MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Geobacter lovleyi SZ plasmid pGLOV01

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010815	TC	3	6	48	53	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010815	TC	3	6	575	580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010815	AT	3	6	1023	1028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010815	CA	3	6	1181	1186	50 %	0 %	0 %	50 %	189426690
5	NC_010815	CT	3	6	8708	8713	0 %	50 %	0 %	50 %	189426699
6	NC_010815	CA	3	6	9199	9204	50 %	0 %	0 %	50 %	189426699
7	NC_010815	GA	3	6	11427	11432	50 %	0 %	50 %	0 %	189426701
8	NC_010815	AC	3	6	14153	14158	50 %	0 %	0 %	50 %	189426705
9	NC_010815	AT	3	6	14854	14859	50 %	50 %	0 %	0 %	189426706
10	NC_010815	TA	3	6	14919	14924	50 %	50 %	0 %	0 %	189426706
11	NC_010815	GT	3	6	15867	15872	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010815	CT	3	6	18439	18444	0 %	50 %	0 %	50 %	189426709
13	NC_010815	GT	3	6	19385	19390	0 %	50 %	50 %	0 %	189426710
14	NC_010815	CT	3	6	21421	21426	0 %	50 %	0 %	50 %	189426712
15	NC_010815	AG	3	6	22572	22577	50 %	0 %	50 %	0 %	189426714
16	NC_010815	AG	3	6	26311	26316	50 %	0 %	50 %	0 %	189426714
17	NC_010815	GC	3	6	28694	28699	0 %	0 %	50 %	50 %	189426718
18	NC_010815	GA	3	6	28933	28938	50 %	0 %	50 %	0 %	189426718
19	NC_010815	CT	3	6	28944	28949	0 %	50 %	0 %	50 %	189426718
20	NC_010815	AG	3	6	29937	29942	50 %	0 %	50 %	0 %	189426718
21	NC_010815	GA	3	6	34214	34219	50 %	0 %	50 %	0 %	189426721
22	NC_010815	GA	3	6	34459	34464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010815	GC	3	6	35559	35564	0 %	0 %	50 %	50 %	189426722
24	NC_010815	GC	3	6	37802	37807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010815	TG	4	8	38226	38233	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010815	GC	3	6	38520	38525	0 %	0 %	50 %	50 %	189426724
27	NC_010815	TG	3	6	38595	38600	0 %	50 %	50 %	0 %	189426724
28	NC_010815	GA	3	6	38812	38817	50 %	0 %	50 %	0 %	189426724
29	NC_010815	CG	3	6	39415	39420	0 %	0 %	50 %	50 %	189426725
30	NC_010815	TA	3	6	39799	39804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010815	GC	3	6	40931	40936	0 %	0 %	50 %	50 %	189426727
32	NC_010815	TA	3	6	41102	41107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010815	GT	3	6	41144	41149	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010815	AC	3	6	41809	41814	50 %	0 %	0 %	50 %	189426729
35	NC_010815	TA	3	6	44240	44245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010815	TA	3	6	44279	44284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010815	AC	3	6	44550	44555	50 %	0 %	0 %	50 %	189426731
38	NC_010815	TG	3	6	45233	45238	0 %	50 %	50 %	0 %	189426731
39	NC_010815	GC	3	6	45292	45297	0 %	0 %	50 %	50 %	189426731
40	NC_010815	GA	3	6	45692	45697	50 %	0 %	50 %	0 %	189426731
41	NC_010815	AT	3	6	45796	45801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010815	AT	3	6	45822	45827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010815	GC	3	6	46152	46157	0 %	0 %	50 %	50 %	189426732
44	NC_010815	TC	3	6	46375	46380	0 %	50 %	0 %	50 %	189426733
45	NC_010815	GC	3	6	46868	46873	0 %	0 %	50 %	50 %	189426733
46	NC_010815	AG	3	6	47709	47714	50 %	0 %	50 %	0 %	189426734
47	NC_010815	AT	3	6	48363	48368	50 %	50 %	0 %	0 %	189426735
48	NC_010815	AG	3	6	48371	48376	50 %	0 %	50 %	0 %	189426735
49	NC_010815	GC	3	6	49099	49104	0 %	0 %	50 %	50 %	189426737
50	NC_010815	AT	3	6	49275	49280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010815	CT	3	6	49389	49394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_010815	AG	3	6	49582	49587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010815	AT	4	8	50192	50199	50 %	50 %	0 %	0 %	189426738
54	NC_010815	AG	3	6	51639	51644	50 %	0 %	50 %	0 %	189426740
55	NC_010815	TA	4	8	51868	51875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010815	TG	3	6	51933	51938	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010815	AG	3	6	53380	53385	50 %	0 %	50 %	0 %	189426741
58	NC_010815	GA	3	6	53837	53842	50 %	0 %	50 %	0 %	189426741
59	NC_010815	CA	3	6	54381	54386	50 %	0 %	0 %	50 %	189426741
60	NC_010815	CA	3	6	55866	55871	50 %	0 %	0 %	50 %	189426742
61	NC_010815	TC	3	6	59057	59062	0 %	50 %	0 %	50 %	189426748
62	NC_010815	TC	3	6	59611	59616	0 %	50 %	0 %	50 %	189426749
63	NC_010815	AC	3	6	61160	61165	50 %	0 %	0 %	50 %	189426751
64	NC_010815	AG	3	6	61910	61915	50 %	0 %	50 %	0 %	189426752
65	NC_010815	TC	3	6	63070	63075	0 %	50 %	0 %	50 %	189426754
66	NC_010815	CA	3	6	63242	63247	50 %	0 %	0 %	50 %	189426754
67	NC_010815	CT	3	6	64656	64661	0 %	50 %	0 %	50 %	189426756
68	NC_010815	TC	3	6	67345	67350	0 %	50 %	0 %	50 %	189426758
69	NC_010815	CA	3	6	68187	68192	50 %	0 %	0 %	50 %	189426759
70	NC_010815	CT	3	6	70230	70235	0 %	50 %	0 %	50 %	189426762
71	NC_010815	TC	4	8	72028	72035	0 %	50 %	0 %	50 %	189426762
72	NC_010815	GA	3	6	72105	72110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010815	GA	3	6	72158	72163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010815	AG	3	6	72667	72672	50 %	0 %	50 %	0 %	189426763
75	NC_010815	TC	3	6	73750	73755	0 %	50 %	0 %	50 %	189426765
76	NC_010815	TC	3	6	74584	74589	0 %	50 %	0 %	50 %	189426765
77	NC_010815	TC	3	6	74736	74741	0 %	50 %	0 %	50 %	189426766
78	NC_010815	AG	3	6	75725	75730	50 %	0 %	50 %	0 %	189426767
79	NC_010815	CT	3	6	75891	75896	0 %	50 %	0 %	50 %	189426767
80	NC_010815	TC	3	6	76772	76777	0 %	50 %	0 %	50 %	189426768
81	NC_010815	AG	3	6	77057	77062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.