MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica FSC200 chromosome

Total Repeats: 1765

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019551	ATTA	2	8	129	136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019551	ACTT	2	8	153	160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019551	TTAT	2	8	173	180	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019551	GAAT	2	8	2935	2942	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019551	TCAA	2	8	4008	4015	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_019551	CAAC	2	8	4047	4054	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019551	ATTA	2	8	4175	4182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019551	TGTT	2	8	4598	4605	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019551	GGTA	2	8	4608	4615	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019551	ATTT	2	8	5248	5255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019551	TTGA	2	8	5398	5405	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019551	TTTC	2	8	5535	5542	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_019551	TTTA	2	8	5698	5705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019551	ATTA	2	8	5764	5771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019551	TAGC	2	8	6443	6450	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_019551	ATTA	2	8	6693	6700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019551	ATGA	2	8	6844	6851	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019551	ATTA	2	8	8846	8853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019551	ATTT	2	8	11401	11408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019551	TCAA	2	8	16906	16913	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019551	CAAC	2	8	16945	16952	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019551	ATTA	2	8	17073	17080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019551	CAAA	2	8	19492	19499	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019551	TAAA	2	8	20747	20754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019551	TAAC	2	8	20769	20776	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_019551	ACCA	2	8	20907	20914	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_019551	TTAA	2	8	21230	21237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019551	TAAT	2	8	21412	21419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019551	GTTG	2	8	21540	21547	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019551	ATTG	2	8	21578	21585	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019551	AGTT	2	8	22467	22474	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019551	TTTA	2	8	22526	22533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019551	AAGA	2	8	22934	22941	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019551	TAAA	2	8	24439	24446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019551	TAAT	2	8	24501	24508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019551	TTAA	2	8	24563	24570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019551	TTTA	2	8	25065	25072	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019551	ATTA	2	8	25173	25180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019551	TCAG	2	8	25300	25307	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019551	TAAA	2	8	26225	26232	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019551	TATT	2	8	27313	27320	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019551	ATTA	2	8	32276	32283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019551	TTGT	2	8	34167	34174	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019551	ACTA	2	8	34190	34197	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_019551	ATTT	2	8	36808	36815	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019551	TATT	2	8	37206	37213	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019551	TTAT	2	8	40604	40611	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019551	TCTT	2	8	42898	42905	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019551	AATA	2	8	43408	43415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019551	GTAT	2	8	43439	43446	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019551	ACCT	2	8	47687	47694	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019551	AGTT	2	8	47778	47785	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019551	CTTT	2	8	49707	49714	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_019551	CCAT	2	8	49764	49771	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_019551	GTTT	2	8	49802	49809	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019551	CCTA	2	8	49933	49940	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_019551	CTAG	2	8	50120	50127	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019551	ATTT	2	8	50758	50765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019551	ATCT	2	8	50784	50791	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_019551	TAAT	2	8	51450	51457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019551	CTTG	2	8	51575	51582	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_019551	AAAT	2	8	51608	51615	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019551	AATA	2	8	52173	52180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019551	ACTC	2	8	52277	52284	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_019551	GTAT	2	8	52306	52313	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019551	TAAC	2	8	52318	52325	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_019551	ACCA	2	8	52391	52398	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_019551	AATT	2	8	52440	52447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019551	TCTT	2	8	53185	53192	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_019551	TAAA	2	8	53465	53472	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019551	TCAT	2	8	54030	54037	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_019551	AAGT	2	8	54161	54168	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019551	TCAA	2	8	55080	55087	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_019551	CAAC	2	8	55119	55126	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_019551	ATTA	2	8	55247	55254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019551	TATT	2	8	55695	55702	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019551	ATAA	2	8	55742	55749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019551	ATGG	2	8	55807	55814	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019551	CCAA	2	8	61348	61355	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_019551	TAGT	2	8	61418	61425	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019551	TAGA	2	8	61558	61565	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019551	ATTT	2	8	61619	61626	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019551	TAAA	2	8	62240	62247	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019551	TAAG	2	8	62291	62298	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019551	TTCT	2	8	62310	62317	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_019551	AAAT	2	8	62458	62465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019551	ATTT	2	8	63834	63841	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019551	TTTA	2	8	64564	64571	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019551	ACTG	2	8	64940	64947	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_019551	TTGG	2	8	65128	65135	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019551	ATAA	2	8	65286	65293	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019551	AGAA	2	8	65513	65520	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019551	TTTG	2	8	65901	65908	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019551	ATTT	2	8	66048	66055	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019551	TAAA	2	8	67746	67753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019551	TTAC	2	8	75619	75626	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_019551	AAAT	2	8	75902	75909	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019551	TTTA	2	8	75930	75937	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019551	TCTT	2	8	76090	76097	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_019551	AATA	2	8	76600	76607	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019551	GTAT	2	8	76631	76638	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019551	TCAA	2	8	77396	77403	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_019551	CAAC	2	8	77435	77442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_019551	ATTA	2	8	77563	77570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019551	TAGT	2	8	77824	77831	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019551	TTCA	2	8	77905	77912	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_019551	CTGA	2	8	78420	78427	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_019551	GAAA	2	8	78432	78439	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019551	TTTG	2	8	79369	79376	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019551	TTGG	2	8	79750	79757	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019551	TAAT	2	8	80104	80111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019551	TCAT	2	8	84155	84162	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_019551	TATG	2	8	92271	92278	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019551	GTTT	2	8	93226	93233	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019551	ATTA	2	8	99645	99652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019551	TAAT	2	8	100345	100352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019551	GTTG	2	8	100473	100480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019551	ATTG	2	8	100511	100518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019551	CTGC	2	8	101280	101287	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_019551	TAAA	2	8	101527	101534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019551	AGTA	2	8	101575	101582	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019551	ATAA	2	8	101763	101770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019551	ACTG	2	8	101970	101977	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_019551	TGAA	2	8	102158	102165	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019551	GTCA	2	8	102306	102313	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_019551	GCTT	2	8	115965	115972	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_019551	GATG	2	8	124881	124888	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019551	AGAT	2	8	125675	125682	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019551	TTTA	2	8	126465	126472	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019551	ACTC	2	8	126661	126668	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_019551	GCGA	2	8	126754	126761	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_019551	AAAG	2	8	127596	127603	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019551	TAGG	2	8	127944	127951	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019551	GTAG	2	8	127982	127989	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019551	GTAG	2	8	128134	128141	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019551	GAAC	2	8	129173	129180	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_019551	ATCT	2	8	129735	129742	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_019551	TTGA	2	8	130129	130136	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019551	TTTA	2	8	130172	130179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019551	AGAA	2	8	130185	130192	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019551	TAAT	2	8	130679	130686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019551	GTTG	2	8	130807	130814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019551	ATTG	2	8	130845	130852	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019551	TGGA	2	8	131889	131896	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019551	CTAG	2	8	132481	132488	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_019551	CTTG	2	8	132547	132554	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_019551	TATT	2	8	132714	132721	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019551	AATT	2	8	136853	136860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019551	GATA	2	8	136911	136918	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019551	TCTT	2	8	137026	137033	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_019551	ATTA	2	8	137455	137462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019551	ATAA	2	8	137489	137496	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_019551	AAAG	2	8	139932	139939	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_019551	ATCA	2	8	140360	140367	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
155	NC_019551	TCAA	2	8	141113	141120	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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