MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5 plasmid pGDIA01

Total Repeats: 381

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011367	AGA	2	6	75	80	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011367	ACG	2	6	89	94	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011367	TAA	2	6	162	167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011367	TGG	2	6	229	234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011367	GGC	2	6	275	280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011367	TGG	2	6	351	356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011367	TCC	2	6	485	490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_011367	TAT	2	6	563	568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011367	CCG	2	6	621	626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_011367	GCC	2	6	641	646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_011367	ATC	2	6	778	783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011367	ACC	2	6	846	851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_011367	CTT	2	6	1083	1088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209542159
14	NC_011367	GGA	2	6	1142	1147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209542159
15	NC_011367	AGA	2	6	1298	1303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209542159
16	NC_011367	GAA	2	6	1386	1391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209542159
17	NC_011367	ATC	2	6	1712	1717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011367	TGA	2	6	1831	1836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011367	CAC	2	6	1849	1854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_011367	TCC	2	6	1857	1862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_011367	TCC	2	6	1893	1898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_011367	CTT	2	6	1919	1924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011367	CGG	2	6	1997	2002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011367	TCA	2	6	2046	2051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011367	CTT	2	6	2075	2080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011367	CGG	2	6	2199	2204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542160
27	NC_011367	CTG	2	6	2362	2367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542160
28	NC_011367	CAC	2	6	2428	2433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209542160
29	NC_011367	GCC	2	6	2450	2455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542160
30	NC_011367	ATA	3	9	2492	2500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209542160
31	NC_011367	GCT	2	6	2557	2562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542160
32	NC_011367	CGT	2	6	2577	2582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542160
33	NC_011367	TCG	2	6	2627	2632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542160
34	NC_011367	GAC	2	6	2644	2649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542160
35	NC_011367	GGC	2	6	2650	2655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542160
36	NC_011367	TCG	2	6	2694	2699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542160
37	NC_011367	ACA	2	6	2805	2810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011367	TTC	2	6	2874	2879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011367	CGG	2	6	2991	2996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011367	GGC	2	6	3031	3036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011367	CTT	2	6	3229	3234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011367	CGG	2	6	3258	3263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011367	GCC	2	6	3369	3374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_011367	CGG	2	6	3452	3457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011367	GCA	2	6	3579	3584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542161
46	NC_011367	GCC	2	6	3685	3690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542161
47	NC_011367	ACG	2	6	3746	3751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542161
48	NC_011367	TGC	2	6	3752	3757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542161
49	NC_011367	GCC	2	6	3764	3769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542161
50	NC_011367	GGC	2	6	3912	3917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011367	CAT	2	6	3992	3997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209542162
52	NC_011367	CCG	3	9	4074	4082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542162
53	NC_011367	TCG	2	6	4100	4105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542162
54	NC_011367	CAG	2	6	4144	4149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542162
55	NC_011367	CGC	2	6	4182	4187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542162
56	NC_011367	CAG	2	6	4201	4206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542162
57	NC_011367	GCC	2	6	4249	4254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542162
58	NC_011367	CGG	2	6	4348	4353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542163
59	NC_011367	TTG	2	6	4455	4460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209542163
60	NC_011367	GCC	2	6	4503	4508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542163
61	NC_011367	CTT	2	6	4510	4515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209542163
62	NC_011367	ATA	2	6	4529	4534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209542163
63	NC_011367	GCG	2	6	4683	4688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542164
64	NC_011367	GGC	2	6	4714	4719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542164
65	NC_011367	GCT	2	6	4740	4745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542164
66	NC_011367	GCC	2	6	4800	4805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542164
67	NC_011367	GAC	2	6	5042	5047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011367	AGA	2	6	5173	5178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209542165
69	NC_011367	ATC	2	6	5192	5197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209542165
70	NC_011367	TTG	2	6	5301	5306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209542165
71	NC_011367	AAT	2	6	5331	5336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209542165
72	NC_011367	CAA	2	6	5489	5494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209542165
73	NC_011367	TGT	2	6	5612	5617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209542166
74	NC_011367	TGA	2	6	5654	5659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209542166
75	NC_011367	TTC	2	6	5739	5744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209542166
76	NC_011367	TCA	2	6	5845	5850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209542166
77	NC_011367	CGT	2	6	5856	5861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542166
78	NC_011367	GAT	2	6	5910	5915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209542166
79	NC_011367	TCG	2	6	6146	6151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542166
80	NC_011367	AAT	2	6	6173	6178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011367	TGA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011367	CAT	2	6	6245	6250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011367	GTG	2	6	6373	6378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011367	CTT	2	6	6424	6429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011367	GGC	2	6	6436	6441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011367	CGT	3	9	6615	6623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011367	GCG	2	6	6691	6696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011367	AGG	2	6	6794	6799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011367	TGT	2	6	6970	6975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011367	ATC	2	6	6995	7000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011367	TCT	2	6	7034	7039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011367	GAC	2	6	7049	7054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011367	TGA	2	6	7079	7084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011367	CGA	2	6	7182	7187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542167
95	NC_011367	GGC	2	6	7208	7213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542167
96	NC_011367	GGC	2	6	7294	7299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542167
97	NC_011367	GGC	2	6	7492	7497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542167
98	NC_011367	GCC	3	9	7526	7534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542167
99	NC_011367	GCG	2	6	7554	7559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542167
100	NC_011367	CGT	2	6	7588	7593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542167
101	NC_011367	GCC	2	6	7634	7639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542167
102	NC_011367	CGG	2	6	7656	7661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542167
103	NC_011367	CAG	2	6	7742	7747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542167
104	NC_011367	GAC	2	6	7835	7840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542167
105	NC_011367	GGA	2	6	7870	7875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209542167
106	NC_011367	GAA	2	6	7900	7905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209542167
107	NC_011367	AAG	2	6	7907	7912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209542167
108	NC_011367	GAT	2	6	7981	7986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209542167
109	NC_011367	AAT	2	6	8101	8106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011367	CGG	2	6	8558	8563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542168
111	NC_011367	GGA	2	6	8595	8600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209542168
112	NC_011367	CAA	2	6	8622	8627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209542168
113	NC_011367	GCC	2	6	8697	8702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542168
114	NC_011367	TGG	2	6	8717	8722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209542168
115	NC_011367	AAC	2	6	8724	8729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209542168
116	NC_011367	ACC	2	6	8787	8792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209542168
117	NC_011367	AGC	2	6	8805	8810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542168
118	NC_011367	ATT	2	6	8896	8901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209542168
119	NC_011367	ATT	2	6	8952	8957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209542168
120	NC_011367	ACA	2	6	9043	9048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209542168
121	NC_011367	GAC	2	6	9069	9074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542168
122	NC_011367	ATT	2	6	9105	9110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209542168
123	NC_011367	AGT	2	6	9131	9136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209542168
124	NC_011367	TCG	2	6	9204	9209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542168
125	NC_011367	GCC	2	6	9216	9221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542168
126	NC_011367	GCA	2	6	9378	9383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542168
127	NC_011367	CGG	2	6	9442	9447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542168
128	NC_011367	AAT	2	6	9469	9474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011367	TTA	2	6	9535	9540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011367	TGC	2	6	9589	9594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542169
131	NC_011367	GCT	2	6	9609	9614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209542169
132	NC_011367	GAC	2	6	9626	9631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542169
133	NC_011367	AGC	2	6	9654	9659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542169
134	NC_011367	CGC	2	6	9812	9817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209542169
135	NC_011367	GCG	2	6	9834	9839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209542169
136	NC_011367	CAG	2	6	9848	9853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209542169
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381	NC_011367	CAG	2	6	27351	27356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.