MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Geobacter metallireducens GS-15 plasmid unnamed

Total Repeats: 193

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007515	GGC	2	6	1	6	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007515	TGG	2	6	68	73	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007515	CGG	2	6	168	173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007515	ATT	2	6	420	425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007515	GAA	2	6	544	549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007515	CTA	2	6	783	788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_007515	GGT	2	6	862	867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007515	GCC	2	6	967	972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404494837
9	NC_007515	GCC	2	6	1171	1176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404494837
10	NC_007515	TCT	2	6	1297	1302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494837
11	NC_007515	CAC	2	6	1305	1310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404494837
12	NC_007515	CAC	2	6	1357	1362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404494837
13	NC_007515	GCC	2	6	1366	1371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404494837
14	NC_007515	TGT	2	6	1415	1420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494837
15	NC_007515	CAG	2	6	1436	1441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404494837
16	NC_007515	TGT	2	6	1459	1464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494837
17	NC_007515	CGG	2	6	1546	1551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494837
18	NC_007515	ATA	2	6	1674	1679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404494837
19	NC_007515	CAA	2	6	1815	1820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404494837
20	NC_007515	GCC	2	6	1951	1956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404494837
21	NC_007515	TCT	2	6	1979	1984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494837
22	NC_007515	AAG	2	6	2126	2131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404494838
23	NC_007515	CTT	3	9	2183	2191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494838
24	NC_007515	AAT	2	6	2199	2204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404494838
25	NC_007515	TCA	2	6	2230	2235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007515	CGG	2	6	2291	2296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007515	CTC	2	6	2349	2354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_007515	CTT	2	6	2543	2548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494839
29	NC_007515	CCA	2	6	2560	2565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404494839
30	NC_007515	GCT	2	6	2686	2691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494839
31	NC_007515	GTT	2	6	2729	2734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494839
32	NC_007515	GAA	2	6	2924	2929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404494839
33	NC_007515	CCG	2	6	3112	3117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404494839
34	NC_007515	GCT	2	6	3235	3240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494839
35	NC_007515	CAC	2	6	3331	3336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404494839
36	NC_007515	TGG	2	6	3363	3368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404494839
37	NC_007515	CTT	2	6	3458	3463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494839
38	NC_007515	GTT	2	6	3532	3537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494839
39	NC_007515	CCT	2	6	3569	3574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_007515	GGA	2	6	3581	3586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007515	CAA	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007515	AGT	2	6	3687	3692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007515	AAG	2	6	3743	3748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007515	GGC	3	9	3934	3942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494840
45	NC_007515	TTC	2	6	3982	3987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494840
46	NC_007515	GCG	2	6	3992	3997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494840
47	NC_007515	CCT	2	6	4079	4084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404494841
48	NC_007515	CAA	2	6	4220	4225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404494841
49	NC_007515	ATC	2	6	4509	4514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007515	TCT	2	6	4568	4573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007515	TTC	2	6	4722	4727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494842
52	NC_007515	CGG	2	6	4800	4805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494843
53	NC_007515	TCT	2	6	4842	4847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494843
54	NC_007515	TGA	2	6	4855	4860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404494843
55	NC_007515	CTT	2	6	5003	5008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494843
56	NC_007515	GCG	2	6	5022	5027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494843
57	NC_007515	TCA	2	6	5060	5065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404494844
58	NC_007515	CTT	2	6	5066	5071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494844
59	NC_007515	GTC	2	6	5145	5150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494844
60	NC_007515	CAA	2	6	5159	5164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404494844
61	NC_007515	TCC	2	6	5270	5275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_007515	GGA	2	6	5370	5375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404494845
63	NC_007515	CGG	2	6	5506	5511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494845
64	NC_007515	TCA	2	6	5665	5670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404494845
65	NC_007515	CGG	2	6	5674	5679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494845
66	NC_007515	GAC	2	6	5758	5763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404494845
67	NC_007515	GGC	2	6	5780	5785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494845
68	NC_007515	CTT	2	6	6014	6019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494846
69	NC_007515	GTA	2	6	6026	6031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404494846
70	NC_007515	CCG	2	6	6103	6108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404494846
71	NC_007515	TTG	2	6	6126	6131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494846
72	NC_007515	AAC	2	6	6158	6163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404494846
73	NC_007515	ATA	2	6	6177	6182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404494846
74	NC_007515	CCT	2	6	6205	6210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_007515	CGG	2	6	6320	6325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494847
76	NC_007515	GGC	2	6	6330	6335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494847
77	NC_007515	TTG	2	6	6362	6367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494847
78	NC_007515	CTG	2	6	6375	6380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494847
79	NC_007515	GTT	2	6	6392	6397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494847
80	NC_007515	CCA	2	6	6401	6406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404494847
81	NC_007515	GCG	2	6	6433	6438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494847
82	NC_007515	GCG	2	6	6466	6471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494847
83	NC_007515	GCG	2	6	6502	6507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494847
84	NC_007515	GCT	2	6	6557	6562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494847
85	NC_007515	GGC	2	6	6573	6578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494847
86	NC_007515	GCG	2	6	6583	6588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494847
87	NC_007515	GGC	2	6	6615	6620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494847
88	NC_007515	TCT	2	6	6686	6691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494847
89	NC_007515	CGG	2	6	6812	6817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494847
90	NC_007515	CTG	2	6	6837	6842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494847
91	NC_007515	TTG	2	6	6893	6898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494847
92	NC_007515	TCC	2	6	6964	6969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_007515	GTT	2	6	7039	7044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494848
94	NC_007515	CTG	2	6	7112	7117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
95	NC_007515	GCT	2	6	7133	7138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
96	NC_007515	CGG	2	6	7140	7145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494848
97	NC_007515	GCT	2	6	7196	7201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
98	NC_007515	CCG	2	6	7209	7214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404494848
99	NC_007515	GGT	2	6	7259	7264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404494848
100	NC_007515	GGT	2	6	7310	7315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404494848
101	NC_007515	CTG	2	6	7318	7323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
102	NC_007515	CTG	2	6	7363	7368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
103	NC_007515	GCT	2	6	7377	7382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
104	NC_007515	CGG	2	6	7387	7392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494848
105	NC_007515	GCT	2	6	7403	7408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
106	NC_007515	CGG	2	6	7450	7455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494848
107	NC_007515	GGC	2	6	7475	7480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494848
108	NC_007515	CTG	2	6	7510	7515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
109	NC_007515	GCT	3	9	7554	7562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
110	NC_007515	CTG	2	6	7594	7599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
111	NC_007515	GCG	2	6	7620	7625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494848
112	NC_007515	TGC	3	9	7637	7645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
113	NC_007515	GCG	2	6	7650	7655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494848
114	NC_007515	CGG	3	9	7672	7680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494848
115	NC_007515	CGG	2	6	7684	7689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494848
116	NC_007515	CGG	2	6	7714	7719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494848
117	NC_007515	TCA	2	6	7780	7785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404494848
118	NC_007515	CCA	2	6	7849	7854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404494848
119	NC_007515	ATT	2	6	7890	7895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404494848
120	NC_007515	GAT	2	6	7955	7960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404494848
121	NC_007515	GAC	2	6	8018	8023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404494848
122	NC_007515	TGT	2	6	8094	8099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494848
123	NC_007515	CAG	2	6	8119	8124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404494848
124	NC_007515	CCG	2	6	8134	8139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404494848
125	NC_007515	GAT	2	6	8222	8227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404494848
126	NC_007515	TGT	2	6	8314	8319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494848
127	NC_007515	CTG	3	9	8623	8631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494849
128	NC_007515	CGG	2	6	8709	8714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494849
129	NC_007515	TCT	2	6	8730	8735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494849
130	NC_007515	GAG	2	6	9130	9135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404494849
131	NC_007515	CTG	2	6	9151	9156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494849
132	NC_007515	CTT	2	6	9172	9177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494849
133	NC_007515	GCT	2	6	9242	9247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494849
134	NC_007515	AGG	2	6	9311	9316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404494849
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138	NC_007515	TTG	2	6	9581	9586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494849
139	NC_007515	CTT	2	6	9616	9621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494849
140	NC_007515	GGC	2	6	9643	9648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494849
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193	NC_007515	TCT	2	6	13723	13728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.