MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Geobacillus thermodenitrificans NG80-2 plasmid pLW1071

Total Repeats: 173

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009329	GGGT	2	8	249	256	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009329	GTGA	2	8	391	398	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009329	CATG	2	8	911	918	25 %	25 %	25 %	25 %	138898340
4	NC_009329	TTTC	2	8	1992	1999	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009329	TAGA	2	8	2181	2188	50 %	25 %	25 %	0 %	138898341
6	NC_009329	TCGC	2	8	2439	2446	0 %	25 %	25 %	50 %	138898341
7	NC_009329	TCGT	2	8	2500	2507	0 %	50 %	25 %	25 %	138898341
8	NC_009329	TTTC	2	8	2718	2725	0 %	75 %	0 %	25 %	138898341
9	NC_009329	GGTA	2	8	3037	3044	25 %	25 %	50 %	0 %	138898341
10	NC_009329	CATC	2	8	3819	3826	25 %	25 %	0 %	50 %	138898342
11	NC_009329	AAAG	2	8	4031	4038	75 %	0 %	25 %	0 %	138898342
12	NC_009329	GAAG	2	8	4053	4060	50 %	0 %	50 %	0 %	138898342
13	NC_009329	TTTC	2	8	4083	4090	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009329	ATTT	2	8	4167	4174	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009329	TTGA	2	8	4762	4769	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009329	TCGC	2	8	4949	4956	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009329	ATCA	2	8	5504	5511	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009329	TATT	2	8	5552	5559	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009329	TAAA	2	8	5575	5582	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009329	TCCT	2	8	5801	5808	0 %	50 %	0 %	50 %	138898345
21	NC_009329	TTCA	2	8	5941	5948	25 %	50 %	0 %	25 %	138898345
22	NC_009329	CGAA	2	8	6054	6061	50 %	0 %	25 %	25 %	138898345
23	NC_009329	ATTC	2	8	6093	6100	25 %	50 %	0 %	25 %	138898345
24	NC_009329	TTCA	2	8	6244	6251	25 %	50 %	0 %	25 %	138898346
25	NC_009329	ACTA	2	8	6592	6599	50 %	25 %	0 %	25 %	138898346
26	NC_009329	TCTT	2	8	6695	6702	0 %	75 %	0 %	25 %	138898346
27	NC_009329	TTTG	2	8	6747	6754	0 %	75 %	25 %	0 %	138898346
28	NC_009329	TGCC	2	8	6766	6773	0 %	25 %	25 %	50 %	138898346
29	NC_009329	TCTG	2	8	6809	6816	0 %	50 %	25 %	25 %	138898346
30	NC_009329	AATC	2	8	7212	7219	50 %	25 %	0 %	25 %	138898346
31	NC_009329	GTCC	2	8	7281	7288	0 %	25 %	25 %	50 %	138898346
32	NC_009329	TCCG	2	8	7351	7358	0 %	25 %	25 %	50 %	138898346
33	NC_009329	AACG	2	8	7430	7437	50 %	0 %	25 %	25 %	138898346
34	NC_009329	TATT	2	8	7691	7698	25 %	75 %	0 %	0 %	138898346
35	NC_009329	CTCA	2	8	7725	7732	25 %	25 %	0 %	50 %	138898347
36	NC_009329	TTTC	2	8	8275	8282	0 %	75 %	0 %	25 %	138898347
37	NC_009329	AAAC	2	8	8561	8568	75 %	0 %	0 %	25 %	138898348
38	NC_009329	TTTC	2	8	9609	9616	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009329	CAAT	2	8	10252	10259	50 %	25 %	0 %	25 %	138898349
40	NC_009329	TCAT	2	8	10297	10304	25 %	50 %	0 %	25 %	138898349
41	NC_009329	GCTG	2	8	10319	10326	0 %	25 %	50 %	25 %	138898350
42	NC_009329	TCGT	2	8	11480	11487	0 %	50 %	25 %	25 %	138898351
43	NC_009329	TTCT	2	8	11514	11521	0 %	75 %	0 %	25 %	138898351
44	NC_009329	GATC	2	8	12335	12342	25 %	25 %	25 %	25 %	138898351
45	NC_009329	TTGC	2	8	12724	12731	0 %	50 %	25 %	25 %	138898351
46	NC_009329	TCTT	2	8	13144	13151	0 %	75 %	0 %	25 %	138898351
47	NC_009329	GATG	2	8	14058	14065	25 %	25 %	50 %	0 %	138898352
48	NC_009329	AAGG	2	8	14097	14104	50 %	0 %	50 %	0 %	138898352
49	NC_009329	ATTC	2	8	14239	14246	25 %	50 %	0 %	25 %	138898352
50	NC_009329	CGGG	2	8	14287	14294	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009329	TAAA	2	8	14562	14569	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009329	CTTG	2	8	15160	15167	0 %	50 %	25 %	25 %	138898353
53	NC_009329	TGAA	2	8	15650	15657	50 %	25 %	25 %	0 %	138898354
54	NC_009329	CAAC	2	8	15824	15831	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009329	TGAA	2	8	16229	16236	50 %	25 %	25 %	0 %	138898355
56	NC_009329	ATTG	2	8	16368	16375	25 %	50 %	25 %	0 %	138898355
57	NC_009329	CAAC	2	8	16404	16411	50 %	0 %	0 %	50 %	138898355
58	NC_009329	TTTG	2	8	16848	16855	0 %	75 %	25 %	0 %	138898356
59	NC_009329	GAAA	2	8	17117	17124	75 %	0 %	25 %	0 %	138898356
60	NC_009329	TGAT	2	8	17168	17175	25 %	50 %	25 %	0 %	138898356
61	NC_009329	ATAA	2	8	17473	17480	75 %	25 %	0 %	0 %	138898356
62	NC_009329	ATAA	2	8	17494	17501	75 %	25 %	0 %	0 %	138898356
63	NC_009329	AAAC	2	8	17613	17620	75 %	0 %	0 %	25 %	138898356
64	NC_009329	AACC	2	8	17782	17789	50 %	0 %	0 %	50 %	138898356
65	NC_009329	TTGT	2	8	18365	18372	0 %	75 %	25 %	0 %	138898357
66	NC_009329	TTTC	2	8	18659	18666	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009329	AAAT	2	8	20060	20067	75 %	25 %	0 %	0 %	138898358
68	NC_009329	CCGA	2	8	21055	21062	25 %	0 %	25 %	50 %	138898359
69	NC_009329	GAAG	2	8	21195	21202	50 %	0 %	50 %	0 %	138898359
70	NC_009329	TAAA	2	8	21273	21280	75 %	25 %	0 %	0 %	138898359
71	NC_009329	AAAT	2	8	21351	21358	75 %	25 %	0 %	0 %	138898360
72	NC_009329	CATT	2	8	22155	22162	25 %	50 %	0 %	25 %	138898361
73	NC_009329	TCAC	2	8	22225	22232	25 %	25 %	0 %	50 %	138898361
74	NC_009329	GGAT	2	8	22535	22542	25 %	25 %	50 %	0 %	138898362
75	NC_009329	AACA	2	8	22657	22664	75 %	0 %	0 %	25 %	138898362
76	NC_009329	ATTC	2	8	22676	22683	25 %	50 %	0 %	25 %	138898362
77	NC_009329	CAAT	2	8	23224	23231	50 %	25 %	0 %	25 %	138898362
78	NC_009329	TAAT	2	8	23434	23441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009329	ATCA	2	8	23476	23483	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009329	TCAT	2	8	23561	23568	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009329	CATT	2	8	23621	23628	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009329	ATTC	3	12	23644	23655	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009329	ATGG	2	8	23694	23701	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009329	GATT	2	8	23732	23739	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009329	GTTT	2	8	23917	23924	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009329	ATAA	2	8	23934	23941	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009329	AGGG	2	8	23967	23974	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009329	ATAA	2	8	24693	24700	75 %	25 %	0 %	0 %	138898363
89	NC_009329	TGGA	2	8	24707	24714	25 %	25 %	50 %	0 %	138898363
90	NC_009329	AATA	2	8	25405	25412	75 %	25 %	0 %	0 %	138898364
91	NC_009329	TTCG	2	8	25768	25775	0 %	50 %	25 %	25 %	138898365
92	NC_009329	ATCC	2	8	26788	26795	25 %	25 %	0 %	50 %	138898367
93	NC_009329	CGTT	2	8	27149	27156	0 %	50 %	25 %	25 %	138898368
94	NC_009329	GAGG	2	8	27654	27661	25 %	0 %	75 %	0 %	138898368
95	NC_009329	TCAA	2	8	28079	28086	50 %	25 %	0 %	25 %	138898369
96	NC_009329	TTCA	2	8	28246	28253	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009329	GGAT	2	8	28573	28580	25 %	25 %	50 %	0 %	138898370
98	NC_009329	CAGC	2	8	29461	29468	25 %	0 %	25 %	50 %	138898370
99	NC_009329	TCCA	2	8	29556	29563	25 %	25 %	0 %	50 %	138898370
100	NC_009329	AAGA	2	8	29834	29841	75 %	0 %	25 %	0 %	138898370
101	NC_009329	GAGC	2	8	30076	30083	25 %	0 %	50 %	25 %	138898370
102	NC_009329	GTTT	2	8	30571	30578	0 %	75 %	25 %	0 %	138898371
103	NC_009329	CGAT	2	8	31078	31085	25 %	25 %	25 %	25 %	138898371
104	NC_009329	AGAA	2	8	31494	31501	75 %	0 %	25 %	0 %	138898371
105	NC_009329	CGAA	2	8	31829	31836	50 %	0 %	25 %	25 %	138898371
106	NC_009329	AAGG	2	8	31922	31929	50 %	0 %	50 %	0 %	138898371
107	NC_009329	TTAT	2	8	32011	32018	25 %	75 %	0 %	0 %	138898371
108	NC_009329	CAAG	2	8	32194	32201	50 %	0 %	25 %	25 %	138898371
109	NC_009329	TTTC	2	8	32657	32664	0 %	75 %	0 %	25 %	138898372
110	NC_009329	CCAG	2	8	32900	32907	25 %	0 %	25 %	50 %	138898372
111	NC_009329	GAAA	2	8	33037	33044	75 %	0 %	25 %	0 %	138898372
112	NC_009329	CCAT	2	8	33045	33052	25 %	25 %	0 %	50 %	138898372
113	NC_009329	GAAT	2	8	33099	33106	50 %	25 %	25 %	0 %	138898372
114	NC_009329	AAGC	2	8	33451	33458	50 %	0 %	25 %	25 %	138898372
115	NC_009329	TTCG	2	8	33636	33643	0 %	50 %	25 %	25 %	138898372
116	NC_009329	TCGA	2	8	34485	34492	25 %	25 %	25 %	25 %	138898372
117	NC_009329	GAAT	2	8	34943	34950	50 %	25 %	25 %	0 %	138898373
118	NC_009329	ACGA	2	8	35232	35239	50 %	0 %	25 %	25 %	138898373
119	NC_009329	AGAA	2	8	35278	35285	75 %	0 %	25 %	0 %	138898373
120	NC_009329	AAAG	2	8	35382	35389	75 %	0 %	25 %	0 %	138898373
121	NC_009329	AAAG	2	8	36261	36268	75 %	0 %	25 %	0 %	138898374
122	NC_009329	CGAT	2	8	36529	36536	25 %	25 %	25 %	25 %	138898375
123	NC_009329	AATT	2	8	36642	36649	50 %	50 %	0 %	0 %	138898375
124	NC_009329	GAAA	2	8	36700	36707	75 %	0 %	25 %	0 %	138898375
125	NC_009329	ATCA	2	8	37074	37081	50 %	25 %	0 %	25 %	138898375
126	NC_009329	GAAC	2	8	37659	37666	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009329	GCTC	2	8	37769	37776	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_009329	CAAA	2	8	38457	38464	75 %	0 %	0 %	25 %	138898376
129	NC_009329	TAAT	2	8	38768	38775	50 %	50 %	0 %	0 %	138898377
130	NC_009329	TGGT	2	8	39135	39142	0 %	50 %	50 %	0 %	138898377
131	NC_009329	TACC	2	8	40205	40212	25 %	25 %	0 %	50 %	138898378
132	NC_009329	GAAA	2	8	40524	40531	75 %	0 %	25 %	0 %	138898378
133	NC_009329	ACGA	2	8	40742	40749	50 %	0 %	25 %	25 %	138898378
134	NC_009329	ATCT	2	8	41060	41067	25 %	50 %	0 %	25 %	138898378
135	NC_009329	CTCA	2	8	41826	41833	25 %	25 %	0 %	50 %	138898379
136	NC_009329	ACCC	2	8	41969	41976	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
137	NC_009329	TTTG	2	8	42170	42177	0 %	75 %	25 %	0 %	138898380
138	NC_009329	CTTT	2	8	42219	42226	0 %	75 %	0 %	25 %	138898380
139	NC_009329	AGGA	2	8	42459	42466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009329	TTTC	2	8	42904	42911	0 %	75 %	0 %	25 %	138898381
141	NC_009329	TGAC	2	8	43949	43956	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_009329	AATC	2	8	44439	44446	50 %	25 %	0 %	25 %	138898383
143	NC_009329	CTCG	2	8	44746	44753	0 %	25 %	25 %	50 %	138898383
144	NC_009329	GACA	2	8	44985	44992	50 %	0 %	25 %	25 %	138898383
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.