MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella noatunensis subsp. orientalis str. Toba 04 chromosome

Total Repeats: 227

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017909	TTTGAT	2	12	3940	3951	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017909	TATTTA	2	12	17563	17574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017909	AAAGTT	2	12	25733	25744	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017909	TATGGT	2	12	33971	33982	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017909	AGCTTC	2	12	37432	37443	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017909	CTTGAG	2	12	40123	40134	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017909	TTTTTA	2	12	51198	51209	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017909	AAAGCT	2	12	59009	59020	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017909	ATTTTA	2	12	59678	59689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017909	GTTATA	2	12	69465	69476	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017909	ATTTAT	2	12	70190	70201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017909	TCTAAC	2	12	87430	87441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017909	TTTAAA	2	12	87947	87958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017909	AATGCA	2	12	88758	88769	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017909	AGATAA	2	12	110413	110424	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017909	TTTGAT	2	12	114673	114684	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017909	TGCTGG	2	12	115017	115028	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017909	AGAAAA	2	12	123363	123374	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017909	TAGATT	2	12	130473	130484	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017909	ATTTCC	2	12	132181	132192	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017909	TTAAAA	2	12	152851	152862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017909	TATATT	2	12	178973	178984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017909	TGAGAA	2	12	198424	198435	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017909	TTTTAT	2	12	257379	257390	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017909	AGATAA	2	12	266503	266514	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017909	TATTTT	2	12	267848	267859	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017909	GTAATG	2	12	268702	268713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017909	GGTAAT	2	12	269426	269437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017909	TAGCTA	2	12	278128	278139	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017909	AAAGAA	2	12	281070	281081	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017909	GGCAAA	2	12	281217	281228	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017909	AGAATT	2	12	295311	295322	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017909	GAGTTC	2	12	303223	303234	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017909	TCAACA	2	12	323387	323398	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017909	ATTAGC	2	12	335921	335932	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017909	GCTAAA	2	12	336013	336024	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017909	CTTAAA	2	12	337655	337666	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017909	GTTTTT	2	12	352698	352709	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017909	CTTTTA	2	12	353390	353401	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017909	ATTTTT	2	12	356297	356308	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017909	TATTGA	2	12	358038	358049	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017909	TGTATT	2	12	372343	372354	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017909	ATATTT	2	12	372375	372386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017909	AGTATG	2	12	372711	372722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017909	AAATTT	2	12	379721	379732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017909	AAATTA	2	12	389956	389967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017909	AGCTTT	2	12	396964	396975	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017909	TAAATA	2	12	409969	409980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017909	ATTCTT	2	12	410479	410490	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017909	ACAGAG	2	12	414082	414093	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017909	TATAAA	2	12	427861	427872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017909	ATAAAA	2	12	429033	429044	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017909	TAAAAT	2	12	434348	434359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017909	GCTTTA	2	12	439706	439717	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017909	TGCCCA	2	12	439774	439785	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017909	TTGAAT	2	12	440445	440456	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017909	GCTCTT	2	12	443942	443953	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017909	GATAGT	2	12	458781	458792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017909	ATTAAA	2	12	458894	458905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017909	ATAAAT	2	12	459082	459093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017909	ATTTCA	2	12	460272	460283	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017909	TAGTGA	2	12	465267	465278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017909	GGGTAT	2	12	471748	471759	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017909	CTTTTT	2	12	487662	487673	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017909	TTATCT	2	12	494093	494104	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017909	ATCACT	2	12	536635	536646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017909	TGATAG	2	12	538863	538874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017909	TACTTT	2	12	555132	555143	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017909	TGGTGT	2	12	559453	559464	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017909	TGAAGC	2	12	559489	559500	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017909	TGGTTT	2	12	560008	560019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017909	ATCCGT	2	12	560978	560989	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017909	AGTATG	2	12	565186	565197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017909	TTGGAG	2	12	589634	589645	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017909	TTTACA	2	12	610866	610877	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017909	GAATAA	2	12	635158	635169	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017909	ATTGAT	2	12	636005	636016	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017909	CCAATA	2	12	656908	656919	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017909	TAATTG	2	12	664802	664813	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017909	CATTAG	2	12	688164	688175	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017909	TAAAAA	2	12	693600	693611	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017909	ATTTGA	2	12	705982	705993	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017909	AGAAAA	2	12	707238	707249	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017909	TACATA	2	12	715603	715614	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017909	TTGTGT	2	12	743394	743405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017909	GTTATA	2	12	748656	748667	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017909	CTAGAT	2	12	757970	757981	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017909	TCTGAG	2	12	769965	769976	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017909	TATTTT	2	12	780917	780928	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017909	TTTGTA	2	12	783871	783882	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017909	GATAAA	2	12	785533	785544	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017909	ATTATA	2	12	807331	807342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017909	TTTGTA	2	12	836831	836842	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017909	ATTAGT	2	12	848014	848025	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017909	AACTGT	2	12	853833	853844	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017909	ATACTT	2	12	855315	855326	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017909	TAATGA	2	12	862139	862150	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017909	CTAATA	2	12	863597	863608	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017909	ATATTT	2	12	864003	864014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017909	CTTTTT	2	12	866035	866046	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017909	TATTTT	2	12	869976	869987	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017909	TAACTA	3	18	875748	875765	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017909	TCTAAG	2	12	878081	878092	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017909	AGAAGT	2	12	900656	900667	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017909	ATCAAA	2	12	956023	956034	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017909	TATATT	2	12	967900	967911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017909	TTGAGT	2	12	970261	970272	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017909	TGATTA	2	12	976708	976719	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017909	CAAATA	2	12	994368	994379	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017909	TTACTA	2	12	997844	997855	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017909	AGCTCT	2	12	1004678	1004689	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017909	TACACC	2	12	1009104	1009115	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017909	CTGTTG	2	12	1012141	1012152	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017909	CTAAAA	2	12	1013950	1013961	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017909	CATTAT	2	12	1025405	1025416	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017909	TTAAAT	2	12	1026365	1026376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017909	ATTTTG	2	12	1032857	1032868	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017909	AGTTAT	2	12	1032870	1032881	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017909	ATATTT	2	12	1043545	1043556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017909	TTAATA	2	12	1046511	1046522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017909	TTAGTT	2	12	1051701	1051712	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017909	AAGATA	2	12	1062470	1062481	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017909	ATCTTG	2	12	1063976	1063987	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017909	AATATC	2	12	1094270	1094281	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017909	ACTTCG	2	12	1097596	1097607	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017909	TAAGAG	2	12	1101059	1101070	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017909	ATTCCA	2	12	1106902	1106913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017909	TTTAAG	2	12	1107042	1107053	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017909	ATTCAG	2	12	1112147	1112158	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_017909	AACAGA	2	12	1112431	1112442	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_017909	AGTTTA	2	12	1170295	1170306	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017909	ACTATC	2	12	1176196	1176207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017909	ATGGCA	2	12	1177612	1177623	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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156	NC_017909	ATGCTC	2	12	1367316	1367327	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.