MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5 plasmid pGDIA01

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011367	CT	3	6	1726	1731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011367	CA	3	6	2093	2098	50 %	0 %	0 %	50 %	209542160
3	NC_011367	GC	3	6	2156	2161	0 %	0 %	50 %	50 %	209542160
4	NC_011367	CG	3	6	2290	2295	0 %	0 %	50 %	50 %	209542160
5	NC_011367	GC	3	6	3077	3082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011367	GC	3	6	3344	3349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011367	CG	3	6	3352	3357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011367	GC	4	8	4403	4410	0 %	0 %	50 %	50 %	209542163
9	NC_011367	TC	3	6	5199	5204	0 %	50 %	0 %	50 %	209542165
10	NC_011367	CG	3	6	5537	5542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011367	GC	3	6	5834	5839	0 %	0 %	50 %	50 %	209542166
12	NC_011367	CT	3	6	5881	5886	0 %	50 %	0 %	50 %	209542166
13	NC_011367	CT	3	6	5952	5957	0 %	50 %	0 %	50 %	209542166
14	NC_011367	AG	3	6	6640	6645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011367	AT	3	6	6671	6676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011367	GC	3	6	6739	6744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011367	AT	3	6	6921	6926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011367	TC	3	6	7961	7966	0 %	50 %	0 %	50 %	209542167
19	NC_011367	TC	3	6	8583	8588	0 %	50 %	0 %	50 %	209542168
20	NC_011367	GA	3	6	9488	9493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011367	GA	3	6	10387	10392	50 %	0 %	50 %	0 %	209542169
22	NC_011367	AT	3	6	13850	13855	50 %	50 %	0 %	0 %	209542172
23	NC_011367	GC	3	6	14070	14075	0 %	0 %	50 %	50 %	209542172
24	NC_011367	AT	3	6	14508	14513	50 %	50 %	0 %	0 %	209542172
25	NC_011367	GA	3	6	14906	14911	50 %	0 %	50 %	0 %	209542173
26	NC_011367	CG	3	6	15151	15156	0 %	0 %	50 %	50 %	209542173
27	NC_011367	AG	3	6	16414	16419	50 %	0 %	50 %	0 %	209542173
28	NC_011367	CA	3	6	17491	17496	50 %	0 %	0 %	50 %	209542174
29	NC_011367	CG	3	6	17735	17740	0 %	0 %	50 %	50 %	209542174
30	NC_011367	CG	3	6	17846	17851	0 %	0 %	50 %	50 %	209542174
31	NC_011367	CG	5	10	17864	17873	0 %	0 %	50 %	50 %	209542174
32	NC_011367	AT	3	6	18597	18602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011367	CG	3	6	18656	18661	0 %	0 %	50 %	50 %	209542177
34	NC_011367	CG	3	6	19508	19513	0 %	0 %	50 %	50 %	209542177
35	NC_011367	CG	3	6	20196	20201	0 %	0 %	50 %	50 %	209542177
36	NC_011367	CG	3	6	20329	20334	0 %	0 %	50 %	50 %	209542177
37	NC_011367	CG	4	8	20772	20779	0 %	0 %	50 %	50 %	209542177
38	NC_011367	CG	3	6	20992	20997	0 %	0 %	50 %	50 %	209542177
39	NC_011367	CG	3	6	21404	21409	0 %	0 %	50 %	50 %	209542177
40	NC_011367	GC	3	6	21738	21743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011367	CG	3	6	21776	21781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011367	TG	3	6	21803	21808	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011367	TC	3	6	22166	22171	0 %	50 %	0 %	50 %	209542178
44	NC_011367	GC	3	6	22194	22199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011367	GC	3	6	22412	22417	0 %	0 %	50 %	50 %	209542179
46	NC_011367	CG	3	6	22498	22503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_011367	GC	3	6	23464	23469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_011367	GC	3	6	23657	23662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_011367	CG	3	6	23784	23789	0 %	0 %	50 %	50 %	209542181
50	NC_011367	AG	3	6	23926	23931	50 %	0 %	50 %	0 %	209542181
51	NC_011367	GC	4	8	23963	23970	0 %	0 %	50 %	50 %	209542181
52	NC_011367	GA	3	6	24128	24133	50 %	0 %	50 %	0 %	209542181
53	NC_011367	CG	3	6	24299	24304	0 %	0 %	50 %	50 %	209542182
54	NC_011367	GC	3	6	24795	24800	0 %	0 %	50 %	50 %	209542183
55	NC_011367	CG	3	6	26416	26421	0 %	0 %	50 %	50 %	209542186
56	NC_011367	GC	3	6	26733	26738	0 %	0 %	50 %	50 %	209542187

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.