MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gardnerella vaginalis 409-05 chromosome

Total Repeats: 34316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_013721	CA	3	6	1101552	1101557	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23502	NC_013721	AACAA	2	10	1101627	1101636	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
23503	NC_013721	GAC	2	6	1101643	1101648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23504	NC_013721	AAC	2	6	1101671	1101676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23505	NC_013721	CAA	2	6	1101678	1101683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23506	NC_013721	GAA	2	6	1101691	1101696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23507	NC_013721	GAA	2	6	1101721	1101726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23508	NC_013721	AAC	2	6	1101805	1101810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23509	NC_013721	GAA	3	9	1101868	1101876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23510	NC_013721	ACA	2	6	1101895	1101900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23511	NC_013721	ACC	2	6	1101904	1101909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23512	NC_013721	TCA	2	6	1101973	1101978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23513	NC_013721	CAAAA	2	10	1102010	1102019	80 %	0 %	0 %	20 %	283783417
23514	NC_013721	GC	4	8	1102024	1102031	0 %	0 %	50 %	50 %	283783417
23515	NC_013721	AAC	2	6	1102034	1102039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283783417
23516	NC_013721	A	6	6	1102117	1102122	100 %	0 %	0 %	0 %	283783417
23517	NC_013721	A	6	6	1102156	1102161	100 %	0 %	0 %	0 %	283783417
23518	NC_013721	ACA	2	6	1102164	1102169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283783417
23519	NC_013721	A	6	6	1102180	1102185	100 %	0 %	0 %	0 %	283783417
23520	NC_013721	CAG	2	6	1102186	1102191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783417
23521	NC_013721	CAA	2	6	1102218	1102223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283783417
23522	NC_013721	CTA	2	6	1102246	1102251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783417
23523	NC_013721	ACT	2	6	1102295	1102300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23524	NC_013721	CAT	2	6	1102328	1102333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783418
23525	NC_013721	CAA	2	6	1102396	1102401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283783418
23526	NC_013721	AAC	2	6	1102430	1102435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283783418
23527	NC_013721	AGAA	2	8	1102442	1102449	75 %	0 %	25 %	0 %	283783418
23528	NC_013721	CAA	2	6	1102452	1102457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283783418
23529	NC_013721	CA	3	6	1102539	1102544	50 %	0 %	0 %	50 %	283783418
23530	NC_013721	TCCTCA	2	12	1102581	1102592	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
23531	NC_013721	TG	3	6	1102652	1102657	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23532	NC_013721	AAC	2	6	1102706	1102711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23533	NC_013721	AAC	3	9	1102727	1102735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23534	NC_013721	A	6	6	1102756	1102761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23535	NC_013721	GC	3	6	1102813	1102818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23536	NC_013721	ACA	2	6	1102827	1102832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23537	NC_013721	CGA	2	6	1102902	1102907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23538	NC_013721	TGG	2	6	1102909	1102914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23539	NC_013721	AAC	2	6	1102919	1102924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23540	NC_013721	CAAA	2	8	1102929	1102936	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23541	NC_013721	AAT	2	6	1102940	1102945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23542	NC_013721	ATG	2	6	1103058	1103063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23543	NC_013721	CAT	2	6	1103102	1103107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23544	NC_013721	ACA	2	6	1103129	1103134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23545	NC_013721	TAA	2	6	1103138	1103143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783419
23546	NC_013721	AAG	2	6	1103150	1103155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783419
23547	NC_013721	CTT	2	6	1103181	1103186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283783419
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23549	NC_013721	ACT	2	6	1103220	1103225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783419
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23551	NC_013721	GCTT	2	8	1103303	1103310	0 %	50 %	25 %	25 %	283783419
23552	NC_013721	CA	3	6	1103315	1103320	50 %	0 %	0 %	50 %	283783419
23553	NC_013721	A	6	6	1103352	1103357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23554	NC_013721	AAC	2	6	1103360	1103365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23555	NC_013721	CTA	2	6	1103412	1103417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23556	NC_013721	TCAC	2	8	1103451	1103458	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23557	NC_013721	TTA	2	6	1103511	1103516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23558	NC_013721	AGA	2	6	1103574	1103579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23559	NC_013721	GCG	2	6	1103608	1103613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23560	NC_013721	A	6	6	1103634	1103639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23561	NC_013721	CTA	2	6	1103679	1103684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23562	NC_013721	AAG	2	6	1103699	1103704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23563	NC_013721	A	6	6	1103739	1103744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23564	NC_013721	GAAA	2	8	1103746	1103753	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23565	NC_013721	CAAG	2	8	1103793	1103800	50 %	0 %	25 %	25 %	283783420
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23572	NC_013721	CAA	2	6	1103948	1103953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283783420
23573	NC_013721	AAG	2	6	1103961	1103966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783420
23574	NC_013721	TTG	2	6	1103968	1103973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283783420
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23577	NC_013721	GGA	2	6	1104048	1104053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23578	NC_013721	GTG	2	6	1104062	1104067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783421
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23580	NC_013721	A	6	6	1104130	1104135	100 %	0 %	0 %	0 %	283783421
23581	NC_013721	CG	3	6	1104142	1104147	0 %	0 %	50 %	50 %	283783421
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23583	NC_013721	CG	3	6	1104291	1104296	0 %	0 %	50 %	50 %	283783421
23584	NC_013721	CAA	2	6	1104297	1104302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283783421
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23587	NC_013721	AACT	2	8	1104344	1104351	50 %	25 %	0 %	25 %	283783421
23588	NC_013721	GAA	2	6	1104386	1104391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23589	NC_013721	CAA	3	9	1104538	1104546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23590	NC_013721	CTA	2	6	1104586	1104591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23591	NC_013721	TGC	2	6	1104616	1104621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23592	NC_013721	CAAA	2	8	1104628	1104635	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23593	NC_013721	GAC	2	6	1104650	1104655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23594	NC_013721	GACGC	2	10	1104657	1104666	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23595	NC_013721	CGA	2	6	1104691	1104696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783422
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23602	NC_013721	CGA	2	6	1105185	1105190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783423
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23605	NC_013721	AAC	2	6	1105271	1105276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283783423
23606	NC_013721	CAA	2	6	1105280	1105285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283783423
23607	NC_013721	GC	3	6	1105315	1105320	0 %	0 %	50 %	50 %	283783423
23608	NC_013721	AGA	2	6	1105362	1105367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783423
23609	NC_013721	AGA	2	6	1105401	1105406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783423
23610	NC_013721	GAA	2	6	1105411	1105416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783423
23611	NC_013721	ACT	2	6	1105417	1105422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783423
23612	NC_013721	TGT	2	6	1105434	1105439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283783423
23613	NC_013721	TCG	2	6	1105451	1105456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783423
23614	NC_013721	AG	3	6	1105505	1105510	50 %	0 %	50 %	0 %	283783423
23615	NC_013721	ACT	2	6	1105568	1105573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783423
23616	NC_013721	A	6	6	1105651	1105656	100 %	0 %	0 %	0 %	283783423
23617	NC_013721	GC	3	6	1105671	1105676	0 %	0 %	50 %	50 %	283783423
23618	NC_013721	AGC	2	6	1105701	1105706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783423
23619	NC_013721	ACAGCA	2	12	1105707	1105718	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	283783423
23620	NC_013721	AAC	3	9	1105724	1105732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283783423
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23622	NC_013721	CAATC	2	10	1105810	1105819	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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23986	NC_013721	TTA	2	6	1121363	1121368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283783443
23987	NC_013721	GCTT	2	8	1121372	1121379	0 %	50 %	25 %	25 %	283783443
23988	NC_013721	CAC	2	6	1121430	1121435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283783443
23989	NC_013721	CGA	2	6	1121476	1121481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783444
23990	NC_013721	GCC	2	6	1121491	1121496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783444
23991	NC_013721	CAG	3	9	1121555	1121563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783444
23992	NC_013721	GCT	2	6	1121574	1121579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783444
23993	NC_013721	TAT	2	6	1121588	1121593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283783444
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23995	NC_013721	TACCAT	2	12	1121641	1121652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783444
23996	NC_013721	TCAC	2	8	1121662	1121669	25 %	25 %	0 %	50 %	283783444
23997	NC_013721	TGT	2	6	1121832	1121837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283783444
23998	NC_013721	CGG	2	6	1121873	1121878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783444
23999	NC_013721	AC	4	8	1121886	1121893	50 %	0 %	0 %	50 %	283783444
24000	NC_013721	GCGTA	2	10	1121896	1121905	20 %	20 %	40 %	20 %	283783444

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