MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gardnerella vaginalis 409-05 chromosome

Total Repeats: 34316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013721	TTTC	2	8	253247	253254	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5502	NC_013721	AGGA	2	8	253270	253277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_013721	TGC	2	6	253459	253464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782733
5504	NC_013721	GCT	2	6	253547	253552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782733
5505	NC_013721	AGC	2	6	253644	253649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782733
5506	NC_013721	GC	3	6	253695	253700	0 %	0 %	50 %	50 %	283782733
5507	NC_013721	CCAA	2	8	253745	253752	50 %	0 %	0 %	50 %	283782733
5508	NC_013721	TGC	2	6	253818	253823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_013721	ACCA	2	8	253829	253836	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5510	NC_013721	CTT	2	6	253926	253931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782734
5511	NC_013721	CT	3	6	253962	253967	0 %	50 %	0 %	50 %	283782734
5512	NC_013721	GCT	3	9	254007	254015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782734
5513	NC_013721	GCT	2	6	254034	254039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782734
5514	NC_013721	GCT	3	9	254043	254051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782734
5515	NC_013721	TGC	2	6	254054	254059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782734
5516	NC_013721	CGT	2	6	254084	254089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782734
5517	NC_013721	GCT	2	6	254097	254102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782734
5518	NC_013721	AAG	2	6	254109	254114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782734
5519	NC_013721	TCA	2	6	254122	254127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782734
5520	NC_013721	CTTGG	2	10	254151	254160	0 %	40 %	40 %	20 %	283782734
5521	NC_013721	AAG	2	6	254214	254219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782734
5522	NC_013721	AAGGCT	2	12	254232	254243	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	283782734
5523	NC_013721	AGT	2	6	254278	254283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782734
5524	NC_013721	TTG	2	6	254293	254298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_013721	TGCG	2	8	254321	254328	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5526	NC_013721	ATT	2	6	254354	254359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_013721	GCC	2	6	254363	254368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5528	NC_013721	T	6	6	254369	254374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_013721	CG	3	6	254418	254423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5530	NC_013721	TGA	2	6	254438	254443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_013721	AAG	2	6	254457	254462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_013721	AAG	2	6	254469	254474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_013721	AAG	2	6	254484	254489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_013721	GAA	2	6	254498	254503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_013721	GCT	2	6	254505	254510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_013721	TGC	2	6	254528	254533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_013721	GCT	2	6	254544	254549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_013721	TGC	2	6	254552	254557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_013721	TGCT	2	8	254563	254570	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5540	NC_013721	TGC	2	6	254579	254584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_013721	TGA	2	6	254624	254629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_013721	A	6	6	254730	254735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_013721	AATT	2	8	254780	254787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_013721	GTTTGC	2	12	254789	254800	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5545	NC_013721	TTG	2	6	254801	254806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_013721	T	6	6	254827	254832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_013721	GTT	2	6	254879	254884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_013721	TTC	2	6	254936	254941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_013721	ATT	2	6	254982	254987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_013721	AATATG	2	12	255052	255063	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_013721	CAA	2	6	255085	255090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_013721	AGTA	2	8	255125	255132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_013721	GT	3	6	255133	255138	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_013721	T	6	6	255138	255143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_013721	GTGA	2	8	255160	255167	25 %	25 %	50 %	0 %	283782735
5556	NC_013721	GAT	2	6	255189	255194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782735
5557	NC_013721	TGG	2	6	255201	255206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283782735
5558	NC_013721	CG	4	8	255288	255295	0 %	0 %	50 %	50 %	283782735
5559	NC_013721	ATA	2	6	255308	255313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782735
5560	NC_013721	GCT	2	6	255339	255344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782735
5561	NC_013721	CAA	2	6	255368	255373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782735
5562	NC_013721	TGC	2	6	255428	255433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782735
5563	NC_013721	AGA	3	9	255519	255527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782735
5564	NC_013721	CTG	2	6	255530	255535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782735
5565	NC_013721	ATG	2	6	255593	255598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782735
5566	NC_013721	GC	3	6	255642	255647	0 %	0 %	50 %	50 %	283782735
5567	NC_013721	ATG	2	6	255737	255742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782735
5568	NC_013721	CAAT	2	8	255764	255771	50 %	25 %	0 %	25 %	283782735
5569	NC_013721	ATG	2	6	255773	255778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782735
5570	NC_013721	CAG	2	6	255802	255807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782735
5571	NC_013721	ATTT	2	8	255830	255837	25 %	75 %	0 %	0 %	283782735
5572	NC_013721	AGA	2	6	255876	255881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782735
5573	NC_013721	CAA	2	6	255889	255894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782735
5574	NC_013721	TTC	2	6	255906	255911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782735
5575	NC_013721	AT	3	6	255983	255988	50 %	50 %	0 %	0 %	283782735
5576	NC_013721	TAA	2	6	256098	256103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782735
5577	NC_013721	TAC	2	6	256140	256145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782735
5578	NC_013721	TAA	2	6	256158	256163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782735
5579	NC_013721	AC	3	6	256193	256198	50 %	0 %	0 %	50 %	283782735
5580	NC_013721	CGG	2	6	256275	256280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283782735
5581	NC_013721	GAA	2	6	256300	256305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782735
5582	NC_013721	AGT	2	6	256306	256311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782735
5583	NC_013721	ATG	2	6	256385	256390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782735
5584	NC_013721	TGC	2	6	256434	256439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782735
5585	NC_013721	CTAG	2	8	256441	256448	25 %	25 %	25 %	25 %	283782735
5586	NC_013721	AGT	2	6	256495	256500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_013721	ACAA	2	8	256521	256528	75 %	0 %	0 %	25 %	283782736
5588	NC_013721	AGT	2	6	256568	256573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782736
5589	NC_013721	TAC	2	6	256580	256585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782736
5590	NC_013721	ACA	2	6	256652	256657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782736
5591	NC_013721	AGC	2	6	256672	256677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782736
5592	NC_013721	AGA	2	6	256709	256714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782736
5593	NC_013721	TGC	2	6	256727	256732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782736
5594	NC_013721	GCT	2	6	256836	256841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782736
5595	NC_013721	CTTT	2	8	256908	256915	0 %	75 %	0 %	25 %	283782736
5596	NC_013721	GTT	2	6	256977	256982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782736
5597	NC_013721	TATT	2	8	257015	257022	25 %	75 %	0 %	0 %	283782736
5598	NC_013721	GTG	2	6	257074	257079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283782736
5599	NC_013721	AAGC	2	8	257166	257173	50 %	0 %	25 %	25 %	283782736
5600	NC_013721	GCT	2	6	257221	257226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782736
5601	NC_013721	ATT	2	6	257268	257273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782736
5602	NC_013721	GAT	2	6	257306	257311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782736
5603	NC_013721	TGGC	2	8	257320	257327	0 %	25 %	50 %	25 %	283782736
5604	NC_013721	GAT	2	6	257328	257333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782736
5605	NC_013721	TTG	2	6	257452	257457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782736
5606	NC_013721	TGC	3	9	257513	257521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782736
5607	NC_013721	TGT	2	6	257557	257562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782736
5608	NC_013721	TGT	2	6	257573	257578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782736
5609	NC_013721	AGC	2	6	257581	257586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782736
5610	NC_013721	CATTAG	2	12	257629	257640	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	283782736
5611	NC_013721	GCA	2	6	257688	257693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782736
5612	NC_013721	GTTG	2	8	257747	257754	0 %	50 %	50 %	0 %	283782736
5613	NC_013721	GCA	2	6	257847	257852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782736
5614	NC_013721	A	6	6	257943	257948	100 %	0 %	0 %	0 %	283782736
5615	NC_013721	CCA	2	6	257951	257956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283782736
5616	NC_013721	CTT	2	6	258069	258074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782736
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5618	NC_013721	CAA	2	6	258139	258144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782736
5619	NC_013721	GTC	2	6	258160	258165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782736
5620	NC_013721	CAT	2	6	258315	258320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782736
5621	NC_013721	GC	3	6	258330	258335	0 %	0 %	50 %	50 %	283782736
5622	NC_013721	GAT	2	6	258363	258368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782736
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5624	NC_013721	GCA	2	6	258395	258400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782736
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