MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Fibrella aestuarina BUZ 2 drat genome

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020054	CCGTGA	2	12	9423	9434	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020054	GATTAG	2	12	72289	72300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020054	AATAAA	2	12	75301	75312	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020054	GCGGTT	2	12	170006	170017	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_020054	AACCGC	2	12	170036	170047	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_020054	GTATGC	2	12	218366	218377	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_020054	ACTGAC	2	12	306816	306827	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020054	GTGGCG	2	12	308964	308975	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_020054	GTCGAC	2	12	336414	336425	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020054	CAGCGA	2	12	472998	473009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020054	GATACG	2	12	473049	473060	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020054	AGGCTG	2	12	480580	480591	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_020054	CGGTAT	2	12	496830	496841	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_020054	GGGGGC	2	12	540769	540780	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_020054	AAGCGA	2	12	609251	609262	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_020054	AAACCC	2	12	644952	644963	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020054	TTGGTA	2	12	658624	658635	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020054	GTGATT	2	12	665612	665623	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020054	GCCGGC	2	12	777107	777118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_020054	GCCCTG	2	12	813179	813190	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020054	TAGGTA	2	12	837475	837486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020054	CAATGG	2	12	914009	914020	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_020054	CAAAAA	2	12	942711	942722	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_020054	CAGGAC	2	12	955467	955478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020054	GTTTCA	2	12	974355	974366	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_020054	ATTGGT	2	12	980375	980386	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020054	GTCTGT	2	12	1151303	1151314	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_020054	GAAGAC	2	12	1192021	1192032	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_020054	CCGGTT	2	12	1202873	1202884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020054	TGGTTG	2	12	1229937	1229948	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020054	TGTTGG	2	12	1243992	1244003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020054	CGAAGC	2	12	1257654	1257665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020054	CGCTGG	2	12	1262874	1262885	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020054	TACCTA	2	12	1283141	1283152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020054	ACTAAC	2	12	1355919	1355930	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020054	CTGCAC	2	12	1418774	1418785	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020054	AATTCA	2	12	1491930	1491941	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_020054	GCCATA	2	12	1508444	1508455	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020054	GCCAAC	2	12	1562848	1562859	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_020054	GTTTAG	2	12	1571637	1571648	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020054	CGACTA	2	12	1609858	1609869	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020054	CAAAAA	2	12	1636150	1636161	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_020054	TTTATA	2	12	1675297	1675308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020054	CAAAAA	2	12	1680483	1680494	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_020054	TTCTTT	2	12	1682290	1682301	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_020054	GGTACT	2	12	1701890	1701901	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_020054	CGGTTT	2	12	1702249	1702260	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_020054	TTTACC	2	12	1711174	1711185	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020054	GTTTTT	2	12	1740579	1740590	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020054	TGCCGC	2	12	1753399	1753410	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_020054	GATTCT	2	12	1781871	1781882	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_020054	ACGGTT	2	12	1790607	1790618	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_020054	CAGATA	2	12	1827367	1827378	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_020054	AGTACT	2	12	1881584	1881595	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_020054	TTTATC	2	12	1895988	1895999	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_020054	TAGTCG	2	12	1971310	1971321	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_020054	GCTATA	2	12	1992865	1992876	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_020054	AAGCGA	2	12	2043408	2043419	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_020054	CTGTTA	2	12	2045896	2045907	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_020054	AGTTTG	2	12	2108783	2108794	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020054	CTGACC	2	12	2157364	2157375	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_020054	CATAAA	2	12	2159225	2159236	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_020054	CCTCAA	2	12	2247382	2247393	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020054	GGGCAA	2	12	2298248	2298259	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_020054	ACGTTC	2	12	2332090	2332101	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020054	GTTGGC	2	12	2379032	2379043	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_020054	AAAGGT	2	12	2392174	2392185	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020054	AGGAAA	2	12	2504409	2504420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020054	GGCGAA	2	12	2596762	2596773	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_020054	CGACCT	2	12	2614122	2614133	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_020054	ACGGTT	2	12	2621571	2621582	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_020054	TTGGTT	2	12	2641020	2641031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020054	TTCACA	2	12	2649559	2649570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020054	AACGCA	2	12	2722920	2722931	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020054	GGCCGG	2	12	2748920	2748931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020054	GTTCAC	2	12	2836775	2836786	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_020054	GTGATC	2	12	2844393	2844404	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_020054	GTTTGT	2	12	2945167	2945178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020054	ACAGCT	2	12	2947246	2947257	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020054	AATTTA	2	12	3005939	3005950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020054	GCTCAG	2	12	3012538	3012549	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_020054	TAATTA	2	12	3026168	3026179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020054	CAATGA	2	12	3112956	3112967	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_020054	TTCACT	2	12	3133057	3133068	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020054	AACAGA	2	12	3211780	3211791	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_020054	ACCTGC	2	12	3253104	3253115	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020054	CAGTAC	2	12	3340569	3340580	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_020054	GTGTTT	2	12	3340691	3340702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020054	CGTTCA	2	12	3368264	3368275	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_020054	CCCGAA	2	12	3372545	3372556	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_020054	TAGAAT	2	12	3406484	3406495	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020054	TAACCG	2	12	3465797	3465808	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020054	TGATAT	2	12	3468595	3468606	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020054	GGCTGG	2	12	3485945	3485956	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_020054	GGACGT	2	12	3506938	3506949	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_020054	CCCTCC	2	12	3507989	3508000	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
97	NC_020054	AACTAT	2	12	3542075	3542086	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_020054	GTCATG	2	12	3556035	3556046	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_020054	CAATGA	2	12	3556925	3556936	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_020054	TGGGTA	2	12	3618990	3619001	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020054	AACGCC	2	12	3680411	3680422	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020054	GAAGTG	2	12	3683089	3683100	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020054	CAACGG	2	12	3704017	3704028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_020054	GTCAGC	2	12	3819079	3819090	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_020054	GCCTAT	2	12	3839560	3839571	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_020054	TGCATC	2	12	3844228	3844239	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_020054	CTTTAA	2	12	3940210	3940221	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_020054	CGGAAA	2	12	3947912	3947923	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_020054	CTCCGC	2	12	3992792	3992803	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_020054	CATCGT	2	12	4031214	4031225	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_020054	ACATGA	2	12	4041779	4041790	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_020054	CTTATC	2	12	4059148	4059159	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_020054	CGTTGA	2	12	4061461	4061472	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_020054	CTGGAA	2	12	4063271	4063282	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_020054	AGCACC	2	12	4063743	4063754	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
116	NC_020054	AATCGA	2	12	4064921	4064932	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_020054	TGCCGG	2	12	4066117	4066128	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_020054	GTTAAC	2	12	4101085	4101096	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_020054	GCCTGA	2	12	4152588	4152599	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_020054	GCGGTG	2	12	4205083	4205094	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_020054	CATAGG	2	12	4221319	4221330	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_020054	GTACGC	2	12	4337236	4337247	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_020054	TTGACG	2	12	4337592	4337603	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_020054	CTCAAC	2	12	4378954	4378965	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020054	ATCTCA	2	12	4484520	4484531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_020054	TTGAGG	2	12	4521805	4521816	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020054	CGGTGC	2	12	4526577	4526588	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_020054	TGCCGT	2	12	4531222	4531233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_020054	TATAAA	2	12	4559810	4559821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020054	AGAAAT	2	12	4560630	4560641	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020054	CAATGA	2	12	4574683	4574694	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_020054	CATAAG	2	12	4581095	4581106	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_020054	AACCTT	2	12	4593563	4593574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_020054	ATCAAA	2	12	4636934	4636945	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_020054	AATCAA	2	12	4645211	4645222	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_020054	CAAGAA	2	12	4651060	4651071	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_020054	CGCTGG	2	12	4740503	4740514	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_020054	AAGCGG	2	12	4819151	4819162	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_020054	AAGCGG	2	12	4848042	4848053	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_020054	TCGTGA	2	12	4855404	4855415	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_020054	ATTTAC	2	12	4858748	4858759	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_020054	TGATCT	2	12	4865344	4865355	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_020054	GCTAGC	2	12	4904197	4904208	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_020054	TCACGG	2	12	4913921	4913932	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_020054	CACATC	2	12	4914396	4914407	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_020054	CTATGG	2	12	4927310	4927321	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_020054	CGCCTC	2	12	4932850	4932861	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_020054	CGCCTG	2	12	4967395	4967406	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
149	NC_020054	CTTGAA	2	12	4996111	4996122	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_020054	TGGTTT	2	12	5218191	5218202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020054	GCCTGT	2	12	5278048	5278059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_020054	TGTTTT	2	12	5278760	5278771	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020054	TTGCGC	2	12	5385537	5385548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_020054	GGAATT	2	12	5417357	5417368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_020054	TCATTA	2	12	5449492	5449503	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_020054	GGCAAT	2	12	5479511	5479522	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_020054	CCAAAC	2	12	5526904	5526915	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
158	NC_020054	ATGTAC	2	12	5556012	5556023	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_020054	AACAAA	2	12	5610725	5610736	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
160	NC_020054	TGCTTT	2	12	5621483	5621494	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
161	NC_020054	GGGCCG	2	12	5638649	5638660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_020054	CAAACC	2	12	5728887	5728898	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
163	NC_020054	GGCTTT	2	12	5770498	5770509	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
164	NC_020054	CAATGA	2	12	5791821	5791832	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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166	NC_020054	GGCCGC	2	12	5812964	5812975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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174	NC_020054	TCGCTT	2	12	6271008	6271019	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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178	NC_020054	GTACTA	2	12	6506511	6506522	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
179	NC_020054	TGAGAA	2	12	6565332	6565343	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.