MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5 plasmid pGDIA01

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011367	CTTC	2	8	1121	1128	0 %	50 %	0 %	50 %	209542159
2	NC_011367	CAGA	2	8	1278	1285	50 %	0 %	25 %	25 %	209542159
3	NC_011367	AATA	2	8	1359	1366	75 %	25 %	0 %	0 %	209542159
4	NC_011367	AAAG	2	8	1433	1440	75 %	0 %	25 %	0 %	209542159
5	NC_011367	CGGC	2	8	1757	1764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011367	GCCC	2	8	2709	2716	0 %	0 %	25 %	75 %	209542160
7	NC_011367	TGCG	2	8	3412	3419	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011367	GCCG	2	8	4391	4398	0 %	0 %	50 %	50 %	209542163
9	NC_011367	TGGG	2	8	5309	5316	0 %	25 %	75 %	0 %	209542165
10	NC_011367	CTTG	2	8	5381	5388	0 %	50 %	25 %	25 %	209542165
11	NC_011367	ATTA	2	8	5397	5404	50 %	50 %	0 %	0 %	209542165
12	NC_011367	AACG	2	8	5411	5418	50 %	0 %	25 %	25 %	209542165
13	NC_011367	GCCG	2	8	5991	5998	0 %	0 %	50 %	50 %	209542166
14	NC_011367	CGCC	2	8	6029	6036	0 %	0 %	25 %	75 %	209542166
15	NC_011367	CCCG	2	8	6566	6573	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16	NC_011367	CGAA	2	8	6860	6867	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011367	AGGA	2	8	7752	7759	50 %	0 %	50 %	0 %	209542167
18	NC_011367	AAAG	2	8	7823	7830	75 %	0 %	25 %	0 %	209542167
19	NC_011367	CGAC	2	8	8644	8651	25 %	0 %	25 %	50 %	209542168
20	NC_011367	TCAT	2	8	8845	8852	25 %	50 %	0 %	25 %	209542168
21	NC_011367	TCAA	2	8	8929	8936	50 %	25 %	0 %	25 %	209542168
22	NC_011367	CAAC	2	8	8959	8966	50 %	0 %	0 %	50 %	209542168
23	NC_011367	GAGG	2	8	9021	9028	25 %	0 %	75 %	0 %	209542168
24	NC_011367	TATC	2	8	9563	9570	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011367	TCAA	2	8	9802	9809	50 %	25 %	0 %	25 %	209542169
26	NC_011367	TCCC	2	8	10044	10051	0 %	25 %	0 %	75 %	209542169
27	NC_011367	TCGG	2	8	10314	10321	0 %	25 %	50 %	25 %	209542169
28	NC_011367	ATCA	2	8	10359	10366	50 %	25 %	0 %	25 %	209542169
29	NC_011367	ACAG	2	8	10530	10537	50 %	0 %	25 %	25 %	209542169
30	NC_011367	CGTC	2	8	11446	11453	0 %	25 %	25 %	50 %	209542170
31	NC_011367	GCTG	2	8	12407	12414	0 %	25 %	50 %	25 %	209542171
32	NC_011367	TCGC	2	8	12796	12803	0 %	25 %	25 %	50 %	209542171
33	NC_011367	GTCA	2	8	13246	13253	25 %	25 %	25 %	25 %	209542172
34	NC_011367	GCTC	2	8	13432	13439	0 %	25 %	25 %	50 %	209542172
35	NC_011367	AGTC	2	8	14607	14614	25 %	25 %	25 %	25 %	209542172
36	NC_011367	CCGT	2	8	14850	14857	0 %	25 %	25 %	50 %	209542173
37	NC_011367	TCCT	2	8	15084	15091	0 %	50 %	0 %	50 %	209542173
38	NC_011367	GCAC	2	8	15157	15164	25 %	0 %	25 %	50 %	209542173
39	NC_011367	GATT	2	8	15278	15285	25 %	50 %	25 %	0 %	209542173
40	NC_011367	CGAC	2	8	15382	15389	25 %	0 %	25 %	50 %	209542173
41	NC_011367	CAAC	2	8	15659	15666	50 %	0 %	0 %	50 %	209542173
42	NC_011367	AACG	2	8	15803	15810	50 %	0 %	25 %	25 %	209542173
43	NC_011367	AGCC	2	8	15934	15941	25 %	0 %	25 %	50 %	209542173
44	NC_011367	CGAC	2	8	15949	15956	25 %	0 %	25 %	50 %	209542173
45	NC_011367	CCGA	2	8	16263	16270	25 %	0 %	25 %	50 %	209542173
46	NC_011367	GCCA	2	8	16468	16475	25 %	0 %	25 %	50 %	209542173
47	NC_011367	TTCG	2	8	16800	16807	0 %	50 %	25 %	25 %	209542173
48	NC_011367	TGAT	2	8	16953	16960	25 %	50 %	25 %	0 %	209542173
49	NC_011367	GGTC	2	8	16985	16992	0 %	25 %	50 %	25 %	209542173
50	NC_011367	CCGC	2	8	17141	17148	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_011367	TCAG	2	8	17231	17238	25 %	25 %	25 %	25 %	209542174
52	NC_011367	CCCA	2	8	17411	17418	25 %	0 %	0 %	75 %	209542174
53	NC_011367	CTGG	2	8	17633	17640	0 %	25 %	50 %	25 %	209542174
54	NC_011367	GCTC	2	8	17683	17690	0 %	25 %	25 %	50 %	209542174
55	NC_011367	CCGC	2	8	17821	17828	0 %	0 %	25 %	75 %	209542174
56	NC_011367	ATCT	2	8	17879	17886	25 %	50 %	0 %	25 %	209542174
57	NC_011367	CCGG	2	8	18158	18165	0 %	0 %	50 %	50 %	209542175
58	NC_011367	GGGC	2	8	18267	18274	0 %	0 %	75 %	25 %	209542175
59	NC_011367	CATC	2	8	19100	19107	25 %	25 %	0 %	50 %	209542177
60	NC_011367	CCGG	2	8	19286	19293	0 %	0 %	50 %	50 %	209542177
61	NC_011367	GCCG	2	8	19350	19357	0 %	0 %	50 %	50 %	209542177
62	NC_011367	CGGC	2	8	19754	19761	0 %	0 %	50 %	50 %	209542177
63	NC_011367	CATC	2	8	19796	19803	25 %	25 %	0 %	50 %	209542177
64	NC_011367	TCCG	2	8	20149	20156	0 %	25 %	25 %	50 %	209542177
65	NC_011367	CCCA	2	8	20721	20728	25 %	0 %	0 %	75 %	209542177
66	NC_011367	CAGC	2	8	21188	21195	25 %	0 %	25 %	50 %	209542177
67	NC_011367	GTCC	2	8	21290	21297	0 %	25 %	25 %	50 %	209542177
68	NC_011367	CCGG	2	8	21636	21643	0 %	0 %	50 %	50 %	209542177
69	NC_011367	GAGC	2	8	21893	21900	25 %	0 %	50 %	25 %	209542178
70	NC_011367	CCAG	2	8	23002	23009	25 %	0 %	25 %	50 %	209542180
71	NC_011367	CACG	2	8	23541	23548	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_011367	ACTG	2	8	23850	23857	25 %	25 %	25 %	25 %	209542181
73	NC_011367	GGCT	2	8	24071	24078	0 %	25 %	50 %	25 %	209542181
74	NC_011367	GGCA	2	8	24195	24202	25 %	0 %	50 %	25 %	209542182
75	NC_011367	GCCG	2	8	25170	25177	0 %	0 %	50 %	50 %	209542183
76	NC_011367	CTGC	2	8	25389	25396	0 %	25 %	25 %	50 %	209542184
77	NC_011367	GCCA	2	8	25696	25703	25 %	0 %	25 %	50 %	209542184
78	NC_011367	CCCT	2	8	26168	26175	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_011367	AACA	2	8	26183	26190	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011367	ATCC	2	8	27213	27220	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_011367	CGTC	2	8	27398	27405	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.