MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Geobacillus sp. WCH70 plasmid pWCH7002

Total Repeats: 253

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012790	T	6	6	10	15	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012790	AGG	2	6	115	120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239812974
3	NC_012790	ACA	2	6	134	139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239812974
4	NC_012790	TTGTG	2	10	148	157	0 %	60 %	40 %	0 %	239812974
5	NC_012790	GTT	2	6	178	183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239812974
6	NC_012790	T	8	8	200	207	0 %	100 %	0 %	0 %	239812974
7	NC_012790	A	7	7	213	219	100 %	0 %	0 %	0 %	239812974
8	NC_012790	A	6	6	335	340	100 %	0 %	0 %	0 %	239812975
9	NC_012790	TGT	2	6	361	366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239812975
10	NC_012790	TGT	2	6	376	381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239812975
11	NC_012790	AT	3	6	403	408	50 %	50 %	0 %	0 %	239812975
12	NC_012790	A	6	6	463	468	100 %	0 %	0 %	0 %	239812975
13	NC_012790	ATC	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239812975
14	NC_012790	GGA	2	6	518	523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239812975
15	NC_012790	GAT	3	9	543	551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239812975
16	NC_012790	GTT	2	6	554	559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239812975
17	NC_012790	A	7	7	626	632	100 %	0 %	0 %	0 %	239812975
18	NC_012790	CAA	2	6	774	779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239812975
19	NC_012790	TTCAA	2	10	808	817	40 %	40 %	0 %	20 %	239812975
20	NC_012790	TA	3	6	940	945	50 %	50 %	0 %	0 %	239812976
21	NC_012790	A	6	6	956	961	100 %	0 %	0 %	0 %	239812976
22	NC_012790	T	6	6	968	973	0 %	100 %	0 %	0 %	239812976
23	NC_012790	GAAAAT	2	12	981	992	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	239812976
24	NC_012790	A	6	6	1006	1011	100 %	0 %	0 %	0 %	239812976
25	NC_012790	GCAAT	2	10	1060	1069	40 %	20 %	20 %	20 %	239812976
26	NC_012790	A	7	7	1205	1211	100 %	0 %	0 %	0 %	239812976
27	NC_012790	AGA	2	6	1214	1219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812976
28	NC_012790	A	6	6	1237	1242	100 %	0 %	0 %	0 %	239812976
29	NC_012790	ATT	2	6	1260	1265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239812976
30	NC_012790	ATTTG	2	10	1285	1294	20 %	60 %	20 %	0 %	239812976
31	NC_012790	ATAC	2	8	1432	1439	50 %	25 %	0 %	25 %	239812976
32	NC_012790	GAA	2	6	1553	1558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812976
33	NC_012790	A	6	6	1557	1562	100 %	0 %	0 %	0 %	239812976
34	NC_012790	A	6	6	1585	1590	100 %	0 %	0 %	0 %	239812976
35	NC_012790	GGAAA	2	10	1594	1603	60 %	0 %	40 %	0 %	239812976
36	NC_012790	TTCCG	2	10	1610	1619	0 %	40 %	20 %	40 %	239812976
37	NC_012790	ATG	2	6	1713	1718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239812976
38	NC_012790	CAG	2	6	1770	1775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239812976
39	NC_012790	AAG	2	6	1813	1818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812976
40	NC_012790	AAAAC	2	10	1878	1887	80 %	0 %	0 %	20 %	239812976
41	NC_012790	GAA	2	6	1938	1943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812976
42	NC_012790	GA	3	6	2003	2008	50 %	0 %	50 %	0 %	239812976
43	NC_012790	GAA	2	6	2014	2019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812976
44	NC_012790	ACG	2	6	2036	2041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239812976
45	NC_012790	ACA	2	6	2054	2059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239812976
46	NC_012790	GAT	2	6	2073	2078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239812976
47	NC_012790	TTAAA	2	10	2086	2095	60 %	40 %	0 %	0 %	239812976
48	NC_012790	TAT	2	6	2221	2226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012790	TAA	2	6	2227	2232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012790	ATA	2	6	2233	2238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012790	T	6	6	2276	2281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012790	TAT	2	6	2321	2326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012790	TAA	2	6	2327	2332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012790	ATA	2	6	2333	2338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012790	T	6	6	2376	2381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012790	TAT	2	6	2421	2426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012790	TAA	2	6	2427	2432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012790	ATA	2	6	2433	2438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012790	T	6	6	2476	2481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012790	TAT	2	6	2521	2526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012790	TAA	2	6	2527	2532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012790	ATA	2	6	2533	2538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012790	T	6	6	2576	2581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012790	TAT	2	6	2621	2626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012790	TAA	2	6	2627	2632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012790	ATA	2	6	2633	2638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012790	T	6	6	2676	2681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012790	TAT	2	6	2721	2726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012790	TAA	2	6	2727	2732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012790	ATA	2	6	2733	2738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012790	T	6	6	2786	2791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012790	TTG	2	6	2794	2799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012790	CT	4	8	2834	2841	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_012790	TTA	2	6	2907	2912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239812977
75	NC_012790	T	6	6	2930	2935	0 %	100 %	0 %	0 %	239812977
76	NC_012790	AT	3	6	2982	2987	50 %	50 %	0 %	0 %	239812977
77	NC_012790	TAT	2	6	3067	3072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239812977
78	NC_012790	AAG	2	6	3099	3104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812977
79	NC_012790	GAA	2	6	3122	3127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812977
80	NC_012790	TGA	2	6	3135	3140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239812977
81	NC_012790	AGG	2	6	3142	3147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239812977
82	NC_012790	CAG	2	6	3171	3176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239812977
83	NC_012790	AGGC	2	8	3182	3189	25 %	0 %	50 %	25 %	239812977
84	NC_012790	GCT	2	6	3293	3298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239812977
85	NC_012790	GGA	3	9	3349	3357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239812977
86	NC_012790	ATG	2	6	3405	3410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239812977
87	NC_012790	A	6	6	3453	3458	100 %	0 %	0 %	0 %	239812977
88	NC_012790	ATT	2	6	3473	3478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239812977
89	NC_012790	CAT	2	6	3605	3610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239812977
90	NC_012790	GA	3	6	3676	3681	50 %	0 %	50 %	0 %	239812977
91	NC_012790	GAA	2	6	3698	3703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812977
92	NC_012790	CGT	2	6	3764	3769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239812977
93	NC_012790	TAA	2	6	3778	3783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239812977
94	NC_012790	GAA	2	6	3866	3871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812977
95	NC_012790	TCC	2	6	3892	3897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239812977
96	NC_012790	CAA	2	6	3926	3931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239812977
97	NC_012790	CGGTTC	2	12	3951	3962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239812977
98	NC_012790	A	6	6	4035	4040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012790	TC	3	6	4047	4052	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_012790	T	7	7	4078	4084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012790	GTT	2	6	4094	4099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012790	AAAG	2	8	4120	4127	75 %	0 %	25 %	0 %	239812978
103	NC_012790	GATT	2	8	4160	4167	25 %	50 %	25 %	0 %	239812978
104	NC_012790	GAAA	2	8	4200	4207	75 %	0 %	25 %	0 %	239812978
105	NC_012790	GAA	2	6	4210	4215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812978
106	NC_012790	A	7	7	4214	4220	100 %	0 %	0 %	0 %	239812978
107	NC_012790	CGTT	2	8	4276	4283	0 %	50 %	25 %	25 %	239812978
108	NC_012790	ATT	2	6	4327	4332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239812978
109	NC_012790	TGC	2	6	4353	4358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239812978
110	NC_012790	GATT	2	8	4407	4414	25 %	50 %	25 %	0 %	239812978
111	NC_012790	ATT	2	6	4417	4422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239812978
112	NC_012790	A	6	6	4444	4449	100 %	0 %	0 %	0 %	239812978
113	NC_012790	CCT	2	6	4465	4470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239812978
114	NC_012790	AGA	2	6	4572	4577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812978
115	NC_012790	ATT	2	6	4580	4585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239812978
116	NC_012790	CGG	2	6	4619	4624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239812978
117	NC_012790	CTG	2	6	4700	4705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239812978
118	NC_012790	GAT	2	6	4765	4770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239812978
119	NC_012790	GCT	2	6	4839	4844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239812978
120	NC_012790	CTG	2	6	4874	4879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239812978
121	NC_012790	T	6	6	4920	4925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012790	TTG	2	6	4979	4984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012790	T	6	6	4997	5002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012790	TTC	2	6	5006	5011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_012790	TAAAAA	2	12	5042	5053	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012790	AAG	3	9	5074	5082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012790	TTC	3	9	5088	5096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_012790	AGA	2	6	5322	5327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012790	AATG	2	8	5329	5336	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012790	T	7	7	5351	5357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012790	TCA	2	6	5364	5369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_012790	ATTTT	2	10	5402	5411	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012790	T	6	6	5408	5413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012790	T	6	6	5473	5478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012790	T	6	6	5480	5485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012790	T	6	6	5506	5511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012790	T	7	7	5513	5519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012790	CT	3	6	5541	5546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_012790	T	7	7	5546	5552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012790	T	8	8	5570	5577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012790	TAT	2	6	5628	5633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012790	TAA	2	6	5634	5639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012790	ATA	2	6	5640	5645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012790	T	6	6	5683	5688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.