MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Fervidobacterium pennivorans DSM 9078 chromosome

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017095	AAGGGA	2	12	125643	125654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017095	TGGAGA	2	12	128981	128992	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017095	TACTTA	2	12	129415	129426	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017095	GTAATT	2	12	136064	136075	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017095	CAGATG	2	12	137082	137093	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017095	AAACGG	2	12	180113	180124	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017095	GAGGTG	2	12	231875	231886	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017095	GGCAGA	2	12	278780	278791	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017095	AAGCGA	2	12	280551	280562	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017095	TAACTC	2	12	295737	295748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017095	TATAAT	2	12	303417	303428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017095	TTTCTT	2	12	350928	350939	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017095	TTTGTT	2	12	475505	475516	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017095	CACAAA	2	12	620955	620966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017095	TTCCCT	2	12	620970	620981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017095	CTTTTT	2	12	635561	635572	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017095	CAAAAA	2	12	658984	658995	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017095	TTTTTC	2	12	703044	703055	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017095	GATGTT	2	12	720651	720662	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017095	TACGAA	2	12	730564	730575	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017095	AGGAAA	2	12	748351	748362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017095	AGGAAA	2	12	750800	750811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017095	ATAAAA	2	12	787726	787737	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017095	ATGAGA	2	12	836972	836983	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017095	AAAGAC	2	12	876022	876033	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017095	TTCCCT	2	12	910853	910864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017095	CTTTAT	2	12	916520	916531	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017095	TTTTAT	2	12	939960	939971	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017095	TTTTGG	2	12	999187	999198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017095	TATCAA	2	12	1094675	1094686	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017095	TATAAT	2	12	1108288	1108299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017095	CAAGAA	2	12	1162274	1162285	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017095	AAAAAG	2	12	1206733	1206744	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017095	GACCTT	2	12	1214661	1214672	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017095	AAGAAA	2	12	1217636	1217647	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017095	ATTTTT	2	12	1223378	1223389	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017095	ATTTTC	2	12	1247869	1247880	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017095	GGAAAA	2	12	1372287	1372298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017095	AGCTCA	2	12	1378623	1378634	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017095	ATTTTT	2	12	1425871	1425882	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017095	TATAAG	2	12	1501185	1501196	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017095	GGGGAT	2	12	1529916	1529927	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017095	CTAAAA	2	12	1577539	1577550	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017095	CTCGCC	2	12	1577565	1577576	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017095	CTAAAA	2	12	1578526	1578537	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017095	GTGTGA	2	12	1578817	1578828	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017095	CTTGAA	2	12	1612446	1612457	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017095	TCGCTT	2	12	1638005	1638016	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017095	TCTGCC	2	12	1640843	1640854	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017095	AGTTGA	2	12	1657642	1657653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017095	TAAAAA	2	12	1673906	1673917	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017095	TAAAGA	2	12	1742401	1742412	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017095	GTTTTT	2	12	1782834	1782845	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017095	GTTTTT	2	12	1791492	1791503	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017095	ATAAAA	2	12	1913152	1913163	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017095	AAAATT	2	12	1917819	1917830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017095	TAAACT	2	12	1925784	1925795	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017095	ACCCCC	2	12	1950087	1950098	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
59	NC_017095	TGAAAT	2	12	1962664	1962675	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.