MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Gluconobacter oxydans 621H plasmid pGOX4

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006675	GGAA	2	8	130	137	50 %	0 %	50 %	0 %	58038468
2	NC_006675	CACG	2	8	175	182	25 %	0 %	25 %	50 %	58038468
3	NC_006675	TCGC	2	8	215	222	0 %	25 %	25 %	50 %	58038468
4	NC_006675	GACG	2	8	340	347	25 %	0 %	50 %	25 %	58038468
5	NC_006675	TTCT	2	8	2142	2149	0 %	75 %	0 %	25 %	58038469
6	NC_006675	AATG	2	8	2216	2223	50 %	25 %	25 %	0 %	58038469
7	NC_006675	CGAC	2	8	2276	2283	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_006675	ATAG	2	8	2666	2673	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006675	CAGC	2	8	2840	2847	25 %	0 %	25 %	50 %	58038470
10	NC_006675	TTGA	2	8	3775	3782	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006675	TGAT	2	8	3818	3825	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006675	TTGA	2	8	3981	3988	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006675	CCCT	2	8	4435	4442	0 %	25 %	0 %	75 %	58038472
14	NC_006675	TCCG	2	8	4939	4946	0 %	25 %	25 %	50 %	58038472
15	NC_006675	CGCC	2	8	5017	5024	0 %	0 %	25 %	75 %	58038472
16	NC_006675	GCCC	2	8	5492	5499	0 %	0 %	25 %	75 %	58038473
17	NC_006675	ATTT	2	8	5749	5756	25 %	75 %	0 %	0 %	58038474
18	NC_006675	AGAC	2	8	6113	6120	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_006675	GATG	2	8	6240	6247	25 %	25 %	50 %	0 %	58038475
20	NC_006675	ACGG	2	8	6252	6259	25 %	0 %	50 %	25 %	58038475
21	NC_006675	ATCA	2	8	7168	7175	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_006675	ATCA	2	8	7210	7217	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_006675	GCTG	2	8	7422	7429	0 %	25 %	50 %	25 %	58038476
24	NC_006675	TCAT	2	8	7630	7637	25 %	50 %	0 %	25 %	58038476
25	NC_006675	GGAG	2	8	7987	7994	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006675	TGGA	2	8	8928	8935	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006675	GATC	2	8	8945	8952	25 %	25 %	25 %	25 %	58038479
28	NC_006675	CGCC	2	8	9412	9419	0 %	0 %	25 %	75 %	58038480
29	NC_006675	CCGT	2	8	9540	9547	0 %	25 %	25 %	50 %	58038480
30	NC_006675	GGGC	2	8	9582	9589	0 %	0 %	75 %	25 %	58038480
31	NC_006675	TCAA	2	8	9710	9717	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_006675	AACG	2	8	10693	10700	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_006675	TTGT	2	8	10745	10752	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006675	CAGG	2	8	10857	10864	25 %	0 %	50 %	25 %	58038482
35	NC_006675	TCCT	2	8	11571	11578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_006675	CATG	2	8	11760	11767	25 %	25 %	25 %	25 %	58038483
37	NC_006675	GCTG	2	8	12113	12120	0 %	25 %	50 %	25 %	58038484
38	NC_006675	TGAT	2	8	12237	12244	25 %	50 %	25 %	0 %	58038484
39	NC_006675	CAGC	2	8	12445	12452	25 %	0 %	25 %	50 %	58038485
40	NC_006675	GTCG	2	8	12608	12615	0 %	25 %	50 %	25 %	58038485

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.