MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. tularensis TI0902 chromosome

Total Repeats: 184

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016937	TATTTC	2	12	2865	2876	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_016937	GTTTTA	2	12	8679	8690	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016937	ATGATA	2	12	24619	24630	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016937	ATGATA	2	12	30309	30320	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016937	TCCATG	2	12	46956	46967	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016937	TTTATA	2	12	85264	85275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016937	TAGTGC	2	12	135518	135529	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_016937	ATTTTT	2	12	136176	136187	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016937	TCCACA	2	12	164744	164755	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016937	ATAAAC	2	12	173971	173982	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_016937	TGTTTT	2	12	182287	182298	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016937	GTTTTA	2	12	186322	186333	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016937	ATTTCC	2	12	200182	200193	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016937	TAAAGA	2	12	210897	210908	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016937	TTTCAT	2	12	220395	220406	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_016937	ATCGCT	2	12	225088	225099	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016937	TATAAA	2	12	225288	225299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016937	GTTTTA	2	12	234588	234599	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016937	ACCTTA	2	12	235414	235425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016937	TTTAAA	2	12	254791	254802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016937	GTTTTA	2	12	259899	259910	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016937	TTATAA	2	12	271797	271808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016937	ATAAAT	2	12	278713	278724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016937	GTTTTA	2	12	287897	287908	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016937	ATTTTT	2	12	319314	319325	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016937	TTTTGT	2	12	319831	319842	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016937	GTTTTA	2	12	351428	351439	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016937	CGGTGC	2	12	358194	358205	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016937	TGGGCT	2	12	359307	359318	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_016937	GTTTTA	2	12	363804	363815	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016937	TAAGTT	2	12	364976	364987	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016937	GTTTTA	2	12	379196	379207	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016937	TAAAAT	2	12	384971	384982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016937	ATTTTT	2	12	385550	385561	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016937	AAGTTA	2	12	404502	404513	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016937	AAATAT	2	12	441073	441084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016937	AAAAGT	2	12	447717	447728	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016937	TAGAAT	2	12	460716	460727	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016937	TTTAAT	2	12	460775	460786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016937	AAAATC	2	12	501160	501171	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_016937	ACAAGC	2	12	516923	516934	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016937	AAAAAT	2	12	518962	518973	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016937	ATTAGA	2	12	536815	536826	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016937	TAGCTA	2	12	540919	540930	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_016937	ACAGCC	2	12	549221	549232	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_016937	ATTTAG	2	12	551894	551905	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016937	GATATT	2	12	552442	552453	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016937	TATAAT	2	12	557795	557806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016937	GTTTTA	2	12	578712	578723	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016937	AGTTAT	2	12	579453	579464	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016937	TATTTT	2	12	592299	592310	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016937	GATTTA	2	12	593026	593037	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016937	TTTGAT	2	12	601029	601040	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016937	TAAATA	2	12	611178	611189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016937	CTTATA	2	12	611198	611209	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_016937	GATGTT	2	12	662288	662299	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016937	ATATTT	2	12	662939	662950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016937	GATATA	2	12	670881	670892	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016937	ATTTTT	2	12	671008	671019	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016937	TTATAT	2	12	679660	679671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016937	CATTAG	2	12	680701	680712	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_016937	TTTACT	2	12	687285	687296	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_016937	TTAGTT	2	12	702359	702370	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016937	TTTAAA	2	12	710417	710428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016937	AAATAA	2	12	724626	724637	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016937	GCTTTA	2	12	733966	733977	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_016937	CATAAA	2	12	738106	738117	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_016937	GTTTTA	2	12	785315	785326	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016937	TTTGAT	2	12	799158	799169	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016937	GTTTTA	2	12	799548	799559	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016937	TGTATA	2	12	822867	822878	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016937	GTTTTA	2	12	839530	839541	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016937	ATTAAT	2	12	864622	864633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016937	TAGTTT	2	12	865940	865951	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016937	TTAGAT	2	12	873855	873866	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016937	TATAGC	2	12	876103	876114	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_016937	ATATTT	2	12	876491	876502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016937	ATTGAT	2	12	891658	891669	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016937	TTATAG	2	12	896397	896408	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016937	GTCTTG	2	12	896696	896707	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_016937	AGTAAC	2	12	930846	930857	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_016937	GTTTTA	2	12	931248	931259	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016937	AGTAAT	2	12	942715	942726	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016937	TTAAAT	2	12	951896	951907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016937	TAATTA	2	12	978162	978173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016937	TATTAA	2	12	978964	978975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016937	AGATTT	2	12	996555	996566	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016937	TAATCT	2	12	998901	998912	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_016937	ATTTTT	2	12	1006681	1006692	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016937	TATTTA	3	18	1010409	1010426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016937	AAATGG	2	12	1010662	1010673	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016937	ATTTGG	2	12	1041614	1041625	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016937	TAATAC	2	12	1042756	1042767	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_016937	AATTTT	2	12	1057821	1057832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016937	AATCAA	2	12	1062321	1062332	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_016937	TTTAAC	2	12	1073013	1073024	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_016937	CTCTCA	2	12	1074808	1074819	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_016937	CAAAGT	2	12	1075967	1075978	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_016937	AAATTA	2	12	1084679	1084690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016937	GTTTTA	2	12	1085749	1085760	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016937	TGATAT	2	12	1098982	1098993	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016937	AATTTG	2	12	1109009	1109020	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016937	TCTAAA	2	12	1109193	1109204	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_016937	AAAAAT	2	12	1111006	1111017	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016937	ACAAGT	2	12	1114198	1114209	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_016937	TAATGT	2	12	1114466	1114477	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016937	ATTAAT	2	12	1114644	1114655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016937	TATCAA	2	12	1115432	1115443	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_016937	AACTAA	2	12	1131747	1131758	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_016937	AAATTA	2	12	1150212	1150223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016937	AAATAT	2	12	1166179	1166190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016937	TTTTTG	2	12	1175728	1175739	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016937	CTGCAA	2	12	1189944	1189955	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016937	TACCTG	2	12	1191731	1191742	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016937	ATTTTA	2	12	1204265	1204276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016937	CAAAAT	2	12	1205641	1205652	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_016937	GTTTTA	2	12	1250626	1250637	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016937	GTTTTA	2	12	1283908	1283919	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016937	ATTTCA	2	12	1308478	1308489	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_016937	CTTATT	2	12	1310782	1310793	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_016937	TTTAAA	2	12	1323833	1323844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016937	ATACAA	2	12	1331868	1331879	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_016937	ATCAAA	2	12	1334974	1334985	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_016937	TTTTGT	2	12	1353807	1353818	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016937	TATAAA	2	12	1357112	1357123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016937	TTATTT	2	12	1360035	1360046	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016937	ATTTCA	2	12	1375597	1375608	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_016937	CTTATT	2	12	1377901	1377912	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.