MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Gluconobacter oxydans 621H plasmid pGOX2

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006673	CCGT	2	8	192	199	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_006673	GGCC	2	8	379	386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_006673	CAGC	2	8	1081	1088	25 %	0 %	25 %	50 %	58038419
4	NC_006673	ATGG	2	8	1448	1455	25 %	25 %	50 %	0 %	58038419
5	NC_006673	GCCT	2	8	1593	1600	0 %	25 %	25 %	50 %	58038419
6	NC_006673	CCGG	2	8	1647	1654	0 %	0 %	50 %	50 %	58038419
7	NC_006673	GGAG	2	8	1737	1744	25 %	0 %	75 %	0 %	58038420
8	NC_006673	GTCC	2	8	2403	2410	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_006673	TGTT	2	8	2827	2834	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006673	GGAA	2	8	3094	3101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006673	TACG	2	8	3139	3146	25 %	25 %	25 %	25 %	58038422
12	NC_006673	TCGC	2	8	3179	3186	0 %	25 %	25 %	50 %	58038422
13	NC_006673	GACG	2	8	3304	3311	25 %	0 %	50 %	25 %	58038422
14	NC_006673	GTCG	2	8	4746	4753	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_006673	ACTC	2	8	4830	4837	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_006673	TCGC	2	8	4996	5003	0 %	25 %	25 %	50 %	58038425
17	NC_006673	GACT	2	8	5437	5444	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_006673	TAAG	2	8	5529	5536	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006673	TGAG	2	8	6305	6312	25 %	25 %	50 %	0 %	58038427
20	NC_006673	CCTG	2	8	6441	6448	0 %	25 %	25 %	50 %	58038427
21	NC_006673	GACT	2	8	6655	6662	25 %	25 %	25 %	25 %	58038427
22	NC_006673	TTTG	2	8	7310	7317	0 %	75 %	25 %	0 %	58038428
23	NC_006673	CAAA	2	8	8390	8397	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_006673	CGAT	2	8	8969	8976	25 %	25 %	25 %	25 %	58038429
25	NC_006673	GCAG	2	8	9120	9127	25 %	0 %	50 %	25 %	58038429
26	NC_006673	CGTC	2	8	9234	9241	0 %	25 %	25 %	50 %	58038429
27	NC_006673	GCGT	2	8	9398	9405	0 %	25 %	50 %	25 %	58038429
28	NC_006673	CTTC	2	8	9443	9450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_006673	TTGA	2	8	9532	9539	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006673	TGAT	2	8	9575	9582	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006673	TCCG	2	8	10489	10496	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_006673	GCTG	2	8	10986	10993	0 %	25 %	50 %	25 %	58038431
33	NC_006673	TCAT	2	8	11194	11201	25 %	50 %	0 %	25 %	58038431
34	NC_006673	GGGA	2	8	11772	11779	25 %	0 %	75 %	0 %	58038432
35	NC_006673	CATC	2	8	12112	12119	25 %	25 %	0 %	50 %	58038432
36	NC_006673	CCGG	2	8	12738	12745	0 %	0 %	50 %	50 %	58038433
37	NC_006673	GCTG	2	8	12903	12910	0 %	25 %	50 %	25 %	58038434
38	NC_006673	GGTC	2	8	13084	13091	0 %	25 %	50 %	25 %	58038434
39	NC_006673	TGAG	2	8	13545	13552	25 %	25 %	50 %	0 %	58038435
40	NC_006673	CTTG	2	8	14045	14052	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_006673	CTCC	2	8	14261	14268	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_006673	TGGC	2	8	14598	14605	0 %	25 %	50 %	25 %	58038436
43	NC_006673	TACG	2	8	14790	14797	25 %	25 %	25 %	25 %	58038436
44	NC_006673	CGCC	2	8	14820	14827	0 %	0 %	25 %	75 %	58038436
45	NC_006673	CAGG	2	8	14893	14900	25 %	0 %	50 %	25 %	58038436
46	NC_006673	GCCG	2	8	15138	15145	0 %	0 %	50 %	50 %	58038436
47	NC_006673	GACC	2	8	15219	15226	25 %	0 %	25 %	50 %	58038436
48	NC_006673	TTCC	2	8	15501	15508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_006673	GGAA	2	8	15512	15519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006673	CTGT	2	8	15664	15671	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_006673	TACG	2	8	15781	15788	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_006673	GGCA	2	8	15967	15974	25 %	0 %	50 %	25 %	58038437
53	NC_006673	TGGC	2	8	16108	16115	0 %	25 %	50 %	25 %	58038437
54	NC_006673	GGCG	2	8	16673	16680	0 %	0 %	75 %	25 %	58038438
55	NC_006673	GCCG	2	8	16841	16848	0 %	0 %	50 %	50 %	58038438
56	NC_006673	GCCA	2	8	16908	16915	25 %	0 %	25 %	50 %	58038438
57	NC_006673	GCTC	2	8	17134	17141	0 %	25 %	25 %	50 %	58038438
58	NC_006673	GATC	2	8	17582	17589	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_006673	AGCC	2	8	17590	17597	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_006673	GTTG	2	8	17688	17695	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006673	TTGA	2	8	17731	17738	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006673	CGAT	2	8	18216	18223	25 %	25 %	25 %	25 %	58038439
63	NC_006673	CGCC	2	8	18726	18733	0 %	0 %	25 %	75 %	58038439
64	NC_006673	CGGT	2	8	19032	19039	0 %	25 %	50 %	25 %	58038440
65	NC_006673	TCCG	2	8	19727	19734	0 %	25 %	25 %	50 %	58038441
66	NC_006673	GCGT	2	8	19964	19971	0 %	25 %	50 %	25 %	58038441
67	NC_006673	CGGC	2	8	20690	20697	0 %	0 %	50 %	50 %	58038442
68	NC_006673	GACA	2	8	20707	20714	50 %	0 %	25 %	25 %	58038442
69	NC_006673	CTGA	2	8	21366	21373	25 %	25 %	25 %	25 %	58038443
70	NC_006673	CCCG	2	8	21531	21538	0 %	0 %	25 %	75 %	58038443
71	NC_006673	TCTG	2	8	22844	22851	0 %	50 %	25 %	25 %	58038444
72	NC_006673	TAGC	2	8	23645	23652	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_006673	CTGG	2	8	23819	23826	0 %	25 %	50 %	25 %	58038445
74	NC_006673	TTTC	2	8	24279	24286	0 %	75 %	0 %	25 %	58038445
75	NC_006673	ACCT	2	8	24632	24639	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_006673	TAGA	2	8	25414	25421	50 %	25 %	25 %	0 %	58038446
77	NC_006673	GCCC	2	8	25489	25496	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
78	NC_006673	AGCT	2	8	25752	25759	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_006673	GACC	2	8	25867	25874	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_006673	CTCC	2	8	25919	25926	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
81	NC_006673	GATT	2	8	25974	25981	25 %	50 %	25 %	0 %	58038447
82	NC_006673	ACCG	2	8	26013	26020	25 %	0 %	25 %	50 %	58038447
83	NC_006673	CTCC	2	8	26064	26071	0 %	25 %	0 %	75 %	58038447
84	NC_006673	GATT	2	8	26119	26126	25 %	50 %	25 %	0 %	58038447
85	NC_006673	ACCG	2	8	26158	26165	25 %	0 %	25 %	50 %	58038447
86	NC_006673	CTCC	2	8	26209	26216	0 %	25 %	0 %	75 %	58038447
87	NC_006673	GACC	2	8	26301	26308	25 %	0 %	25 %	50 %	58038447
88	NC_006673	CTCC	2	8	26353	26360	0 %	25 %	0 %	75 %	58038447
89	NC_006673	GATT	2	8	26408	26415	25 %	50 %	25 %	0 %	58038447
90	NC_006673	ACCG	2	8	26447	26454	25 %	0 %	25 %	50 %	58038447
91	NC_006673	CTCC	2	8	26498	26505	0 %	25 %	0 %	75 %	58038447

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.