MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Filifactor alocis ATCC 35896 chromosome

Total Repeats: 172

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016630	AAAAAT	2	12	16494	16505	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016630	ATTAAA	2	12	28006	28017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016630	TAAAAG	2	12	28103	28114	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016630	TGATAC	2	12	31620	31631	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_016630	TTTTCT	2	12	35712	35723	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016630	TGAGAG	2	12	42553	42564	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016630	AGGGAG	2	12	59694	59705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016630	AAATTG	2	12	101075	101086	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016630	ATGAGT	2	12	101335	101346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016630	AAGAGA	2	12	105575	105586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016630	CTGTTT	2	12	118574	118585	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_016630	TTTGGT	4	24	118589	118612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016630	ATTTTT	2	12	118672	118683	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016630	TAAAAA	2	12	129964	129975	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016630	AAAATG	2	12	152831	152842	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016630	GATTGT	2	12	206524	206535	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016630	ATAGAA	2	12	213446	213457	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016630	TTCATT	2	12	220921	220932	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_016630	AAAATA	2	12	268667	268678	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016630	GTATTT	2	12	281595	281606	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016630	TTAAAA	2	12	295455	295466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016630	TATACT	2	12	295507	295518	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_016630	TTCATT	2	12	303540	303551	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_016630	TCCCCA	2	12	317344	317355	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_016630	ATTTTT	2	12	331691	331702	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016630	ATTTCT	2	12	409500	409511	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_016630	TCAATC	2	12	412773	412784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016630	TTGTAT	2	12	414026	414037	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016630	TTGTAT	2	12	418569	418580	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016630	CTAATT	2	12	420629	420640	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_016630	TTCATT	2	12	432685	432696	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_016630	TTTCTT	2	12	436373	436384	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_016630	TATAAT	2	12	452465	452476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016630	TTCATT	2	12	463896	463907	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_016630	TAAAAG	2	12	473134	473145	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016630	TAAAAA	2	12	483070	483081	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016630	GCATCG	2	12	489096	489107	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016630	TTTCTT	2	12	494468	494479	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_016630	TACTTA	2	12	510624	510635	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_016630	TTTCTA	2	12	563141	563152	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_016630	TTTTCT	2	12	593047	593058	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_016630	TATTTT	2	12	595292	595303	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016630	TTTTTA	2	12	600408	600419	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016630	CTTTTT	2	12	617238	617249	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_016630	ATTCCA	2	12	619148	619159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016630	ATCAAT	2	12	622018	622029	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_016630	TATCAT	2	12	625910	625921	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016630	AAAAAT	2	12	654253	654264	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016630	CTATTC	2	12	654294	654305	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016630	TTCTCT	2	12	661354	661365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016630	CTTTTT	2	12	667786	667797	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_016630	CAAGGA	2	12	700280	700291	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_016630	AAAAGC	2	12	700516	700527	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_016630	CCTGCG	2	12	716422	716433	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016630	TCGCTT	2	12	718385	718396	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016630	CTTTCG	2	12	718795	718806	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016630	ATAAGG	2	12	726119	726130	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016630	TGAATT	2	12	729377	729388	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016630	ATTCTC	2	12	735151	735162	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016630	GAATCA	2	12	735343	735354	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_016630	TTTTCT	2	12	760661	760672	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_016630	CCTGCG	2	12	761654	761665	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016630	TCGCTT	2	12	763617	763628	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016630	CTTTCG	2	12	764027	764038	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016630	TATTTT	2	12	775064	775075	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016630	TGTTTT	2	12	776145	776156	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016630	TAATAG	2	12	789142	789153	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016630	CATCAG	2	12	797810	797821	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016630	TGTCGG	2	12	806149	806160	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_016630	ATAGAA	2	12	817599	817610	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016630	AACTTG	2	12	834678	834689	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_016630	TTTACT	2	12	838588	838599	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_016630	AAAAAT	2	12	845755	845766	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016630	AGTTTA	2	12	862924	862935	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016630	TTTTGA	2	12	873351	873362	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016630	CTGTTC	2	12	892095	892106	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016630	TTTTCT	2	12	910986	910997	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_016630	ATCATA	2	12	912138	912149	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_016630	AAAGTT	2	12	914128	914139	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016630	CTATTC	2	12	917786	917797	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016630	CCTGCG	2	12	920960	920971	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
82	NC_016630	TCGCTT	2	12	922923	922934	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016630	CTTTCG	2	12	923333	923344	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016630	AATTAT	2	12	926957	926968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016630	AAAATA	2	12	927473	927484	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016630	CACAAA	2	12	928398	928409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016630	ATTTTA	2	12	947671	947682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016630	ACATTA	2	12	947695	947706	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_016630	TGAAAA	2	12	973144	973155	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016630	TTGTTC	2	12	981837	981848	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_016630	ATTCAA	2	12	997744	997755	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_016630	CTTTTC	5	30	1019864	1019893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016630	TTAATT	2	12	1020071	1020082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016630	TAATAC	2	12	1067982	1067993	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_016630	ATTAAA	2	12	1080838	1080849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016630	TTTTTC	2	12	1093913	1093924	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_016630	GTGTAT	2	12	1103948	1103959	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016630	ATTTCA	2	12	1104783	1104794	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_016630	TTTCTA	2	12	1114935	1114946	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_016630	ATCAAA	2	12	1114962	1114973	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_016630	TTCATT	2	12	1130639	1130650	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_016630	TTGTTT	2	12	1132940	1132951	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016630	TACTTG	2	12	1134065	1134076	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_016630	TAAGAA	2	12	1135970	1135981	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016630	TTTTCT	2	12	1140554	1140565	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_016630	CCTGCG	2	12	1141342	1141353	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
107	NC_016630	TCGCTT	2	12	1143305	1143316	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016630	CTTTCG	2	12	1143715	1143726	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016630	ATAAGG	2	12	1151038	1151049	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016630	ATAAAT	2	12	1155117	1155128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016630	ATTCTC	2	12	1160070	1160081	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016630	GAATCA	2	12	1160262	1160273	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_016630	ACATTA	2	12	1253256	1253267	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_016630	AACTAA	2	12	1301096	1301107	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_016630	TCATAT	2	12	1304581	1304592	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_016630	CAATTT	2	12	1304675	1304686	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_016630	CAAATA	2	12	1313123	1313134	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_016630	GAAAAT	2	12	1356742	1356753	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016630	TTTATC	2	12	1401774	1401785	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_016630	CAATCA	2	12	1408861	1408872	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016630	AAAAAG	2	12	1476572	1476583	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016630	CAGAAA	2	12	1495859	1495870	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_016630	AAAATG	2	12	1504055	1504066	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016630	ATCCTT	2	12	1511121	1511132	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016630	TTCTCT	2	12	1511244	1511255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016630	AAAATG	2	12	1533033	1533044	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016630	CTTTTC	2	12	1536732	1536743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016630	ATTTTT	2	12	1543097	1543108	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016630	AGAATT	3	18	1555348	1555365	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.