MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella sp. TX077308 chromosome

Total Repeats: 187

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015696	TAGCT	2	10	8098	8107	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015696	GTATG	2	10	26698	26707	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015696	AAAAG	2	10	37067	37076	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015696	AATTT	2	10	43590	43599	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015696	GATTT	2	10	56459	56468	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015696	TTTAG	2	10	60643	60652	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015696	TTAAA	2	10	62021	62030	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015696	TTGTT	2	10	69894	69903	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015696	CTATA	2	10	69905	69914	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015696	AAAAT	2	10	69929	69938	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015696	ATATT	2	10	70541	70550	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015696	TTAAA	2	10	70558	70567	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015696	GCCCT	2	10	107056	107065	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_015696	ATATT	2	10	111812	111821	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015696	CTAAA	2	10	111829	111838	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015696	TGTAA	2	10	112409	112418	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015696	CTTAG	2	10	112502	112511	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015696	TTTGA	2	10	121956	121965	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015696	ATTAA	2	10	122086	122095	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015696	ATTTT	2	10	129280	129289	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015696	ATGTA	2	10	158496	158505	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015696	TTATC	2	10	158506	158515	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_015696	TAATG	2	10	160637	160646	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015696	AATTT	2	10	163224	163233	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015696	ATTTT	2	10	172619	172628	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015696	AAATT	2	10	194403	194412	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015696	ATTTA	2	10	194624	194633	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015696	TCTTT	2	10	233847	233856	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015696	AAAAC	2	10	233937	233946	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015696	TAATA	2	10	237403	237412	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015696	ATTTT	2	10	242071	242080	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015696	TTTAA	2	10	250818	250827	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015696	TATTC	2	10	253586	253595	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015696	TTAAT	2	10	267191	267200	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015696	ATTTT	2	10	286308	286317	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015696	GTTTA	2	10	309380	309389	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015696	ATATT	2	10	326661	326670	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015696	TAGTA	2	10	343242	343251	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015696	ATTTA	2	10	344548	344557	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015696	AATTG	2	10	349516	349525	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015696	AAATT	2	10	356923	356932	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015696	ATTTA	2	10	367265	367274	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015696	ATTTA	2	10	377385	377394	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015696	TAAAA	2	10	383329	383338	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015696	CTAAT	2	10	396064	396073	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_015696	TTAAT	2	10	406073	406082	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015696	ATTAT	2	10	407575	407584	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015696	TTAAT	2	10	407609	407618	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015696	AACTA	2	10	407637	407646	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_015696	GATAT	2	10	407754	407763	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015696	TTAAG	2	10	408651	408660	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015696	TATTT	2	10	420475	420484	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015696	TATTT	2	10	435366	435375	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015696	ATCTT	2	10	437317	437326	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_015696	TAGAT	2	10	457727	457736	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015696	AAATA	2	10	482344	482353	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015696	CTTAA	2	10	483739	483748	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_015696	TACTT	2	10	524364	524373	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_015696	TTTTA	2	10	542205	542214	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015696	AGTTG	2	10	553211	553220	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015696	AAAAT	2	10	580440	580449	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015696	AATTA	2	10	585940	585949	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015696	TTTAA	2	10	595036	595045	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015696	ATCTA	2	10	602632	602641	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_015696	TAATT	2	10	602642	602651	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015696	GAGCT	2	10	642957	642966	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_015696	AATAA	2	10	643052	643061	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015696	TAAAA	2	10	648294	648303	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015696	ATCTA	2	10	655628	655637	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_015696	AATGT	2	10	675644	675653	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015696	AAATA	2	10	686536	686545	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015696	TGATA	2	10	695456	695465	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015696	TAGCT	2	10	708406	708415	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_015696	AATGA	2	10	712321	712330	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015696	TTAAA	2	10	713325	713334	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015696	TAGAT	2	10	723084	723093	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015696	ATTAA	2	10	725085	725094	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015696	ATTAT	2	10	737085	737094	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015696	AACTA	2	10	746089	746098	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_015696	TATTT	2	10	760054	760063	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015696	ATTCA	2	10	843011	843020	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_015696	TTAAT	2	10	853044	853053	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015696	ATGAA	2	10	904375	904384	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015696	AATTA	2	10	918958	918967	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015696	TTAAT	2	10	921669	921678	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015696	TTCGC	2	10	922429	922438	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_015696	TCATA	2	10	925426	925435	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_015696	AAAAC	2	10	927781	927790	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_015696	TGATA	2	10	934565	934574	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015696	TTATT	2	10	946919	946928	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015696	ATTAT	2	10	951040	951049	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015696	AAAAG	2	10	957811	957820	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015696	TAATT	2	10	964105	964114	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015696	TATTT	2	10	990289	990298	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015696	TTAAA	2	10	1000350	1000359	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015696	ATTTG	2	10	1039423	1039432	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015696	TTATT	2	10	1053655	1053664	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015696	TCATT	2	10	1054517	1054526	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015696	TTTAT	2	10	1068419	1068428	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015696	AAAAG	2	10	1072196	1072205	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015696	AATTT	2	10	1081613	1081622	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015696	TTTAT	2	10	1081628	1081637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015696	TTTCT	2	10	1095388	1095397	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_015696	ATTTG	2	10	1095539	1095548	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015696	ATTAA	2	10	1095658	1095667	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015696	ATAAA	2	10	1096978	1096987	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015696	TTATA	2	10	1097009	1097018	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015696	TCTTT	2	10	1123409	1123418	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_015696	TTAAA	2	10	1130103	1130112	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015696	AAATT	2	10	1131151	1131160	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015696	TGTTA	2	10	1135640	1135649	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015696	GCATA	2	10	1150326	1150335	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_015696	TTAAG	2	10	1152442	1152451	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015696	TTAAA	2	10	1164194	1164203	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015696	TATTT	2	10	1173551	1173560	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015696	TGACT	2	10	1183251	1183260	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_015696	TTGAA	2	10	1183462	1183471	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015696	TAAAT	2	10	1203636	1203645	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015696	ATTTT	2	10	1214804	1214813	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015696	TTTAT	2	10	1214821	1214830	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015696	ATAGA	2	10	1214935	1214944	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015696	ATTTG	2	10	1217938	1217947	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015696	TTTGA	2	10	1224917	1224926	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015696	ATAAG	2	10	1243590	1243599	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015696	TTAAA	2	10	1244239	1244248	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015696	GTATA	2	10	1272642	1272651	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015696	ATATT	2	10	1301232	1301241	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015696	ATATA	2	10	1318634	1318643	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015696	CAATA	2	10	1318664	1318673	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015696	ATTTG	2	10	1362225	1362234	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015696	AAATA	2	10	1377225	1377234	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015696	TAACC	2	10	1383804	1383813	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_015696	TAAAT	2	10	1407490	1407499	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015696	AATAT	2	10	1408548	1408557	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015696	AATCA	2	10	1408655	1408664	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_015696	TTATA	2	10	1417105	1417114	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015696	ATTTT	2	10	1432981	1432990	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015696	ATATC	2	10	1433076	1433085	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_015696	AAATT	2	10	1435858	1435867	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015696	TACAC	2	10	1447612	1447621	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_015696	CTCAC	2	10	1454816	1454825	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
142	NC_015696	TTTAA	2	10	1454837	1454846	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015696	AATAT	2	10	1467867	1467876	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015696	AATTA	2	10	1472420	1472429	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015696	TAAAT	2	10	1479436	1479445	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015696	ATACT	2	10	1513371	1513380	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.