MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Fervidobacterium pennivorans DSM 9078 chromosome

Total Repeats: 206

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017095	ACCCC	2	10	243	252	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
2	NC_017095	ATATA	2	10	2150	2159	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017095	ATAAA	2	10	9460	9469	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017095	ACAAA	2	10	35534	35543	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017095	AAAGT	2	10	128732	128741	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017095	TATTT	2	10	128780	128789	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017095	AGTAA	2	10	129032	129041	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017095	AAGAG	2	10	129061	129070	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017095	ATATA	2	10	136440	136449	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017095	AATTC	2	10	137288	137297	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017095	AGTGA	2	10	137801	137810	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017095	TGATA	2	10	145158	145167	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017095	CCAAG	2	10	155683	155692	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017095	GATGT	2	10	156215	156224	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017095	ATACC	2	10	159527	159536	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_017095	ATCCA	2	10	159586	159595	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017095	GAAAA	2	10	198450	198459	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017095	TATCC	2	10	221368	221377	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017095	TAAAA	2	10	236889	236898	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017095	ATATA	2	10	243688	243697	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017095	TTTTG	2	10	270816	270825	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017095	AACGC	2	10	280267	280276	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_017095	CTGAG	2	10	281433	281442	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017095	AGGGG	2	10	281798	281807	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017095	CCGAA	2	10	281816	281825	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017095	CATCC	2	10	282450	282459	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
27	NC_017095	CTGCC	2	10	291921	291930	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
28	NC_017095	GAAAA	2	10	310838	310847	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017095	AGTGT	2	10	323694	323703	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017095	TTTTG	2	10	350908	350917	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017095	TTTTG	2	10	354752	354761	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017095	TATAA	2	10	367247	367256	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017095	CATTG	2	10	371527	371536	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017095	TAAAA	2	10	376607	376616	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017095	TTTTA	2	10	424673	424682	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017095	AGATT	2	10	434249	434258	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017095	ATTTT	2	10	436412	436421	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017095	CAAAA	2	10	438103	438112	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017095	ACTGA	2	10	490475	490484	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017095	TAACA	2	10	505169	505178	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017095	CTCAA	2	10	521826	521835	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_017095	CTAAA	2	10	526010	526019	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017095	TCCAG	2	10	536385	536394	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_017095	TATGA	2	10	558016	558025	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017095	AAGCG	2	10	564739	564748	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017095	TTCCT	2	10	569712	569721	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_017095	TTTTC	2	10	582461	582470	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017095	ACAAT	2	10	583316	583325	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017095	ACTAT	2	10	583402	583411	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017095	GCCTT	2	10	583699	583708	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_017095	TATGT	2	10	584115	584124	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017095	GTGCG	2	10	584149	584158	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017095	GATAT	2	10	585055	585064	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017095	AGTTG	2	10	585332	585341	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017095	AATTA	2	10	596432	596441	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017095	CTTAA	2	10	599314	599323	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017095	TGCTT	2	10	611642	611651	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017095	GGCTT	2	10	626665	626674	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017095	CGGTA	2	10	627721	627730	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017095	GATAG	2	10	627757	627766	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017095	TTCAA	2	10	630104	630113	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017095	TTATA	2	10	655163	655172	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017095	AACGA	2	10	658409	658418	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017095	ATTTT	2	10	680159	680168	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017095	CTTTT	2	10	710291	710300	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017095	AAGAA	2	10	711250	711259	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017095	GTTTT	2	10	718039	718048	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017095	ATAAA	2	10	720667	720676	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017095	TGATA	2	10	720720	720729	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017095	ATACG	2	10	730684	730693	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017095	ATTTA	2	10	749921	749930	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017095	ACAAG	2	10	750162	750171	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017095	TTTTG	2	10	750469	750478	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017095	ATAAA	2	10	764992	765001	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017095	TGATA	2	10	765045	765054	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017095	GGTTG	2	10	767268	767277	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017095	TTCTG	2	10	780587	780596	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017095	CTATC	2	10	787019	787028	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_017095	CAAAC	2	10	787043	787052	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_017095	TTTTC	2	10	790629	790638	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017095	ATAAA	2	10	792848	792857	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017095	CTATC	2	10	792951	792960	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_017095	TCAAC	2	10	792990	792999	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_017095	TTATA	2	10	806091	806100	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017095	TTTTC	2	10	807355	807364	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017095	CGAAA	2	10	906146	906155	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017095	TTTTG	2	10	911050	911059	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017095	ACAAA	2	10	916448	916457	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017095	CTTTC	2	10	942557	942566	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_017095	TCGAT	2	10	946237	946246	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017095	AGATT	2	10	946410	946419	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017095	ATTAA	2	10	946807	946816	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017095	ATAAC	2	10	946901	946910	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017095	ACTTA	2	10	988690	988699	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017095	ATTTA	2	10	1029424	1029433	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017095	CTTTT	2	10	1029631	1029640	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017095	AAGTT	2	10	1060309	1060318	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017095	ATATA	2	10	1067964	1067973	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017095	AACTG	2	10	1086180	1086189	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017095	TTTCA	2	10	1105527	1105536	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017095	TAAAG	2	10	1108247	1108256	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017095	CTTAA	2	10	1111973	1111982	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017095	ACCGA	2	10	1112060	1112069	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_017095	CTCGC	2	10	1118599	1118608	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
105	NC_017095	TTCAT	2	10	1118728	1118737	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017095	TTTCC	2	10	1118892	1118901	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_017095	ATAAA	2	10	1127389	1127398	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017095	TGATA	2	10	1127442	1127451	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017095	TTTTC	2	10	1140630	1140639	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017095	AGAAA	2	10	1167832	1167841	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017095	TAAAA	2	10	1180774	1180783	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017095	CAAAG	2	10	1182107	1182116	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017095	TACAA	2	10	1182164	1182173	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017095	GGGAG	2	10	1182177	1182186	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017095	ATTAT	2	10	1190726	1190735	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017095	ATTTT	2	10	1198535	1198544	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017095	ACAAA	2	10	1203838	1203847	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017095	AGAAA	2	10	1207167	1207176	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017095	AAAAG	2	10	1217522	1217531	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017095	TAAAT	2	10	1222562	1222571	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017095	AAGAA	2	10	1222681	1222690	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017095	AGAAA	2	10	1233111	1233120	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017095	TGTGT	2	10	1239866	1239875	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017095	GTCAA	2	10	1248063	1248072	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017095	CTTTT	2	10	1297490	1297499	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017095	GTTCA	2	10	1353110	1353119	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017095	AGCTA	2	10	1364292	1364301	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017095	GGCAG	2	10	1379633	1379642	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017095	CAAAA	2	10	1385267	1385276	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017095	ACAGC	2	10	1410045	1410054	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_017095	TTTAT	2	10	1427249	1427258	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017095	GGCAG	2	10	1471021	1471030	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017095	TTTTA	2	10	1476564	1476573	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017095	CAAAA	2	10	1481547	1481556	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017095	TGTGG	2	10	1497271	1497280	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017095	TAAAA	2	10	1497473	1497482	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017095	AGGGG	2	10	1501200	1501209	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017095	CTGCC	2	10	1521842	1521851	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
139	NC_017095	ACCAC	2	10	1532557	1532566	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
140	NC_017095	AAAGA	2	10	1565050	1565059	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017095	ACCTC	2	10	1573034	1573043	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
142	NC_017095	TCAAG	2	10	1577125	1577134	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017095	AGGAA	2	10	1577418	1577427	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017095	GATGT	2	10	1581815	1581824	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017095	GCCAG	2	10	1591302	1591311	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.