MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gardnerella vaginalis 409-05 chromosome

Total Repeats: 34316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013721	CAAT	2	8	231006	231013	50 %	25 %	0 %	25 %	283782715
5002	NC_013721	TCT	2	6	231092	231097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782715
5003	NC_013721	ATG	2	6	231118	231123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782715
5004	NC_013721	AGAA	2	8	231135	231142	75 %	0 %	25 %	0 %	283782715
5005	NC_013721	A	6	6	231162	231167	100 %	0 %	0 %	0 %	283782715
5006	NC_013721	T	6	6	231191	231196	0 %	100 %	0 %	0 %	283782715
5007	NC_013721	AAT	2	6	231223	231228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_013721	AGG	2	6	231233	231238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_013721	ATT	2	6	231329	231334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782716
5010	NC_013721	TATT	2	8	231336	231343	25 %	75 %	0 %	0 %	283782716
5011	NC_013721	TGC	2	6	231346	231351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782716
5012	NC_013721	GTT	2	6	231356	231361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782716
5013	NC_013721	ATT	2	6	231364	231369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782716
5014	NC_013721	AGC	2	6	231398	231403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782716
5015	NC_013721	TGC	2	6	231499	231504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782716
5016	NC_013721	AGTG	2	8	231592	231599	25 %	25 %	50 %	0 %	283782716
5017	NC_013721	GTC	2	6	231631	231636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782716
5018	NC_013721	AAG	2	6	231702	231707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782716
5019	NC_013721	TGC	2	6	231742	231747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782716
5020	NC_013721	GAG	2	6	231777	231782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283782716
5021	NC_013721	ACTA	2	8	231812	231819	50 %	25 %	0 %	25 %	283782716
5022	NC_013721	CAA	2	6	231847	231852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782716
5023	NC_013721	AT	3	6	231946	231951	50 %	50 %	0 %	0 %	283782716
5024	NC_013721	CTC	2	6	231969	231974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283782716
5025	NC_013721	GTTA	2	8	231983	231990	25 %	50 %	25 %	0 %	283782716
5026	NC_013721	ACA	2	6	231993	231998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782716
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5028	NC_013721	GAT	2	6	232058	232063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782716
5029	NC_013721	TCGT	2	8	232064	232071	0 %	50 %	25 %	25 %	283782716
5030	NC_013721	CTT	2	6	232218	232223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782716
5031	NC_013721	TTC	2	6	232267	232272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782716
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5033	NC_013721	ATT	2	6	232289	232294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782716
5034	NC_013721	CAA	2	6	232331	232336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782716
5035	NC_013721	GAA	2	6	232422	232427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782716
5036	NC_013721	TAG	2	6	232563	232568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782716
5037	NC_013721	GAA	2	6	232691	232696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782716
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5039	NC_013721	TGGC	2	8	232804	232811	0 %	25 %	50 %	25 %	283782716
5040	NC_013721	AGGC	2	8	232890	232897	25 %	0 %	50 %	25 %	283782716
5041	NC_013721	AGGA	2	8	232932	232939	50 %	0 %	50 %	0 %	283782716
5042	NC_013721	AAT	2	6	233018	233023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782716
5043	NC_013721	TAA	2	6	233038	233043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782716
5044	NC_013721	ACG	2	6	233196	233201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782716
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5048	NC_013721	TGA	2	6	233350	233355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782716
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5052	NC_013721	TA	3	6	233477	233482	50 %	50 %	0 %	0 %	283782716
5053	NC_013721	TGC	2	6	233527	233532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782716
5054	NC_013721	ATT	2	6	233546	233551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782716
5055	NC_013721	GAAT	2	8	233647	233654	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_013721	CGAA	2	8	233706	233713	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5057	NC_013721	ATC	2	6	233755	233760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_013721	TAC	2	6	233782	233787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_013721	ACA	2	6	233803	233808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_013721	TTA	2	6	233869	233874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782717
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5063	NC_013721	CAA	2	6	233951	233956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782717
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5082	NC_013721	AAC	2	6	234601	234606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_013721	AAT	2	6	234688	234693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_013721	GTAAT	2	10	234699	234708	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5091	NC_013721	ATTGG	2	10	235032	235041	20 %	40 %	40 %	0 %	283782718
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5102	NC_013721	AAG	2	6	235665	235670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782719
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5107	NC_013721	TCG	3	9	235829	235837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782719
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5110	NC_013721	TTC	2	6	235947	235952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_013721	AAT	2	6	236059	236064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_013721	A	6	6	236067	236072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_013721	GAT	2	6	236103	236108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_013721	A	6	6	236124	236129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_013721	TAA	2	6	236189	236194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_013721	GTC	2	6	236201	236206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_013721	TTA	2	6	236211	236216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_013721	GTTG	2	8	236222	236229	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_013721	AGG	2	6	236248	236253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_013721	TACGC	2	10	236321	236330	20 %	20 %	20 %	40 %	283782720
5121	NC_013721	AGCA	2	8	236353	236360	50 %	0 %	25 %	25 %	283782720
5122	NC_013721	CGA	3	9	236407	236415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782720
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5125	NC_013721	A	6	6	236476	236481	100 %	0 %	0 %	0 %	283782720
5126	NC_013721	TGC	2	6	236486	236491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782720
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5238	NC_013721	AGC	2	6	241879	241884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782723
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5240	NC_013721	AGC	2	6	241925	241930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782723
5241	NC_013721	AAAC	2	8	241970	241977	75 %	0 %	0 %	25 %	283782723
5242	NC_013721	GAT	2	6	242046	242051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782723
5243	NC_013721	TGC	4	12	242088	242099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782723
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5245	NC_013721	ACGC	2	8	242136	242143	25 %	0 %	25 %	50 %	283782723
5246	NC_013721	TGC	2	6	242193	242198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782723
5247	NC_013721	AGG	2	6	242204	242209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283782723
5248	NC_013721	AAAG	2	8	242217	242224	75 %	0 %	25 %	0 %	283782723
5249	NC_013721	GAAAGA	2	12	242247	242258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782723
5250	NC_013721	AGC	2	6	242262	242267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782723
5251	NC_013721	GAA	2	6	242272	242277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782723
5252	NC_013721	TCA	2	6	242310	242315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782723
5253	NC_013721	GCT	2	6	242365	242370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782723
5254	NC_013721	AGG	2	6	242393	242398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283782723
5255	NC_013721	GCAGC	2	10	242428	242437	20 %	0 %	40 %	40 %	283782723
5256	NC_013721	GAC	2	6	242454	242459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782723
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5258	NC_013721	GATTT	2	10	242546	242555	20 %	60 %	20 %	0 %	283782723
5259	NC_013721	CAA	2	6	242566	242571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782723
5260	NC_013721	CAA	2	6	242575	242580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782723
5261	NC_013721	TCG	2	6	242611	242616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782723
5262	NC_013721	TCT	2	6	242626	242631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782723
5263	NC_013721	GAA	2	6	242683	242688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782723
5264	NC_013721	AAG	2	6	242702	242707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782723
5265	NC_013721	AATA	2	8	242794	242801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5266	NC_013721	AAAT	2	8	242806	242813	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5267	NC_013721	TGA	2	6	242865	242870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782724
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5269	NC_013721	CG	3	6	242961	242966	0 %	0 %	50 %	50 %	283782724
5270	NC_013721	GC	3	6	242980	242985	0 %	0 %	50 %	50 %	283782724
5271	NC_013721	CGT	2	6	242995	243000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782724
5272	NC_013721	TTG	2	6	243011	243016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782724
5273	NC_013721	GCTG	2	8	243056	243063	0 %	25 %	50 %	25 %	283782724
5274	NC_013721	GAA	2	6	243096	243101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782724
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5279	NC_013721	TTG	2	6	243244	243249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782724
5280	NC_013721	AAG	2	6	243301	243306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782724
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5282	NC_013721	TGCG	2	8	243380	243387	0 %	25 %	50 %	25 %	283782724
5283	NC_013721	CTG	2	6	243398	243403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782724
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5286	NC_013721	CTG	2	6	243458	243463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782724
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5299	NC_013721	CGG	2	6	244260	244265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5300	NC_013721	CCA	2	6	244302	244307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5301	NC_013721	TC	3	6	244320	244325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5302	NC_013721	CACC	2	8	244330	244337	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5303	NC_013721	AGC	2	6	244391	244396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782725
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5313	NC_013721	TTG	2	6	244652	244657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782725
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5319	NC_013721	GCT	2	6	245078	245083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782725
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5321	NC_013721	ATC	2	6	245120	245125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782725
5322	NC_013721	TGTGC	2	10	245137	245146	0 %	40 %	40 %	20 %	283782725
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5330	NC_013721	AATT	2	8	245585	245592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5331	NC_013721	GCC	2	6	245623	245628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5332	NC_013721	GT	3	6	245660	245665	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5333	NC_013721	TAA	2	6	245696	245701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782726
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5339	NC_013721	CTT	2	6	245943	245948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782726
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5350	NC_013721	T	6	6	246410	246415	0 %	100 %	0 %	0 %	283782727
5351	NC_013721	TAA	2	6	246435	246440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782727
5352	NC_013721	ACGA	2	8	246451	246458	50 %	0 %	25 %	25 %	283782727
5353	NC_013721	TGT	2	6	246459	246464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782727
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5357	NC_013721	TTG	2	6	246635	246640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782727
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5359	NC_013721	GCT	2	6	246724	246729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782727
5360	NC_013721	ACG	2	6	246734	246739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782727
5361	NC_013721	TTG	2	6	246749	246754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782727
5362	NC_013721	GC	3	6	246756	246761	0 %	0 %	50 %	50 %	283782727
5363	NC_013721	CTG	2	6	246830	246835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782727
5364	NC_013721	TTC	2	6	246854	246859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782727
5365	NC_013721	TAA	2	6	247008	247013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5366	NC_013721	A	7	7	247012	247018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5367	NC_013721	ATTA	2	8	247026	247033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5368	NC_013721	TGG	2	6	247080	247085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283782728
5369	NC_013721	TTC	2	6	247098	247103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782728
5370	NC_013721	GAAAG	2	10	247106	247115	60 %	0 %	40 %	0 %	283782728
5371	NC_013721	TGC	2	6	247196	247201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782728
5372	NC_013721	GGC	2	6	247202	247207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283782728
5373	NC_013721	TG	3	6	247222	247227	0 %	50 %	50 %	0 %	283782728
5374	NC_013721	CTGCT	2	10	247232	247241	0 %	40 %	20 %	40 %	283782728
5375	NC_013721	CTG	2	6	247258	247263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782728
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5434	NC_013721	GAC	2	6	250197	250202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782730
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5438	NC_013721	AAAGC	2	10	250425	250434	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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5441	NC_013721	GC	3	6	250639	250644	0 %	0 %	50 %	50 %	283782731
5442	NC_013721	CTT	2	6	250662	250667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782731
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5454	NC_013721	GTT	2	6	251315	251320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5458	NC_013721	TTC	2	6	251506	251511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782732
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5471	NC_013721	TTACTT	2	12	251954	251965	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	283782732
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5487	NC_013721	TTG	4	12	252638	252649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782732
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5491	NC_013721	AAG	2	6	252805	252810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782732
5492	NC_013721	CTTG	2	8	252858	252865	0 %	50 %	25 %	25 %	283782732
5493	NC_013721	TGCTG	2	10	252879	252888	0 %	40 %	40 %	20 %	283782732
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5496	NC_013721	T	6	6	252998	253003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5499	NC_013721	T	7	7	253212	253218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5500	NC_013721	TTAA	2	8	253229	253236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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