MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5 chromosome

Total Repeats: 103091

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
103001	NC_010125	CGA	2	6	3939570	3939575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162149619
103002	NC_010125	T	8	8	3939579	3939586	0 %	100 %	0 %	0 %	162149619
103003	NC_010125	TCG	2	6	3939600	3939605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162149619
103004	NC_010125	CA	3	6	3939618	3939623	50 %	0 %	0 %	50 %	162149619
103005	NC_010125	C	6	6	3939687	3939692	0 %	0 %	0 %	100 %	162149619
103006	NC_010125	GCC	2	6	3939752	3939757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162149619
103007	NC_010125	CCG	2	6	3939785	3939790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162149619
103008	NC_010125	GTCT	2	8	3939866	3939873	0 %	50 %	25 %	25 %	162149619
103009	NC_010125	CCAT	2	8	3939922	3939929	25 %	25 %	0 %	50 %	162149619
103010	NC_010125	ATC	2	6	3940006	3940011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103011	NC_010125	GTG	2	6	3940147	3940152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162149620
103012	NC_010125	CGG	2	6	3940208	3940213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162149620
103013	NC_010125	CCT	2	6	3940270	3940275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162149620
103014	NC_010125	CCGC	2	8	3940291	3940298	0 %	0 %	25 %	75 %	162149620
103015	NC_010125	GCAGG	2	10	3940399	3940408	20 %	0 %	60 %	20 %	162149620
103016	NC_010125	CTT	2	6	3940445	3940450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162149620
103017	NC_010125	CGG	2	6	3940474	3940479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162149620
103018	NC_010125	GCC	2	6	3940584	3940589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103019	NC_010125	GC	4	8	3940628	3940635	0 %	0 %	50 %	50 %	162149621
103020	NC_010125	GCCG	2	8	3940658	3940665	0 %	0 %	50 %	50 %	162149621
103021	NC_010125	GCC	2	6	3940671	3940676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162149621
103022	NC_010125	GCGAGG	2	12	3940720	3940731	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	162149621
103023	NC_010125	TCCG	2	8	3940744	3940751	0 %	25 %	25 %	50 %	162149621
103024	NC_010125	TCT	2	6	3940809	3940814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162149621
103025	NC_010125	CT	3	6	3940813	3940818	0 %	50 %	0 %	50 %	162149621
103026	NC_010125	GCA	2	6	3940848	3940853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162149621
103027	NC_010125	GGCCTG	2	12	3940867	3940878	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	162149621
103028	NC_010125	GCC	2	6	3940954	3940959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162149621
103029	NC_010125	ACG	2	6	3941015	3941020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162149621
103030	NC_010125	GCC	2	6	3941033	3941038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162149621
103031	NC_010125	GCGG	2	8	3941157	3941164	0 %	0 %	75 %	25 %	162149621
103032	NC_010125	GGC	2	6	3941181	3941186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162149621
103033	NC_010125	TAT	2	6	3941210	3941215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162149621
103034	NC_010125	A	6	6	3941236	3941241	100 %	0 %	0 %	0 %	162149621
103035	NC_010125	ACA	2	6	3941313	3941318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162149622
103036	NC_010125	GAT	2	6	3941345	3941350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162149622
103037	NC_010125	CTC	2	6	3941396	3941401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162149622
103038	NC_010125	A	6	6	3941646	3941651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103039	NC_010125	CAGAG	2	10	3941725	3941734	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
103040	NC_010125	GGA	3	9	3941789	3941797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162149623
103041	NC_010125	GC	3	6	3941802	3941807	0 %	0 %	50 %	50 %	162149623
103042	NC_010125	CG	3	6	3941848	3941853	0 %	0 %	50 %	50 %	162149623
103043	NC_010125	CGGCTG	2	12	3941903	3941914	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	162149623
103044	NC_010125	TGC	2	6	3941920	3941925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162149623
103045	NC_010125	TGGT	2	8	3941957	3941964	0 %	50 %	50 %	0 %	162149623
103046	NC_010125	CGG	2	6	3941979	3941984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162149623
103047	NC_010125	ATG	2	6	3942004	3942009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162149623
103048	NC_010125	AGCC	2	8	3942047	3942054	25 %	0 %	25 %	50 %	162149623
103049	NC_010125	ACG	2	6	3942115	3942120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162149623
103050	NC_010125	AGA	2	6	3942127	3942132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162149623
103051	NC_010125	ACGG	2	8	3942165	3942172	25 %	0 %	50 %	25 %	162149623
103052	NC_010125	CTG	2	6	3942177	3942182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162149623
103053	NC_010125	CGG	2	6	3942199	3942204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162149623
103054	NC_010125	GAT	2	6	3942230	3942235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162149623
103055	NC_010125	TCG	3	9	3942337	3942345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162149623
103056	NC_010125	GGAT	2	8	3942420	3942427	25 %	25 %	50 %	0 %	162149623
103057	NC_010125	TCG	2	6	3942493	3942498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162149623
103058	NC_010125	GAA	2	6	3942520	3942525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162149623
103059	NC_010125	AGC	2	6	3942616	3942621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162149624
103060	NC_010125	GATC	2	8	3942634	3942641	25 %	25 %	25 %	25 %	162149624
103061	NC_010125	TCT	2	6	3942651	3942656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162149624
103062	NC_010125	GCC	2	6	3942657	3942662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162149624
103063	NC_010125	GGC	2	6	3942711	3942716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162149624
103064	NC_010125	GGC	2	6	3942763	3942768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162149624
103065	NC_010125	ATC	2	6	3942779	3942784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162149624
103066	NC_010125	GCT	2	6	3942801	3942806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162149624
103067	NC_010125	GGC	2	6	3942888	3942893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162149624
103068	NC_010125	CATG	2	8	3942966	3942973	25 %	25 %	25 %	25 %	162149624
103069	NC_010125	CTG	2	6	3942979	3942984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162149624
103070	NC_010125	TCGA	2	8	3943021	3943028	25 %	25 %	25 %	25 %	162149624
103071	NC_010125	CG	3	6	3943081	3943086	0 %	0 %	50 %	50 %	162149624
103072	NC_010125	GGC	2	6	3943143	3943148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162149624
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103077	NC_010125	GCC	2	6	3943335	3943340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162149624
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103079	NC_010125	CGT	2	6	3943500	3943505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162149624
103080	NC_010125	CGA	2	6	3943508	3943513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162149624
103081	NC_010125	CGG	2	6	3943514	3943519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162149624
103082	NC_010125	CGC	2	6	3943533	3943538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162149624
103083	NC_010125	GGA	2	6	3943554	3943559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162149624
103084	NC_010125	GCG	2	6	3943637	3943642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162149624
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103087	NC_010125	CGT	2	6	3943961	3943966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103088	NC_010125	TCA	2	6	3943976	3943981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103089	NC_010125	TTC	2	6	3944030	3944035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103090	NC_010125	CGT	2	6	3944059	3944064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103091	NC_010125	GCC	2	6	3944138	3944143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.