MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Gluconobacter oxydans 621H plasmid pGOX4

Total Repeats: 133

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006675	CGC	2	6	40	45	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_006675	AGC	2	6	190	195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038468
3	NC_006675	GAG	2	6	233	238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58038468
4	NC_006675	AGA	2	6	297	302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58038468
5	NC_006675	GAT	2	6	352	357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58038468
6	NC_006675	TGC	2	6	381	386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038468
7	NC_006675	CAT	2	6	694	699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038468
8	NC_006675	ATC	2	6	846	851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038468
9	NC_006675	TCA	3	9	1059	1067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038468
10	NC_006675	TGG	2	6	1188	1193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006675	ATT	2	6	1453	1458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006675	CTG	2	6	1539	1544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_006675	GGC	2	6	1610	1615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_006675	ATG	2	6	1667	1672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006675	CGC	2	6	1915	1920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038469
16	NC_006675	GGC	2	6	2019	2024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038469
17	NC_006675	GGC	3	9	2083	2091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038469
18	NC_006675	TGC	2	6	2095	2100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038469
19	NC_006675	AAG	2	6	2112	2117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58038469
20	NC_006675	CTT	2	6	2238	2243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58038469
21	NC_006675	AGC	2	6	2335	2340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_006675	GAT	2	6	2490	2495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006675	TTA	2	6	2507	2512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006675	GCC	2	6	2796	2801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038470
25	NC_006675	CGC	2	6	3242	3247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038470
26	NC_006675	GGC	2	6	3282	3287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038470
27	NC_006675	TGC	2	6	3305	3310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038470
28	NC_006675	GGA	2	6	3460	3465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58038471
29	NC_006675	AAG	2	6	3605	3610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58038471
30	NC_006675	GAA	2	6	3766	3771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006675	ATC	2	6	3873	3878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_006675	GCG	2	6	3925	3930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_006675	CTG	2	6	4027	4032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_006675	CGG	2	6	4100	4105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038472
35	NC_006675	AGG	2	6	4120	4125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58038472
36	NC_006675	GCG	2	6	4131	4136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038472
37	NC_006675	TGG	2	6	4172	4177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58038472
38	NC_006675	GGC	3	9	4461	4469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038472
39	NC_006675	GTC	2	6	4474	4479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038472
40	NC_006675	TCC	2	6	4576	4581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58038472
41	NC_006675	GCT	2	6	4715	4720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038472
42	NC_006675	ACC	2	6	4812	4817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58038472
43	NC_006675	TTG	2	6	4960	4965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58038472
44	NC_006675	TCC	2	6	5183	5188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_006675	TCC	2	6	5335	5340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58038473
46	NC_006675	GTC	2	6	5400	5405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038473
47	NC_006675	GCA	2	6	5426	5431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038473
48	NC_006675	CGC	2	6	5485	5490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038473
49	NC_006675	CCG	2	6	5546	5551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038473
50	NC_006675	CCA	2	6	5561	5566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58038473
51	NC_006675	TGC	2	6	5602	5607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038473
52	NC_006675	TAA	2	6	5724	5729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006675	CTA	2	6	5758	5763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038474
54	NC_006675	CTT	2	6	5764	5769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58038474
55	NC_006675	TAA	2	6	5815	5820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58038474
56	NC_006675	CGA	2	6	5847	5852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038474
57	NC_006675	AAG	2	6	5876	5881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58038474
58	NC_006675	ACG	2	6	5921	5926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_006675	TGA	2	6	5976	5981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006675	CTA	2	6	6048	6053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_006675	GCG	2	6	6107	6112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_006675	AGC	2	6	6479	6484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038475
63	NC_006675	AGG	2	6	6617	6622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58038475
64	NC_006675	AAC	2	6	6720	6725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58038475
65	NC_006675	GCC	3	9	6730	6738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038475
66	NC_006675	GAT	2	6	7115	7120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006675	TTC	2	6	7222	7227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_006675	CGG	2	6	7281	7286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_006675	CTG	2	6	7465	7470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038476
70	NC_006675	GGC	2	6	7535	7540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038476
71	NC_006675	CGC	3	9	7653	7661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038476
72	NC_006675	AAG	2	6	7705	7710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58038477
73	NC_006675	TCA	2	6	7750	7755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038477
74	NC_006675	TCA	2	6	7825	7830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038477
75	NC_006675	ACA	2	6	7925	7930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58038477
76	NC_006675	ACT	2	6	7962	7967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_006675	CAG	2	6	8020	8025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_006675	TGC	2	6	8032	8037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_006675	GAA	2	6	8233	8238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58038478
80	NC_006675	TCT	2	6	8271	8276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58038478
81	NC_006675	GAA	2	6	8308	8313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58038478
82	NC_006675	TTC	2	6	8660	8665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58038478
83	NC_006675	CCT	2	6	8679	8684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58038478
84	NC_006675	ATC	2	6	8719	8724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038478
85	NC_006675	AGG	3	9	8750	8758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58038478
86	NC_006675	AGA	2	6	8842	8847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006675	GAC	2	6	8978	8983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038479
88	NC_006675	CAG	2	6	9175	9180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_006675	AGT	2	6	9193	9198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006675	CGC	2	6	9456	9461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038480
91	NC_006675	AGC	2	6	9479	9484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038480
92	NC_006675	GAT	2	6	9655	9660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006675	GAC	2	6	9688	9693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_006675	ATC	2	6	9757	9762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_006675	AGC	2	6	9773	9778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_006675	GCT	2	6	9900	9905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_006675	ACC	2	6	9984	9989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_006675	CCT	2	6	10183	10188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58038481
99	NC_006675	CGG	2	6	10285	10290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038481
100	NC_006675	CTC	2	6	10346	10351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58038481
101	NC_006675	GTC	2	6	10421	10426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038481
102	NC_006675	GCG	2	6	10469	10474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038481
103	NC_006675	ATC	2	6	11038	11043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038482
104	NC_006675	GCG	2	6	11144	11149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038482
105	NC_006675	TGG	2	6	11316	11321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58038482
106	NC_006675	CCA	2	6	11493	11498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_006675	CCG	2	6	11703	11708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038483
108	NC_006675	TGT	2	6	11723	11728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58038483
109	NC_006675	CTG	2	6	11839	11844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038483
110	NC_006675	TGG	2	6	11852	11857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58038483
111	NC_006675	TGA	2	6	11871	11876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58038483
112	NC_006675	GCA	2	6	11880	11885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038483
113	NC_006675	CGG	2	6	11972	11977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038483
114	NC_006675	CGG	2	6	12041	12046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038483
115	NC_006675	CTG	2	6	12156	12161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038484
116	NC_006675	ATC	2	6	12273	12278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038485
117	NC_006675	TTG	2	6	12301	12306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58038485
118	NC_006675	GGC	3	9	12325	12333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038485
119	NC_006675	GAC	2	6	12383	12388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038485
120	NC_006675	CAC	2	6	12454	12459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58038485
121	NC_006675	GCG	2	6	12541	12546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038485
122	NC_006675	CGG	2	6	12568	12573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038485
123	NC_006675	GCC	2	6	12585	12590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038485
124	NC_006675	TCT	2	6	12640	12645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58038485
125	NC_006675	GCC	2	6	12668	12673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038485
126	NC_006675	GCC	2	6	12856	12861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038485
127	NC_006675	GTG	2	6	12873	12878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58038485
128	NC_006675	GCG	2	6	12958	12963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038485
129	NC_006675	GTC	2	6	13010	13015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038485
130	NC_006675	TCA	2	6	13062	13067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_006675	CTG	2	6	13095	13100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_006675	GGC	2	6	13145	13150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_006675	ACC	2	6	13187	13192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.