MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella tularensis TIGB03 chromosome

Total Repeats: 457

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016933	CATCT	2	10	3558	3567	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_016933	TTCTT	2	10	3630	3639	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_016933	AATCA	2	10	4491	4500	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_016933	ATGGT	2	10	4525	4534	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016933	ATTAA	2	10	4677	4686	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016933	TAGCT	2	10	5952	5961	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016933	AAAGA	2	10	8714	8723	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016933	CTTTT	2	10	14515	14524	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_016933	ATTAA	2	10	24609	24618	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016933	GATTT	2	10	46157	46166	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016933	TTGGT	2	10	46358	46367	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016933	GATAG	2	10	47056	47065	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016933	TTAAT	2	10	47459	47468	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016933	AATTT	2	10	59593	59602	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016933	AAACT	2	10	85589	85598	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_016933	TTTAT	2	10	88703	88712	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016933	GTTTT	2	10	92935	92944	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016933	AATGT	2	10	96742	96751	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016933	AATAT	2	10	96771	96780	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016933	CATCT	2	10	102587	102596	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_016933	TTCTT	2	10	102659	102668	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_016933	TTTCT	2	10	103751	103760	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_016933	TTGAT	2	10	105659	105668	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016933	GTATG	2	10	135004	135013	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016933	GGTGT	2	10	136246	136255	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016933	CATCT	2	10	143939	143948	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_016933	TTCTT	2	10	144011	144020	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_016933	TTTAT	2	10	168746	168755	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016933	TAAAA	2	10	173764	173773	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016933	AGCTA	2	10	174600	174609	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_016933	AGTAA	2	10	174790	174799	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016933	AATGT	2	10	182255	182264	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016933	AAAGA	2	10	186357	186366	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016933	TAAAT	2	10	195458	195467	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016933	ATGTA	2	10	200263	200272	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016933	TTATC	2	10	200273	200282	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_016933	TTTAT	2	10	202366	202375	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016933	TAATG	2	10	202400	202409	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016933	TAAAG	2	10	203747	203756	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016933	CTTTT	2	10	218654	218663	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_016933	AGAAA	2	10	219067	219076	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016933	AAAGA	2	10	234623	234632	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016933	CATCT	2	10	243110	243119	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_016933	TTCTT	2	10	243182	243191	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_016933	AATAA	2	10	244930	244939	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016933	ATTTT	2	10	249615	249624	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016933	TCAAG	2	10	250226	250235	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_016933	GCTAG	2	10	251122	251131	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_016933	CTATA	2	10	254137	254146	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_016933	TATTT	2	10	254753	254762	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016933	AAAGA	2	10	259934	259943	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016933	CTATA	2	10	260984	260993	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_016933	CATCT	2	10	269837	269846	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_016933	TTCTT	2	10	269909	269918	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_016933	AAAAT	2	10	270385	270394	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016933	ATTTT	2	10	287224	287233	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016933	AAAGA	2	10	287932	287941	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016933	TTTAT	2	10	288978	288987	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016933	ATACG	2	10	289542	289551	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_016933	TTAAG	2	10	293849	293858	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016933	AGATT	2	10	293943	293952	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016933	AAAAC	2	10	300501	300510	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_016933	AAGCA	2	10	307841	307850	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_016933	AAAAT	2	10	319240	319249	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016933	AGAAA	2	10	323946	323955	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016933	TAATA	2	10	337589	337598	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016933	GAAAA	2	10	341793	341802	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016933	ATTTT	2	10	342264	342273	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016933	ATTTC	2	10	350981	350990	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_016933	AAAGA	2	10	351463	351472	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016933	AGAAA	2	10	352087	352096	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016933	TCAAT	2	10	352732	352741	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_016933	CATCT	2	10	354469	354478	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_016933	TTCTT	2	10	354541	354550	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_016933	CTTTT	2	10	357005	357014	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_016933	CATCT	2	10	357676	357685	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_016933	TTCTT	2	10	357748	357757	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_016933	CCAAG	2	10	358532	358541	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_016933	AAAGA	2	10	363839	363848	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016933	TTTAT	2	10	364885	364894	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016933	ATACG	2	10	365449	365458	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_016933	TTAAG	2	10	369756	369765	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016933	AGATT	2	10	369850	369859	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016933	AAAAC	2	10	376408	376417	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_016933	AAGCA	2	10	383748	383757	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_016933	AAAAT	2	10	395147	395156	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016933	AGAAA	2	10	399853	399862	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016933	TAATA	2	10	413496	413505	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016933	GAAAA	2	10	417700	417709	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016933	ATTTT	2	10	418171	418180	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016933	ATTTC	2	10	426888	426897	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_016933	AAAGA	2	10	427370	427379	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016933	AGAAA	2	10	427994	428003	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016933	TCAAT	2	10	428639	428648	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_016933	CATCT	2	10	430376	430385	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_016933	TTCTT	2	10	430448	430457	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_016933	CTTTT	2	10	432912	432921	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_016933	CATCT	2	10	433583	433592	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_016933	TTCTT	2	10	433655	433664	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_016933	CCAAG	2	10	434439	434448	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_016933	AAAGA	2	10	439746	439755	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016933	GTAAA	2	10	452748	452757	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016933	TAAGA	2	10	454685	454694	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016933	AAAGA	2	10	455138	455147	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016933	TAATG	2	10	456759	456768	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016933	TTTCT	2	10	457650	457659	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_016933	TAATT	2	10	459506	459515	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016933	TTTCT	2	10	460275	460284	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_016933	TGAAA	2	10	472255	472264	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016933	TAATT	2	10	477018	477027	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016933	TTTTA	2	10	484944	484953	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016933	AGTTA	2	10	484963	484972	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016933	TTAAC	2	10	512279	512288	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_016933	CAAGA	2	10	517720	517729	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_016933	AGTGT	2	10	517843	517852	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016933	TTTAA	2	10	520753	520762	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016933	TTTTA	2	10	528850	528859	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016933	CATCT	2	10	529644	529653	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_016933	TTCTT	2	10	529716	529725	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_016933	TCTCT	2	10	530437	530446	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_016933	AACTT	2	10	535211	535220	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_016933	TTTTC	2	10	557328	557337	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_016933	AAACT	2	10	577049	577058	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_016933	ATTAT	2	10	584932	584941	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016933	ATTTA	2	10	584949	584958	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016933	CTAGG	2	10	589667	589676	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_016933	ATTTG	2	10	594556	594565	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016933	TTTGT	2	10	597681	597690	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016933	ACAAA	2	10	600660	600669	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_016933	ATTTA	2	10	603285	603294	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016933	ATTAT	2	10	608779	608788	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016933	CATCT	2	10	610752	610761	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_016933	TTCTT	2	10	610824	610833	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_016933	TAATT	2	10	625212	625221	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016933	ATTAG	2	10	626330	626339	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016933	AAGAA	2	10	628488	628497	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016933	AGCTA	2	10	638717	638726	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_016933	GTATT	2	10	646048	646057	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016933	AACAA	2	10	651106	651115	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_016933	AAAGA	2	10	654654	654663	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016933	AGAAA	2	10	658540	658549	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016933	ATTTG	2	10	659831	659840	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016933	GTTTT	2	10	663474	663483	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016933	TTTTA	2	10	675172	675181	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016933	TTGAT	2	10	676580	676589	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016933	CTTTT	2	10	680630	680639	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_016933	TAAAA	2	10	680770	680779	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016933	TATCT	2	10	681039	681048	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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431	NC_016933	TTCTT	2	10	1876927	1876936	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
432	NC_016933	AAGTC	2	10	1877801	1877810	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
433	NC_016933	TATTT	2	10	1892327	1892336	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_016933	TTCTT	2	10	1908046	1908055	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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457	NC_016933	TTTTA	2	10	1968232	1968241	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.