2	6	185367	185372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782673
4061	NC_013721	ACA	2	6	185416	185421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782673
4062	NC_013721	GTT	2	6	185422	185427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782673
4063	NC_013721	TGG	2	6	185449	185454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283782673
4064	NC_013721	ATA	2	6	185483	185488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782673
4065	NC_013721	AGCT	2	8	185513	185520	25 %	25 %	25 %	25 %	283782673
4066	NC_013721	GCGTTT	2	12	185547	185558	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	283782673
4067	NC_013721	GACG	2	8	185566	185573	25 %	0 %	50 %	25 %	283782673
4068	NC_013721	TTGG	2	8	185590	185597	0 %	50 %	50 %	0 %	283782673
4069	NC_013721	CGA	2	6	185613	185618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782673
4070	NC_013721	TAC	2	6	185709	185714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782673
4071	NC_013721	GCT	2	6	185740	185745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782673
4072	NC_013721	TTAC	2	8	185813	185820	25 %	50 %	0 %	25 %	283782673
4073	NC_013721	GAG	2	6	185827	185832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283782673
4074	NC_013721	GCG	2	6	185872	185877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283782673
4075	NC_013721	TGA	2	6	185921	185926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782673
4076	NC_013721	TGC	3	9	185943	185951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782673
4077	NC_013721	GCT	2	6	185974	185979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782673
4078	NC_013721	CTTATG	2	12	186052	186063	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	283782673
4079	NC_013721	TGG	2	6	186084	186089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283782673
4080	NC_013721	ATT	2	6	186130	186135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782673
4081	NC_013721	TGC	2	6	186197	186202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782673
4082	NC_013721	TCG	2	6	186232	186237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782673
4083	NC_013721	TTCG	2	8	186239	186246	0 %	50 %	25 %	25 %	283782673
4084	NC_013721	CAA	2	6	186304	186309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782674
4085	NC_013721	TTA	2	6	186318	186323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782674
4086	NC_013721	TTG	2	6	186387	186392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782674
4087	NC_013721	TGC	2	6	186394	186399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782674
4088	NC_013721	TGTTT	2	10	186405	186414	0 %	80 %	20 %	0 %	283782674
4089	NC_013721	CG	3	6	186524	186529	0 %	0 %	50 %	50 %	283782674
4090	NC_013721	CA	3	6	186539	186544	50 %	0 %	0 %	50 %	283782674
4091	NC_013721	CGTT	2	8	186643	186650	0 %	50 %	25 %	25 %	283782674
4092	NC_013721	TAA	2	6	186664	186669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782674
4093	NC_013721	ATA	2	6	186789	186794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782674
4094	NC_013721	CAG	2	6	186813	186818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782674
4095	NC_013721	CAG	2	6	186897	186902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782674
4096	NC_013721	TTC	2	6	186919	186924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782674
4097	NC_013721	TTC	2	6	186931	186936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782674
4098	NC_013721	CAA	2	6	186962	186967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782674
4099	NC_013721	TCT	2	6	187142	187147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782674
4100	NC_013721	TGCGCG	2	12	187197	187208	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	283782674
4101	NC_013721	CTG	3	9	187230	187238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782674
4102	NC_013721	TAT	2	6	187246	187251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782674
4103	NC_013721	GTT	2	6	187289	187294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782674
4104	NC_013721	TGA	2	6	187302	187307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782674
4105	NC_013721	TTC	2	6	187330	187335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782674
4106	NC_013721	GCA	2	6	187342	187347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782674
4107	NC_013721	GAAAT	2	10	187353	187362	60 %	20 %	20 %	0 %	283782674
4108	NC_013721	CTG	2	6	187416	187421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782674
4109	NC_013721	TGCT	2	8	187488	187495	0 %	50 %	25 %	25 %	283782674
4110	NC_013721	GA	3	6	187510	187515	50 %	0 %	50 %	0 %	283782674
4111	NC_013721	TGG	2	6	187529	187534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283782674
4112	NC_013721	TGC	2	6	187564	187569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782674
4113	NC_013721	TGC	2	6	187579	187584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782674
4114	NC_013721	GCC	2	6	187588	187593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283782674
4115	NC_013721	GAA	2	6	187637	187642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782674
4116	NC_013721	TTG	2	6	187834	187839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782675
4117	NC_013721	AAC	2	6	187859	187864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782675
4118	NC_013721	ATT	2	6	187875	187880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782675
4119	NC_013721	TGT	2	6	188063	188068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782675
4120	NC_013721	TGG	2	6	188147	188152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283782675
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4122	NC_013721	GT	3	6	188164	188169	0 %	50 %	50 %	0 %	283782675
4123	NC_013721	CTT	2	6	188205	188210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782675
4124	NC_013721	A	7	7	188239	188245	100 %	0 %	0 %	0 %	283782675
4125	NC_013721	AGC	2	6	188272	188277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782675
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4225	NC_013721	CTT	3	9	192563	192571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4227	NC_013721	AAC	2	6	192638	192643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4230	NC_013721	AAAT	2	8	192734	192741	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4231	NC_013721	CAA	2	6	192783	192788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782682
4232	NC_013721	CAAG	2	8	192873	192880	50 %	0 %	25 %	25 %	283782682
4233	NC_013721	TACC	2	8	192965	192972	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4234	NC_013721	TGT	2	6	192995	193000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4235	NC_013721	ACT	2	6	193002	193007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4237	NC_013721	AAAT	2	8	193075	193082	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4238	NC_013721	TAA	2	6	193102	193107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4239	NC_013721	A	7	7	193106	193112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4240	NC_013721	TGC	2	6	193204	193209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4241	NC_013721	A	6	6	193374	193379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4242	NC_013721	GT	3	6	193517	193522	0 %	50 %	50 %	0 %	283782683
4243	NC_013721	TGG	2	6	193563	193568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283782683
4244	NC_013721	AGT	2	6	193576	193581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782683
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4372	NC_013721	ACT	2	6	199587	199592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4374	NC_013721	A	6	6	199674	199679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4493	NC_013721	CAG	2	6	205424	205429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782695
4494	NC_013721	TCACG	2	10	205505	205514	20 %	20 %	20 %	40 %	283782695
4495	NC_013721	AGC	2	6	205515	205520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782695
4496	NC_013721	CGT	2	6	205529	205534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782695
4497	NC_013721	GCCAAT	2	12	205551	205562	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	283782695
4498	NC_013721	AAT	2	6	205676	205681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782695
4499	NC_013721	ACG	2	6	205723	205728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782695
4500	NC_013721	AAT	2	6	205776	205781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782695

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