MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella cf. novicida 3523 chromosome

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017449	GCTACA	2	12	7606	7617	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017449	TATAAA	2	12	18334	18345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017449	TAATTT	2	12	51405	51416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017449	TTTAAA	2	12	65433	65444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017449	GGCGTT	2	12	103305	103316	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017449	AATAAC	2	12	104904	104915	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017449	TAATAC	2	12	108498	108509	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017449	ATAAAT	2	12	127304	127315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017449	AAAATA	2	12	146330	146341	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017449	ATTTCC	2	12	151194	151205	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017449	TATAAA	2	12	173026	173037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017449	TAGTAT	2	12	177924	177935	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017449	ATATTT	2	12	216013	216024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017449	TTTTGT	2	12	216531	216542	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017449	TTATAA	2	12	287278	287289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017449	TTAAGA	2	12	301709	301720	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017449	TTAGAT	2	12	341319	341330	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017449	TCTAGT	2	12	363861	363872	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017449	TGAAAT	2	12	419054	419065	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017449	TATAAA	2	12	423014	423025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017449	AATTAT	2	12	476975	476986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017449	ATTTTA	2	12	499735	499746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017449	TTTTTC	2	12	546038	546049	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017449	TTATAT	2	12	662028	662039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017449	TTTTTG	2	12	669620	669631	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017449	AAGTAT	2	12	698178	698189	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017449	AAATAA	2	12	713620	713631	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017449	AGTTTG	2	12	716936	716947	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017449	ATATTA	2	12	760383	760394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017449	TAAATA	2	12	768861	768872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017449	TCTAAA	2	12	780877	780888	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017449	TGAGTT	2	12	787565	787576	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017449	TAAATA	2	12	800926	800937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017449	CTAATA	2	12	800959	800970	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017449	AGTACT	2	12	807279	807290	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017449	AGAATA	2	12	817080	817091	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017449	AGAATA	2	12	819035	819046	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017449	AGAATA	2	12	821642	821653	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017449	AGAATA	2	12	824255	824266	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017449	AGAATA	2	12	826228	826239	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017449	AAAATA	2	12	838087	838098	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017449	AAAATA	2	12	874446	874457	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017449	ATAATT	2	12	896437	896448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017449	TCAAAT	2	12	927096	927107	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017449	AGATTA	2	12	946848	946859	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017449	ATTAAG	2	12	980997	981008	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017449	TGCTAG	2	12	981735	981746	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017449	AAAACG	2	12	1034763	1034774	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017449	AATTAT	2	12	1094068	1094079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017449	AATATA	2	12	1121739	1121750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017449	ATTGCA	2	12	1126914	1126925	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017449	AGCTTC	2	12	1134575	1134586	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017449	TAAAAT	2	12	1134629	1134640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017449	AAATAA	2	12	1165517	1165528	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017449	CTATAA	2	12	1174791	1174802	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017449	TAAAAA	2	12	1259770	1259781	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017449	TATTTT	2	12	1262555	1262566	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017449	ATTTAA	2	12	1356634	1356645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017449	ATTTCA	2	12	1401257	1401268	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017449	AATTAT	2	12	1442679	1442690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017449	TAACAT	2	12	1476429	1476440	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017449	CATATA	2	12	1481445	1481456	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017449	ATTTTT	2	12	1483015	1483026	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017449	AGAAAT	2	12	1490657	1490668	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017449	CATTAA	2	12	1506178	1506189	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017449	CATGAC	2	12	1664215	1664226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017449	AAAAAC	2	12	1669054	1669065	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017449	CAAATA	2	12	1682543	1682554	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017449	TAAATA	2	12	1712784	1712795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017449	TTACAT	2	12	1754608	1754619	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017449	GACTGA	2	12	1817803	1817814	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017449	ATGATA	2	12	1829389	1829400	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017449	TTATCA	2	12	1829405	1829416	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017449	ATTATC	2	12	1835093	1835104	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017449	TAAAAA	2	12	1872447	1872458	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017449	ATTTCA	2	12	1882390	1882401	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017449	CTTTTT	2	12	1897086	1897097	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017449	TAAATA	2	12	1931458	1931469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017449	TGCTCT	2	12	1943136	1943147	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.