MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Geobacillus thermodenitrificans NG80-2 plasmid pLW1071

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009329	TA	3	6	86	91	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009329	TA	3	6	124	129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009329	AT	3	6	551	556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009329	TC	3	6	1796	1801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009329	CT	3	6	1934	1939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009329	CT	3	6	2006	2011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009329	GA	3	6	2015	2020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009329	TC	3	6	2780	2785	0 %	50 %	0 %	50 %	138898341
9	NC_009329	TC	3	6	3625	3630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009329	TC	3	6	3809	3814	0 %	50 %	0 %	50 %	138898342
11	NC_009329	GC	3	6	4567	4572	0 %	0 %	50 %	50 %	138898343
12	NC_009329	TA	3	6	4831	4836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009329	AT	4	8	5512	5519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009329	AG	3	6	5665	5670	50 %	0 %	50 %	0 %	138898345
15	NC_009329	AC	3	6	7236	7241	50 %	0 %	0 %	50 %	138898346
16	NC_009329	TA	3	6	7633	7638	50 %	50 %	0 %	0 %	138898346
17	NC_009329	TC	3	6	8594	8599	0 %	50 %	0 %	50 %	138898348
18	NC_009329	AC	3	6	8971	8976	50 %	0 %	0 %	50 %	138898348
19	NC_009329	CT	3	6	9603	9608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009329	AT	3	6	9696	9701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009329	AT	3	6	10881	10886	50 %	50 %	0 %	0 %	138898350
22	NC_009329	CT	3	6	11204	11209	0 %	50 %	0 %	50 %	138898350
23	NC_009329	AG	3	6	11309	11314	50 %	0 %	50 %	0 %	138898350
24	NC_009329	TC	3	6	11324	11329	0 %	50 %	0 %	50 %	138898350
25	NC_009329	CT	3	6	13060	13065	0 %	50 %	0 %	50 %	138898351
26	NC_009329	CT	3	6	13138	13143	0 %	50 %	0 %	50 %	138898351
27	NC_009329	AT	3	6	13247	13252	50 %	50 %	0 %	0 %	138898352
28	NC_009329	AG	3	6	14134	14139	50 %	0 %	50 %	0 %	138898352
29	NC_009329	TC	3	6	15083	15088	0 %	50 %	0 %	50 %	138898353
30	NC_009329	GC	3	6	15375	15380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009329	TA	3	6	15390	15395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009329	CA	3	6	15615	15620	50 %	0 %	0 %	50 %	138898354
33	NC_009329	CA	3	6	16194	16199	50 %	0 %	0 %	50 %	138898355
34	NC_009329	AT	4	8	16885	16892	50 %	50 %	0 %	0 %	138898356
35	NC_009329	AC	3	6	20076	20081	50 %	0 %	0 %	50 %	138898358
36	NC_009329	GA	3	6	21388	21393	50 %	0 %	50 %	0 %	138898360
37	NC_009329	AG	3	6	22122	22127	50 %	0 %	50 %	0 %	138898361
38	NC_009329	AT	3	6	22695	22700	50 %	50 %	0 %	0 %	138898362
39	NC_009329	TA	3	6	23470	23475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009329	TA	3	6	23538	23543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009329	AC	3	6	24394	24399	50 %	0 %	0 %	50 %	138898363
42	NC_009329	TA	3	6	24670	24675	50 %	50 %	0 %	0 %	138898363
43	NC_009329	CA	3	6	25841	25846	50 %	0 %	0 %	50 %	138898365
44	NC_009329	TC	3	6	26030	26035	0 %	50 %	0 %	50 %	138898366
45	NC_009329	AT	3	6	26926	26931	50 %	50 %	0 %	0 %	138898367
46	NC_009329	TC	3	6	27464	27469	0 %	50 %	0 %	50 %	138898368
47	NC_009329	GT	3	6	29796	29801	0 %	50 %	50 %	0 %	138898370
48	NC_009329	AG	3	6	29806	29811	50 %	0 %	50 %	0 %	138898370
49	NC_009329	GA	3	6	29935	29940	50 %	0 %	50 %	0 %	138898370
50	NC_009329	AT	3	6	30998	31003	50 %	50 %	0 %	0 %	138898371
51	NC_009329	GA	3	6	31875	31880	50 %	0 %	50 %	0 %	138898371
52	NC_009329	AT	3	6	33556	33561	50 %	50 %	0 %	0 %	138898372
53	NC_009329	AC	3	6	34577	34582	50 %	0 %	0 %	50 %	138898372
54	NC_009329	AT	3	6	35711	35716	50 %	50 %	0 %	0 %	138898373
55	NC_009329	AG	3	6	36016	36021	50 %	0 %	50 %	0 %	138898374
56	NC_009329	GA	4	8	36204	36211	50 %	0 %	50 %	0 %	138898374
57	NC_009329	AG	3	6	37123	37128	50 %	0 %	50 %	0 %	138898375
58	NC_009329	AT	3	6	37337	37342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009329	TA	3	6	38245	38250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009329	AT	3	6	38290	38295	50 %	50 %	0 %	0 %	138898376
61	NC_009329	AT	3	6	38656	38661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009329	TA	3	6	39004	39009	50 %	50 %	0 %	0 %	138898377
63	NC_009329	GA	3	6	39619	39624	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009329	GA	3	6	40464	40469	50 %	0 %	50 %	0 %	138898378
65	NC_009329	CT	3	6	41228	41233	0 %	50 %	0 %	50 %	138898379
66	NC_009329	AG	3	6	41238	41243	50 %	0 %	50 %	0 %	138898379
67	NC_009329	AG	3	6	41310	41315	50 %	0 %	50 %	0 %	138898379
68	NC_009329	AG	3	6	41447	41452	50 %	0 %	50 %	0 %	138898379
69	NC_009329	AT	3	6	41669	41674	50 %	50 %	0 %	0 %	138898379
70	NC_009329	AC	3	6	42058	42063	50 %	0 %	0 %	50 %	138898380
71	NC_009329	AT	4	8	43176	43183	50 %	50 %	0 %	0 %	138898381
72	NC_009329	CT	3	6	44523	44528	0 %	50 %	0 %	50 %	138898383
73	NC_009329	CT	3	6	44575	44580	0 %	50 %	0 %	50 %	138898383
74	NC_009329	GA	3	6	44717	44722	50 %	0 %	50 %	0 %	138898383
75	NC_009329	AT	3	6	44808	44813	50 %	50 %	0 %	0 %	138898383
76	NC_009329	CT	3	6	46169	46174	0 %	50 %	0 %	50 %	138898384
77	NC_009329	CT	3	6	46414	46419	0 %	50 %	0 %	50 %	138898384
78	NC_009329	TA	3	6	46768	46773	50 %	50 %	0 %	0 %	138898384
79	NC_009329	AT	3	6	46816	46821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009329	GA	4	8	47941	47948	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009329	GA	3	6	48190	48195	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009329	AT	3	6	48236	48241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009329	AG	3	6	49260	49265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009329	GA	3	6	50627	50632	50 %	0 %	50 %	0 %	138898388
85	NC_009329	GC	3	6	50712	50717	0 %	0 %	50 %	50 %	138898388
86	NC_009329	AT	3	6	52120	52125	50 %	50 %	0 %	0 %	138898389
87	NC_009329	AT	3	6	52596	52601	50 %	50 %	0 %	0 %	138898389
88	NC_009329	AT	3	6	53001	53006	50 %	50 %	0 %	0 %	138898389
89	NC_009329	TA	3	6	53039	53044	50 %	50 %	0 %	0 %	138898389
90	NC_009329	TC	4	8	54220	54227	0 %	50 %	0 %	50 %	138898390
91	NC_009329	TA	3	6	54391	54396	50 %	50 %	0 %	0 %	138898391
92	NC_009329	AT	3	6	55444	55449	50 %	50 %	0 %	0 %	138898391
93	NC_009329	AC	3	6	55546	55551	50 %	0 %	0 %	50 %	138898391
94	NC_009329	TA	3	6	55643	55648	50 %	50 %	0 %	0 %	138898391
95	NC_009329	TA	3	6	55843	55848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009329	AT	3	6	56264	56269	50 %	50 %	0 %	0 %	138898392
97	NC_009329	GT	3	6	56766	56771	0 %	50 %	50 %	0 %	138898392
98	NC_009329	TA	4	8	56831	56838	50 %	50 %	0 %	0 %	138898392
99	NC_009329	TA	3	6	57249	57254	50 %	50 %	0 %	0 %	138898392
100	NC_009329	TA	3	6	57595	57600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.