MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gardnerella vaginalis 409-05 chromosome

Total Repeats: 34316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013721	TTA	2	6	23734	23739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782536
502	NC_013721	ACG	2	6	23758	23763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782536
503	NC_013721	T	6	6	23837	23842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_013721	TAAT	2	8	23864	23871	50 %	50 %	0 %	0 %	283782537
505	NC_013721	TCT	2	6	23910	23915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782537
506	NC_013721	CAT	2	6	23941	23946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782537
507	NC_013721	ACG	2	6	23990	23995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782537
508	NC_013721	ATT	2	6	24017	24022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782537
509	NC_013721	TTC	2	6	24074	24079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782537
510	NC_013721	AGT	2	6	24119	24124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782537
511	NC_013721	AAG	2	6	24125	24130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782537
512	NC_013721	ATC	2	6	24168	24173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782537
513	NC_013721	CTT	2	6	24194	24199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782537
514	NC_013721	AATT	2	8	24200	24207	50 %	50 %	0 %	0 %	283782537
515	NC_013721	TTC	2	6	24215	24220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782537
516	NC_013721	CGTC	2	8	24270	24277	0 %	25 %	25 %	50 %	283782537
517	NC_013721	TGC	2	6	24311	24316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782537
518	NC_013721	T	6	6	24339	24344	0 %	100 %	0 %	0 %	283782537
519	NC_013721	TC	3	6	24350	24355	0 %	50 %	0 %	50 %	283782537
520	NC_013721	ACG	2	6	24362	24367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782537
521	NC_013721	AAG	2	6	24473	24478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782537
522	NC_013721	GAT	2	6	24501	24506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782537
523	NC_013721	GAAAG	2	10	24561	24570	60 %	0 %	40 %	0 %	283782537
524	NC_013721	TGC	2	6	24587	24592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782537
525	NC_013721	T	6	6	24622	24627	0 %	100 %	0 %	0 %	283782537
526	NC_013721	GTG	2	6	24693	24698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283782537
527	NC_013721	AAT	3	9	24728	24736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782537
528	NC_013721	GCT	2	6	24754	24759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782537
529	NC_013721	AAT	2	6	24790	24795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782537
530	NC_013721	CTCAT	2	10	24915	24924	20 %	40 %	0 %	40 %	283782537
531	NC_013721	CAG	2	6	24928	24933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782537
532	NC_013721	CTT	2	6	24946	24951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782537
533	NC_013721	TG	3	6	25061	25066	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_013721	GAC	2	6	25114	25119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782538
535	NC_013721	GAC	2	6	25163	25168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782538
536	NC_013721	AGA	2	6	25280	25285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782538
537	NC_013721	ATG	2	6	25306	25311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782538
538	NC_013721	GAT	2	6	25332	25337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782538
539	NC_013721	AGC	2	6	25367	25372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782538
540	NC_013721	AGC	2	6	25386	25391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782538
541	NC_013721	CAT	3	9	25431	25439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782538
542	NC_013721	AAATT	2	10	25485	25494	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_013721	ATT	2	6	25502	25507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_013721	ATC	2	6	25626	25631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782539
545	NC_013721	AAG	2	6	25842	25847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782539
546	NC_013721	TCG	2	6	25876	25881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782539
547	NC_013721	TATT	2	8	25907	25914	25 %	75 %	0 %	0 %	283782539
548	NC_013721	TAT	2	6	26024	26029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_013721	AAC	2	6	26036	26041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_013721	AT	3	6	26054	26059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_013721	TA	3	6	26074	26079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_013721	AT	3	6	26227	26232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_013721	ACT	2	6	26285	26290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782540
554	NC_013721	GCT	2	6	26384	26389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782540
555	NC_013721	TCG	2	6	26398	26403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782540
556	NC_013721	AGC	2	6	26499	26504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782540
557	NC_013721	TTG	2	6	26516	26521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782540
558	NC_013721	CGG	2	6	26620	26625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283782540
559	NC_013721	GTC	2	6	26631	26636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782540
560	NC_013721	AGC	2	6	26721	26726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782540
561	NC_013721	TGA	2	6	26731	26736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782540
562	NC_013721	GGT	2	6	26831	26836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283782540
563	NC_013721	CAA	2	6	26995	27000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782540
564	NC_013721	GCA	2	6	27035	27040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782540
565	NC_013721	AGA	2	6	27067	27072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782540
566	NC_013721	AGC	2	6	27105	27110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782540
567	NC_013721	CTT	2	6	27115	27120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782540
568	NC_013721	GCT	2	6	27125	27130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782540
569	NC_013721	ATG	2	6	27138	27143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782540
570	NC_013721	CAAG	2	8	27195	27202	50 %	0 %	25 %	25 %	283782540
571	NC_013721	CAC	2	6	27307	27312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283782540
572	NC_013721	GCCA	2	8	27367	27374	25 %	0 %	25 %	50 %	283782540
573	NC_013721	GCCAC	2	10	27394	27403	20 %	0 %	20 %	60 %	283782540
574	NC_013721	GCGCAT	2	12	27481	27492	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	283782540
575	NC_013721	CTAC	2	8	27549	27556	25 %	25 %	0 %	50 %	283782540
576	NC_013721	GTT	2	6	27598	27603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782540
577	NC_013721	CTC	2	6	27675	27680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283782540
578	NC_013721	TTA	2	6	27720	27725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782540
579	NC_013721	GAC	2	6	27794	27799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782540
580	NC_013721	CGTT	2	8	27804	27811	0 %	50 %	25 %	25 %	283782540
581	NC_013721	AAG	2	6	27812	27817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782540
582	NC_013721	AAG	2	6	27830	27835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782540
583	NC_013721	TCC	2	6	27957	27962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283782540
584	NC_013721	TTC	2	6	28034	28039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782540
585	NC_013721	GCTAT	2	10	28059	28068	20 %	40 %	20 %	20 %	283782540
586	NC_013721	TCA	2	6	28089	28094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782540
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588	NC_013721	TTC	2	6	28151	28156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782540
589	NC_013721	CCA	2	6	28157	28162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283782540
590	NC_013721	ACA	2	6	28167	28172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782540
591	NC_013721	CTT	2	6	28345	28350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782540
592	NC_013721	CGG	2	6	28408	28413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283782540
593	NC_013721	CTG	2	6	28452	28457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782540
594	NC_013721	CTTCT	2	10	28663	28672	0 %	60 %	0 %	40 %	283782540
595	NC_013721	ACA	2	6	28862	28867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_013721	CGG	2	6	28956	28961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283782541
597	NC_013721	CTT	2	6	28977	28982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782541
598	NC_013721	TCT	2	6	28985	28990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782541
599	NC_013721	GAA	2	6	29015	29020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782541
600	NC_013721	TCC	2	6	29036	29041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283782541
601	NC_013721	TGC	2	6	29063	29068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782541
602	NC_013721	GCA	2	6	29084	29089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782541
603	NC_013721	ATG	2	6	29156	29161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782541
604	NC_013721	CAA	2	6	29198	29203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_013721	TAA	2	6	29225	29230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_013721	TTC	2	6	29246	29251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_013721	T	6	6	29263	29268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_013721	AAT	2	6	29270	29275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_013721	ATA	2	6	29350	29355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782542
610	NC_013721	ATT	3	9	29449	29457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782542
611	NC_013721	TAA	2	6	29464	29469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782542
612	NC_013721	TTC	2	6	29482	29487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782542
613	NC_013721	TGTT	2	8	29530	29537	0 %	75 %	25 %	0 %	283782542
614	NC_013721	TTC	2	6	29562	29567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782542
615	NC_013721	TTC	2	6	29610	29615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782542
616	NC_013721	T	6	6	29628	29633	0 %	100 %	0 %	0 %	283782542
617	NC_013721	TAA	2	6	29696	29701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782542
618	NC_013721	TCG	2	6	29707	29712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782542
619	NC_013721	TAT	2	6	29735	29740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782542
620	NC_013721	ATT	2	6	29802	29807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782542
621	NC_013721	ATT	2	6	29835	29840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782542
622	NC_013721	CA	3	6	29863	29868	50 %	0 %	0 %	50 %	283782542
623	NC_013721	GCA	2	6	29898	29903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782542
624	NC_013721	A	6	6	29931	29936	100 %	0 %	0 %	0 %	283782542
625	NC_013721	TGTTT	2	10	30004	30013	0 %	80 %	20 %	0 %	283782542
626	NC_013721	TTA	2	6	30025	30030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_013721	AC	3	6	30035	30040	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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629	NC_013721	T	6	6	30148	30153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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878	NC_013721	TTC	2	6	41215	41220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782551
879	NC_013721	TAC	2	6	41232	41237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782551
880	NC_013721	TCA	2	6	41238	41243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782551
881	NC_013721	CA	3	6	41274	41279	50 %	0 %	0 %	50 %	283782551
882	NC_013721	AAG	2	6	41293	41298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782551
883	NC_013721	AAC	2	6	41377	41382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782551
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