MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Geobacillus kaustophilus HTA426 plasmid pHTA426

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006509	AT	3	6	283	288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006509	TA	3	6	334	339	50 %	50 %	0 %	0 %	56410438
3	NC_006509	TA	3	6	368	373	50 %	50 %	0 %	0 %	56410438
4	NC_006509	AG	3	6	1386	1391	50 %	0 %	50 %	0 %	56410439
5	NC_006509	GT	3	6	2775	2780	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006509	CG	3	6	2834	2839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_006509	GT	3	6	5534	5539	0 %	50 %	50 %	0 %	56410442
8	NC_006509	GC	3	6	5817	5822	0 %	0 %	50 %	50 %	56410442
9	NC_006509	AT	3	6	6083	6088	50 %	50 %	0 %	0 %	56410443
10	NC_006509	TG	3	6	6744	6749	0 %	50 %	50 %	0 %	56410444
11	NC_006509	CA	3	6	6875	6880	50 %	0 %	0 %	50 %	56410444
12	NC_006509	AT	3	6	7276	7281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006509	AT	4	8	7885	7892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006509	AT	3	6	8068	8073	50 %	50 %	0 %	0 %	56410445
15	NC_006509	TA	3	6	8299	8304	50 %	50 %	0 %	0 %	56410445
16	NC_006509	GA	3	6	8476	8481	50 %	0 %	50 %	0 %	56410445
17	NC_006509	TC	4	8	10819	10826	0 %	50 %	0 %	50 %	56410446
18	NC_006509	AT	3	6	10908	10913	50 %	50 %	0 %	0 %	56410446
19	NC_006509	GT	3	6	11319	11324	0 %	50 %	50 %	0 %	56410446
20	NC_006509	TC	3	6	11844	11849	0 %	50 %	0 %	50 %	56410447
21	NC_006509	AT	3	6	11988	11993	50 %	50 %	0 %	0 %	56410447
22	NC_006509	AT	3	6	12345	12350	50 %	50 %	0 %	0 %	56410447
23	NC_006509	TG	3	6	12693	12698	0 %	50 %	50 %	0 %	56410447
24	NC_006509	TA	4	8	13313	13320	50 %	50 %	0 %	0 %	56410447
25	NC_006509	AT	3	6	13332	13337	50 %	50 %	0 %	0 %	56410447
26	NC_006509	TA	3	6	13543	13548	50 %	50 %	0 %	0 %	56410448
27	NC_006509	CT	3	6	13980	13985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_006509	CG	3	6	16392	16397	0 %	0 %	50 %	50 %	56410450
29	NC_006509	TA	4	8	17201	17208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006509	AT	3	6	17378	17383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006509	GC	3	6	17605	17610	0 %	0 %	50 %	50 %	56410451
32	NC_006509	GC	3	6	17679	17684	0 %	0 %	50 %	50 %	56410451
33	NC_006509	GC	3	6	18841	18846	0 %	0 %	50 %	50 %	56410452
34	NC_006509	TG	3	6	18964	18969	0 %	50 %	50 %	0 %	56410452
35	NC_006509	AT	3	6	19325	19330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006509	TA	3	6	19602	19607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006509	TA	3	6	19841	19846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006509	AC	3	6	20111	20116	50 %	0 %	0 %	50 %	56410453
39	NC_006509	AT	3	6	20900	20905	50 %	50 %	0 %	0 %	56410454
40	NC_006509	TC	3	6	22070	22075	0 %	50 %	0 %	50 %	56410454
41	NC_006509	AG	3	6	22155	22160	50 %	0 %	50 %	0 %	56410454
42	NC_006509	GT	3	6	22770	22775	0 %	50 %	50 %	0 %	56410455
43	NC_006509	AC	3	6	24901	24906	50 %	0 %	0 %	50 %	56410458
44	NC_006509	TC	3	6	25589	25594	0 %	50 %	0 %	50 %	56410458
45	NC_006509	TA	3	6	25829	25834	50 %	50 %	0 %	0 %	56410458
46	NC_006509	GC	3	6	26561	26566	0 %	0 %	50 %	50 %	56410458
47	NC_006509	TA	3	6	26765	26770	50 %	50 %	0 %	0 %	56410459
48	NC_006509	AC	3	6	28274	28279	50 %	0 %	0 %	50 %	56410460
49	NC_006509	AC	3	6	28309	28314	50 %	0 %	0 %	50 %	56410460
50	NC_006509	AT	3	6	28460	28465	50 %	50 %	0 %	0 %	56410460
51	NC_006509	AT	3	6	28700	28705	50 %	50 %	0 %	0 %	56410461
52	NC_006509	AT	3	6	29560	29565	50 %	50 %	0 %	0 %	56410462
53	NC_006509	GA	3	6	30273	30278	50 %	0 %	50 %	0 %	56410462
54	NC_006509	AT	3	6	30449	30454	50 %	50 %	0 %	0 %	56410462
55	NC_006509	TA	3	6	31108	31113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006509	AG	3	6	31222	31227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006509	AT	3	6	32639	32644	50 %	50 %	0 %	0 %	56410464
58	NC_006509	GA	3	6	33608	33613	50 %	0 %	50 %	0 %	56410464
59	NC_006509	AT	3	6	33882	33887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006509	TA	3	6	34146	34151	50 %	50 %	0 %	0 %	56410465
61	NC_006509	TA	3	6	35026	35031	50 %	50 %	0 %	0 %	56410465
62	NC_006509	AT	3	6	35514	35519	50 %	50 %	0 %	0 %	56410465
63	NC_006509	CA	3	6	35691	35696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_006509	CG	3	6	35983	35988	0 %	0 %	50 %	50 %	56410466
65	NC_006509	CG	3	6	36473	36478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_006509	TG	3	6	37396	37401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006509	AT	3	6	38093	38098	50 %	50 %	0 %	0 %	56410467
68	NC_006509	TC	3	6	38638	38643	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_006509	TA	3	6	40091	40096	50 %	50 %	0 %	0 %	56410468
70	NC_006509	CT	3	6	40490	40495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_006509	GA	3	6	40538	40543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006509	TC	3	6	43233	43238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_006509	AT	3	6	44126	44131	50 %	50 %	0 %	0 %	56410473
74	NC_006509	AG	3	6	45578	45583	50 %	0 %	50 %	0 %	56410475
75	NC_006509	GA	3	6	47341	47346	50 %	0 %	50 %	0 %	56410479

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.