MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Fervidicoccus fontis Kam940 chromosome

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017461	TTATAA	2	12	11905	11916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017461	TGCACC	2	12	17167	17178	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017461	GGTTAA	2	12	21018	21029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017461	CTGAAT	2	12	24280	24291	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017461	TTTCAT	2	12	26003	26014	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017461	TTCCTT	2	12	37372	37383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017461	GACCTG	2	12	75750	75761	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017461	TCCTTT	2	12	117391	117402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017461	CTTTTT	2	12	166529	166540	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017461	ACATAA	2	12	180391	180402	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017461	ACTTAT	2	12	200705	200716	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017461	ATTAAT	2	12	210424	210435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017461	ATTTCA	2	12	210796	210807	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017461	AAAGGA	2	12	225169	225180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017461	AGAGGA	2	12	228494	228505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017461	CTAAGA	2	12	228765	228776	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017461	GATGAA	2	12	248620	248631	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017461	AAAAAT	2	12	262959	262970	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017461	TAACAT	2	12	287646	287657	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017461	ATTTTT	2	12	305418	305429	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017461	AAGTTA	2	12	305485	305496	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017461	TAACAA	2	12	327400	327411	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017461	TAACAT	2	12	333514	333525	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017461	TATTTT	2	12	335248	335259	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017461	TAATTT	2	12	336152	336163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017461	AAATTA	2	12	339397	339408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017461	AATATA	2	12	355077	355088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017461	TAAAAA	2	12	359935	359946	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017461	TAAGCT	2	12	383901	383912	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017461	TGAAGC	2	12	389610	389621	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017461	TTATAA	2	12	465928	465939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017461	AATATA	2	12	486906	486917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017461	ATTTTT	2	12	488148	488159	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017461	ATTATA	2	12	519160	519171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017461	ATATTT	2	12	546776	546787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017461	AAAAGA	2	12	548637	548648	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017461	AGAGAA	2	12	572346	572357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017461	TCCATG	2	12	579435	579446	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017461	TGAAGC	2	12	591779	591790	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017461	CCTTGC	2	12	600746	600757	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017461	GAGGAA	2	12	617580	617591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017461	AGCGAG	2	12	618032	618043	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017461	TAAATT	2	12	698057	698068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017461	CATTAA	2	12	734907	734918	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017461	GATAAA	2	12	760844	760855	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017461	AATATG	2	12	779556	779567	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017461	AATATC	2	12	784742	784753	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017461	CATCTC	2	12	786767	786778	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017461	ATTTGA	2	12	798181	798192	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017461	TATTTG	2	12	809946	809957	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017461	ATTTAA	2	12	809976	809987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017461	TATAAA	2	12	818136	818147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017461	AACAAA	2	12	836880	836891	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017461	ATTTTT	2	12	851021	851032	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017461	AAATTC	2	12	862376	862387	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017461	TAAAAA	2	12	868202	868213	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017461	ATAATT	2	12	892539	892550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017461	AATATT	2	12	903816	903827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017461	AAAAAT	2	12	904199	904210	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017461	ATAAAT	2	12	915323	915334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017461	AGAATT	2	12	936223	936234	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017461	AGAAAA	2	12	952541	952552	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017461	TAATTT	2	12	956643	956654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017461	ATTTTT	2	12	977872	977883	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017461	AAATTT	2	12	981827	981838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017461	ATTCTT	2	12	984663	984674	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017461	TAACAT	2	12	1001011	1001022	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017461	ACTTTT	2	12	1021792	1021803	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017461	TAAAAA	2	12	1035965	1035976	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017461	TCTTTT	2	12	1036132	1036143	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017461	ACTTTT	2	12	1049113	1049124	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017461	TGTTAA	2	12	1071567	1071578	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017461	TAAAAA	2	12	1144162	1144173	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017461	TTTTTC	2	12	1156965	1156976	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017461	ATCAAA	2	12	1158631	1158642	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017461	TATTTT	2	12	1188901	1188912	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017461	TATAAA	2	12	1203126	1203137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017461	TAATTC	2	12	1214297	1214308	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017461	ATTTTT	2	12	1246473	1246484	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017461	TTTTAA	2	12	1261396	1261407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017461	TGAAAA	2	12	1263514	1263525	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017461	TTTATA	2	12	1271024	1271035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017461	TAACAT	2	12	1318138	1318149	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.