MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Flexibacter litoralis DSM 6794 chromosome

Total Repeats: 1522

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018018	AAATT	2	10	33	42	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018018	AATAA	2	10	2143	2152	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018018	TTTTG	2	10	6306	6315	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018018	CATTC	2	10	8494	8503	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_018018	TAGTT	2	10	11154	11163	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018018	TAAAT	2	10	11593	11602	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018018	AAATA	2	10	12542	12551	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018018	CATTT	2	10	12623	12632	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018018	TGAAA	3	15	16308	16322	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018018	AAATG	2	10	16416	16425	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018018	TTTAT	2	10	16456	16465	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018018	AAAAT	2	10	20934	20943	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018018	TTTTG	2	10	27261	27270	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018018	TAAAT	2	10	27352	27361	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018018	ATTGT	2	10	27720	27729	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018018	GCTTT	2	10	32935	32944	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_018018	TAGTT	2	10	35113	35122	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018018	ATTTA	2	10	43045	43054	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018018	TCAAA	2	10	44473	44482	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_018018	CAATT	2	10	46634	46643	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_018018	TTTAT	2	10	49369	49378	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018018	ATTTT	2	10	51735	51744	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018018	TTTAC	2	10	57164	57173	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_018018	TAAGG	2	10	60161	60170	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018018	ACTAA	2	10	60880	60889	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018018	TCGCT	2	10	73905	73914	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_018018	AAAAT	2	10	78533	78542	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018018	AAAAT	2	10	91598	91607	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018018	AGCGA	2	10	98463	98472	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_018018	TTTTA	2	10	99592	99601	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018018	AAAAG	2	10	100202	100211	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018018	GCTTT	2	10	100467	100476	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018018	AATTA	2	10	102562	102571	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018018	TTTAA	2	10	102784	102793	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018018	TAATT	2	10	103531	103540	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018018	CTTTT	2	10	110385	110394	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_018018	TCAAA	2	10	111803	111812	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_018018	ATTTT	2	10	111877	111886	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018018	TTAAA	2	10	112195	112204	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018018	TGGTT	2	10	113044	113053	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018018	TAACT	2	10	117370	117379	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018018	GTTTT	2	10	119286	119295	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018018	TTATT	2	10	120515	120524	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018018	ATTTT	2	10	129729	129738	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018018	TAATT	2	10	132052	132061	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018018	TTATT	2	10	137981	137990	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018018	TTAAA	2	10	140658	140667	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018018	TCAAA	2	10	142398	142407	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018018	TAAAA	2	10	144129	144138	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018018	GAATT	2	10	148994	149003	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018018	GTTTT	2	10	149983	149992	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018018	ATGTT	2	10	153948	153957	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018018	AAAAT	2	10	156207	156216	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018018	TTATG	2	10	157973	157982	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018018	TAGTT	2	10	158035	158044	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018018	AAAAT	2	10	158080	158089	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018018	ATTTT	2	10	158168	158177	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018018	TGTTC	2	10	162016	162025	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_018018	AGTAT	2	10	165144	165153	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018018	CCAAT	2	10	165333	165342	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_018018	CTTTA	2	10	193173	193182	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018018	AAAAT	2	10	204753	204762	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018018	ATTTT	2	10	205298	205307	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018018	TAAAT	2	10	205634	205643	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018018	TGGTT	2	10	216839	216848	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018018	AGCGA	2	10	223905	223914	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_018018	GAATT	2	10	233325	233334	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018018	AATTT	2	10	233359	233368	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018018	CACTA	2	10	244176	244185	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_018018	ATTTT	2	10	252936	252945	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018018	ATTAG	2	10	257997	258006	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018018	AGTAC	2	10	265598	265607	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018018	CAAAA	2	10	266743	266752	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_018018	TGATG	2	10	278695	278704	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018018	TAAAA	2	10	283602	283611	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018018	CAACA	2	10	283762	283771	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_018018	ACAAA	2	10	284194	284203	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018018	TTTTC	2	10	284589	284598	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_018018	TCAAT	2	10	285432	285441	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_018018	CGTAG	2	10	286262	286271	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_018018	TTATT	2	10	300607	300616	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018018	CGCTA	2	10	302877	302886	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_018018	CTACG	3	15	302939	302953	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_018018	CGAAA	2	10	307130	307139	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_018018	ATAAA	2	10	307466	307475	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018018	ATAAA	2	10	307822	307831	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018018	CGCTA	2	10	307908	307917	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_018018	CTACG	3	15	307969	307983	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_018018	ACAAA	2	10	308100	308109	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_018018	CGCTA	2	10	308957	308966	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_018018	CTACG	3	15	309019	309033	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_018018	CGCTA	2	10	313326	313335	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_018018	CTACG	3	15	313388	313402	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_018018	ATAAA	2	10	313778	313787	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018018	CGCTA	2	10	313864	313873	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_018018	CTACG	3	15	313926	313940	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_018018	CGAAA	2	10	315674	315683	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_018018	ATAAA	2	10	318921	318930	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018018	CGCTA	2	10	319007	319016	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_018018	CTACG	3	15	319069	319083	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_018018	CGCTA	2	10	320020	320029	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_018018	CTACG	3	15	320082	320096	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_018018	CGCTA	2	10	321221	321230	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_018018	CTACG	3	15	321283	321297	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_018018	ATAAA	2	10	322945	322954	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018018	CGCTA	2	10	323032	323041	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_018018	CTACG	3	15	323094	323108	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_018018	ATAAA	2	10	323484	323493	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018018	CGCTA	2	10	323570	323579	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_018018	CTACG	3	15	323632	323646	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_018018	ATAAA	2	10	324654	324663	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018018	CGCTA	2	10	324740	324749	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_018018	CTACG	3	15	324802	324816	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_018018	ATAAA	2	10	326805	326814	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018018	ATAAA	2	10	327946	327955	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018018	CGCTA	2	10	328887	328896	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_018018	CTACG	3	15	328949	328963	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_018018	ATAAA	2	10	329339	329348	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018018	CGCTA	2	10	330527	330536	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_018018	CTACG	3	15	330589	330603	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_018018	CGCTA	2	10	332405	332414	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_018018	CTACG	3	15	332467	332481	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_018018	ATAAA	2	10	333806	333815	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018018	CGCTA	2	10	334599	334608	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_018018	CTACG	3	15	334661	334675	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_018018	CGCTA	2	10	335836	335845	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_018018	CTACG	3	15	335898	335912	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_018018	TATAA	2	10	341223	341232	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018018	CTAAA	2	10	346070	346079	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_018018	AATTA	2	10	352086	352095	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018018	TTGGT	2	10	354519	354528	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018018	TAAAT	2	10	358830	358839	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018018	TTTCA	2	10	367359	367368	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_018018	AATGC	2	10	369943	369952	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_018018	AAAAT	2	10	371368	371377	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018018	AAATT	2	10	371395	371404	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018018	ATTTT	2	10	374160	374169	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018018	ACAAA	2	10	374899	374908	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_018018	AAAAC	2	10	376301	376310	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_018018	TATTT	2	10	378381	378390	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018018	GGCTT	2	10	379410	379419	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_018018	GTACA	2	10	379688	379697	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_018018	TTTTC	2	10	381790	381799	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_018018	GTTTT	2	10	383633	383642	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018018	TATTT	2	10	384253	384262	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018018	ATTTA	2	10	387928	387937	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018018	TCAAT	2	10	388543	388552	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_018018	ATTTT	2	10	390986	390995	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018018	GCTAA	2	10	399249	399258	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
150	NC_018018	TAAAA	2	10	399406	399415	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018018	ATTTT	2	10	400343	400352	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_018018	ATTTA	2	10	407206	407215	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_018018	ATTTT	2	10	422215	422224	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_018018	TTTTA	2	10	425252	425261	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_018018	TTGAT	2	10	476944	476953	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_018018	TTTAG	2	10	531712	531721	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_018018	TATTT	2	10	546674	546683	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_018018	TTCTT	2	10	550007	550016	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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191	NC_018018	ATTTG	2	10	560158	560167	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_018018	TACAA	2	10	565860	565869	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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197	NC_018018	TATTT	2	10	580484	580493	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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