MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gardnerella vaginalis 409-05 chromosome

Total Repeats: 34316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013721	TCA	2	6	45190	45195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782556
1002	NC_013721	ATT	2	6	45198	45203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782556
1003	NC_013721	TTC	2	6	45204	45209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782556
1004	NC_013721	AAT	2	6	45215	45220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782556
1005	NC_013721	T	6	6	45242	45247	0 %	100 %	0 %	0 %	283782556
1006	NC_013721	TCAT	2	8	45292	45299	25 %	50 %	0 %	25 %	283782556
1007	NC_013721	TTA	2	6	45355	45360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_013721	TTA	2	6	45425	45430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_013721	AAT	2	6	45451	45456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_013721	TAA	2	6	45459	45464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_013721	TAT	2	6	45465	45470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_013721	AAG	2	6	45478	45483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_013721	CTT	2	6	45514	45519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782557
1014	NC_013721	TCT	2	6	45522	45527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782557
1015	NC_013721	TTC	2	6	45536	45541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782557
1016	NC_013721	TTC	2	6	45551	45556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782557
1017	NC_013721	AAT	2	6	45572	45577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782557
1018	NC_013721	GTT	2	6	45618	45623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782557
1019	NC_013721	CTTCA	2	10	45635	45644	20 %	40 %	0 %	40 %	283782557
1020	NC_013721	TTACC	2	10	45661	45670	20 %	40 %	0 %	40 %	283782557
1021	NC_013721	CAA	2	6	45706	45711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782557
1022	NC_013721	TTC	2	6	45775	45780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782557
1023	NC_013721	AAC	2	6	45833	45838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782557
1024	NC_013721	AAG	2	6	45839	45844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782557
1025	NC_013721	CAA	2	6	45865	45870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782557
1026	NC_013721	GAC	2	6	45931	45936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782557
1027	NC_013721	GTT	2	6	45949	45954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782557
1028	NC_013721	CAT	2	6	45955	45960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782557
1029	NC_013721	AAT	2	6	46001	46006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782557
1030	NC_013721	TCT	2	6	46011	46016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782557
1031	NC_013721	TCG	2	6	46044	46049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782557
1032	NC_013721	TTC	2	6	46064	46069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782557
1033	NC_013721	CAT	2	6	46183	46188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782557
1034	NC_013721	CAA	2	6	46238	46243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782557
1035	NC_013721	AGA	2	6	46330	46335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782557
1036	NC_013721	TG	3	6	46345	46350	0 %	50 %	50 %	0 %	283782557
1037	NC_013721	AAG	3	9	46359	46367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782557
1038	NC_013721	CAT	2	6	46378	46383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782557
1039	NC_013721	ACC	2	6	46415	46420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283782557
1040	NC_013721	ACA	2	6	46485	46490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782557
1041	NC_013721	TTC	2	6	46496	46501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782557
1042	NC_013721	CATT	2	8	46519	46526	25 %	50 %	0 %	25 %	283782557
1043	NC_013721	GAA	2	6	46540	46545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782557
1044	NC_013721	ATC	2	6	46559	46564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782557
1045	NC_013721	CAA	2	6	46576	46581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782557
1046	NC_013721	TCA	2	6	46584	46589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782557
1047	NC_013721	CAA	2	6	46600	46605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782557
1048	NC_013721	ATC	2	6	46659	46664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782557
1049	NC_013721	TCG	2	6	46677	46682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782557
1050	NC_013721	TCT	2	6	46687	46692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782557
1051	NC_013721	TTGCA	2	10	46721	46730	20 %	40 %	20 %	20 %	283782557
1052	NC_013721	TCA	2	6	46752	46757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782557
1053	NC_013721	TCA	2	6	46830	46835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782557
1054	NC_013721	TGA	2	6	46932	46937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782557
1055	NC_013721	AGCA	2	8	46997	47004	50 %	0 %	25 %	25 %	283782557
1056	NC_013721	TGC	2	6	47022	47027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782557
1057	NC_013721	ATT	2	6	47048	47053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782557
1058	NC_013721	AAC	2	6	47057	47062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782557
1059	NC_013721	AAGAAC	2	12	47084	47095	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	283782557
1060	NC_013721	TCG	2	6	47124	47129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782557
1061	NC_013721	AGC	2	6	47183	47188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782557
1062	NC_013721	AAC	2	6	47225	47230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782557
1063	NC_013721	ACT	2	6	47265	47270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782557
1064	NC_013721	TTG	2	6	47335	47340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782557
1065	NC_013721	AAG	2	6	47387	47392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782557
1066	NC_013721	TTC	2	6	47393	47398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782557
1067	NC_013721	TTGC	2	8	47400	47407	0 %	50 %	25 %	25 %	283782557
1068	NC_013721	GAT	2	6	47413	47418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782557
1069	NC_013721	CAG	2	6	47497	47502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782557
1070	NC_013721	CAT	2	6	47563	47568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782557
1071	NC_013721	TGC	3	9	47657	47665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782557
1072	NC_013721	ATC	2	6	47669	47674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782557
1073	NC_013721	CAA	2	6	47704	47709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782557
1074	NC_013721	ATAG	2	8	47756	47763	50 %	25 %	25 %	0 %	283782557
1075	NC_013721	TCC	2	6	47846	47851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283782557
1076	NC_013721	ATAA	2	8	47864	47871	75 %	25 %	0 %	0 %	283782557
1077	NC_013721	ACG	2	6	47873	47878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782557
1078	NC_013721	CAA	2	6	47923	47928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782557
1079	NC_013721	CTG	2	6	47969	47974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782557
1080	NC_013721	TAT	2	6	48022	48027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782557
1081	NC_013721	CAT	2	6	48085	48090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782557
1082	NC_013721	ATTT	2	8	48101	48108	25 %	75 %	0 %	0 %	283782557
1083	NC_013721	CTT	2	6	48127	48132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_013721	T	6	6	48152	48157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_013721	CAT	2	6	48208	48213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782558
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1087	NC_013721	AGC	2	6	48290	48295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782558
1088	NC_013721	TTG	2	6	48340	48345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782558
1089	NC_013721	GAC	2	6	48418	48423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782558
1090	NC_013721	CAG	2	6	48424	48429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782558
1091	NC_013721	GAA	2	6	48569	48574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782558
1092	NC_013721	CATCAG	2	12	48613	48624	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	283782558
1093	NC_013721	ATA	2	6	48627	48632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782558
1094	NC_013721	TCT	2	6	48669	48674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782558
1095	NC_013721	ACC	3	9	48680	48688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283782558
1096	NC_013721	CAG	2	6	48691	48696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782558
1097	NC_013721	TCA	2	6	48724	48729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782558
1098	NC_013721	TTGC	2	8	48784	48791	0 %	50 %	25 %	25 %	283782558
1099	NC_013721	AAT	2	6	48849	48854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782558
1100	NC_013721	TTC	2	6	48860	48865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782558
1101	NC_013721	CAG	2	6	48907	48912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782558
1102	NC_013721	CGA	2	6	48930	48935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782558
1103	NC_013721	T	6	6	48950	48955	0 %	100 %	0 %	0 %	283782558
1104	NC_013721	AGC	2	6	48956	48961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782558
1105	NC_013721	AAT	2	6	48995	49000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782558
1106	NC_013721	T	6	6	49002	49007	0 %	100 %	0 %	0 %	283782558
1107	NC_013721	CTG	2	6	49147	49152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782558
1108	NC_013721	TCA	2	6	49170	49175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782558
1109	NC_013721	TCTTTC	2	12	49191	49202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782558
1110	NC_013721	AGT	2	6	49238	49243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782558
1111	NC_013721	CTT	2	6	49261	49266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782558
1112	NC_013721	AGT	2	6	49283	49288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782558
1113	NC_013721	TTC	2	6	49496	49501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782558
1114	NC_013721	AGA	2	6	49505	49510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782558
1115	NC_013721	CTG	2	6	49601	49606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782558
1116	NC_013721	TGT	2	6	49640	49645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782558
1117	NC_013721	GAC	2	6	49777	49782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782558
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1119	NC_013721	ACC	2	6	49844	49849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283782558
1120	NC_013721	CCG	2	6	49863	49868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283782558
1121	NC_013721	CCA	2	6	49869	49874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283782558
1122	NC_013721	CAT	2	6	49963	49968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782558
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1124	NC_013721	TCA	2	6	50037	50042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782558
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1132	NC_013721	CT	3	6	50392	50397	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_013721	A	6	6	50425	50430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_013721	TAA	2	6	50433	50438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1249	NC_013721	TATTT	2	10	55120	55129	20 %	80 %	0 %	0 %	283782562
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1369	NC_013721	A	7	7	60243	60249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1499	NC_013721	TTC	3	9	65109	65117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782572
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