MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica FSC200 chromosome

Total Repeats: 247

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019551	TATTTC	2	12	3093	3104	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_019551	GTTTTA	2	12	21691	21702	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019551	AAGGTT	2	12	24666	24677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019551	ATAAGT	2	12	37881	37892	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019551	TTAATT	2	12	50547	50558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019551	TAAATA	2	12	61636	61647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019551	CTTGAG	2	12	64455	64466	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_019551	CAGTTA	2	12	85166	85177	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_019551	AAAAAG	2	12	98250	98261	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019551	GTTTTA	2	12	100624	100635	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019551	AGCTTT	2	12	102042	102053	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_019551	AGAATA	2	12	126212	126223	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019551	TGAAAT	2	12	128518	128529	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019551	GATGGT	2	12	130099	130110	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019551	GTTTTA	2	12	130958	130969	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019551	TTTTAT	2	12	137076	137087	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019551	TTATAA	2	12	142838	142849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019551	ATAAAT	2	12	149773	149784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019551	ACTTTT	2	12	158723	158734	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_019551	GTTTTA	2	12	159348	159359	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019551	ACCTTA	2	12	160174	160185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019551	TAATTA	2	12	163865	163876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019551	ATTTAA	2	12	173084	173095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019551	GTTTTA	2	12	184661	184672	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019551	ATTTTT	2	12	216057	216068	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019551	TTTTGT	2	12	216574	216585	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019551	TTATGG	2	12	222123	222134	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019551	GTTTTA	2	12	248164	248175	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019551	TACTAT	2	12	276828	276839	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_019551	ATTTTA	2	12	277046	277057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019551	TGGTAA	2	12	294335	294346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019551	GATTTT	2	12	295158	295169	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019551	GTTTTA	2	12	301904	301915	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019551	GTTTTA	2	12	321269	321280	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019551	GCAACA	2	12	326659	326670	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019551	ATTAAT	2	12	327486	327497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019551	TAGTTT	2	12	328804	328815	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019551	TAAAAT	2	12	330896	330907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019551	TTAGAT	2	12	337667	337678	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019551	ATATTT	2	12	340297	340308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019551	ATTGAT	2	12	355447	355458	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019551	GTCTTG	2	12	360486	360497	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_019551	TTTAAA	2	12	377468	377479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019551	AGTAAC	2	12	410101	410112	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_019551	GTTTTA	2	12	410503	410514	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019551	CTTTTT	2	12	414438	414449	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_019551	AGAATA	2	12	419181	419192	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019551	TGAAAT	2	12	421487	421498	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019551	TAAAAT	2	12	426223	426234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019551	ATTTTT	2	12	426802	426813	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019551	AAGTTA	2	12	447760	447771	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019551	AAAAGT	2	12	489421	489432	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019551	TAATGA	2	12	491609	491620	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019551	AGTTGG	2	12	492011	492022	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019551	TAGAAG	2	12	497009	497020	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019551	GTTTTA	2	12	509424	509435	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019551	TAAATT	2	12	527456	527467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019551	TTTCAT	2	12	545054	545065	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_019551	ATTAAG	2	12	547877	547888	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019551	ACTTTA	2	12	560993	561004	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_019551	GTTTTA	2	12	598011	598022	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019551	TTTGTA	2	12	607954	607965	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019551	TGGATT	2	12	610523	610534	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019551	TTAATG	2	12	614633	614644	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019551	GATTTG	2	12	627741	627752	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019551	AAAACT	2	12	628064	628075	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_019551	TTAATA	2	12	631795	631806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019551	TAAAAA	2	12	634999	635010	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019551	ATGTTA	2	12	643771	643782	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019551	TAAAAA	2	12	697982	697993	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019551	GTTTTA	2	12	724837	724848	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019551	TAGAAT	2	12	747711	747722	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019551	ATTTTG	2	12	750498	750509	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019551	TTAAAA	2	12	751850	751861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019551	ACAGGT	2	12	764381	764392	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_019551	TTGCAG	2	12	766158	766169	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_019551	ATGAAA	2	12	769299	769310	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019551	TAGTTT	2	12	773364	773375	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019551	AACAAA	2	12	781330	781341	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_019551	GATTAT	2	12	781353	781364	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019551	GTGAAT	2	12	801873	801884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019551	TAATTT	2	12	807225	807236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019551	TATAAT	2	12	824541	824552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019551	TTAGTT	2	12	825955	825966	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019551	TATAAT	2	12	833982	833993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019551	TAAATA	2	12	838844	838855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019551	TATAGT	2	12	868657	868668	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019551	TAACAG	2	12	887690	887701	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_019551	ATATTT	2	12	891504	891515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019551	ATTTTT	2	12	899573	899584	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019551	TTATAT	2	12	908226	908237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019551	CATTAG	2	12	909259	909270	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_019551	CTTTTG	2	12	912618	912629	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_019551	TTTACT	2	12	915861	915872	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_019551	TTAGTT	2	12	930950	930961	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019551	TTTAAA	2	12	939012	939023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019551	ATTAGA	2	12	941698	941709	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019551	AAAATA	2	12	951508	951519	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019551	TATAAT	4	24	960370	960393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019551	GTTTTA	2	12	963104	963115	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019551	TTTGCT	2	12	966871	966882	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_019551	CTAAAA	2	12	968510	968521	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_019551	GTTTTA	2	12	980943	980954	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019551	AAGAAA	2	12	992271	992282	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019551	TTGATT	2	12	993336	993347	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019551	ACAAAC	2	12	994699	994710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019551	CTATAA	2	12	995181	995192	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_019551	AAAATT	2	12	997834	997845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019551	AGTATT	2	12	1012889	1012900	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019551	CCAAAT	2	12	1014017	1014028	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019551	CAGGTT	2	12	1024420	1024431	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_019551	ATATAA	2	12	1035616	1035627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019551	TCCATC	2	12	1036184	1036195	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_019551	TAAACT	2	12	1037381	1037392	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_019551	TTTGGC	2	12	1039232	1039243	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_019551	TTGATA	2	12	1044423	1044434	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019551	AGATAT	2	12	1044600	1044611	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019551	ATTAAT	2	12	1045211	1045222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019551	ACATTA	2	12	1045389	1045400	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_019551	GTACTT	2	12	1045654	1045665	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_019551	TTTAGA	2	12	1050489	1050500	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019551	TCAAAT	2	12	1050672	1050683	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_019551	ATATCA	2	12	1061616	1061627	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_019551	TAAGAA	2	12	1070161	1070172	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019551	ATTTAT	2	12	1072020	1072031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019551	GTTTTA	2	12	1097234	1097245	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019551	AGCTTT	2	12	1098652	1098663	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_019551	AGAATA	2	12	1122822	1122833	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019551	TGAAAT	2	12	1125128	1125139	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019551	ACAATT	2	12	1127256	1127267	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_019551	GTTTTA	2	12	1145638	1145649	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019551	TTAGCT	2	12	1160394	1160405	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_019551	TATCTA	2	12	1160476	1160487	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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138	NC_019551	TAATTA	2	12	1185988	1185999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019551	AATTTA	2	12	1212303	1212314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019551	TATAGG	2	12	1212885	1212896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019551	ATATTA	2	12	1223208	1223219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_019551	TAAAAA	2	12	1274536	1274547	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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247	NC_019551	TTAATT	2	12	1887198	1887209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.