MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Flexistipes sinusarabici DSM 4947 chromosome

Total Repeats: 200

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015672	TGAAGT	2	12	45048	45059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015672	GGGAAT	2	12	62559	62570	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015672	AGTCAA	2	12	99417	99428	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015672	AGGCAA	2	12	99461	99472	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015672	AGGAAA	2	12	99473	99484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015672	AGGTAG	2	12	99491	99502	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015672	TCTAAA	2	12	146494	146505	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015672	GTAACT	2	12	146621	146632	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015672	GCACTT	2	12	158944	158955	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015672	GCACTT	2	12	163843	163854	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015672	CTGGGA	2	12	182495	182506	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_015672	TTAATA	2	12	230282	230293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015672	GAGTAA	2	12	236404	236415	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015672	ATTTAA	2	12	240516	240527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015672	AGGTTG	2	12	255914	255925	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015672	AAGTGC	2	12	271550	271561	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015672	TGAAGT	2	12	283357	283368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015672	TCCACT	3	18	300506	300523	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015672	AGGCAG	2	12	306983	306994	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015672	TAGAGG	10	60	306998	307057	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015672	TAAAGG	2	12	307058	307069	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015672	TTTATT	2	12	317323	317334	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015672	CCTTTC	2	12	324641	324652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015672	CCTTTC	2	12	334364	334375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015672	TTCACA	2	12	350094	350105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015672	CTTATA	2	12	352317	352328	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015672	TTTATT	2	12	352690	352701	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015672	ACCTTT	2	12	382825	382836	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015672	TGCCTC	2	12	383079	383090	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015672	AGGTAA	2	12	404137	404148	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015672	CCTAAA	2	12	404528	404539	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015672	TTTTAA	2	12	404762	404773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015672	ACCTTT	4	24	406695	406718	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015672	CCTATG	2	12	406720	406731	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015672	GCGTGA	2	12	409898	409909	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015672	AGTGAG	2	12	409911	409922	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015672	TATTAA	2	12	424071	424082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015672	AGGTTG	3	18	463837	463854	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015672	TTCACT	3	18	464116	464133	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015672	ACTGTC	2	12	469923	469934	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015672	TTCACT	3	18	469938	469955	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015672	AGTGCA	2	12	527958	527969	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015672	TTTTCG	2	12	549827	549838	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015672	TTTAAT	2	12	549983	549994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015672	ATTTTT	2	12	568911	568922	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015672	ACGTGA	2	12	574136	574147	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015672	GCGTGA	2	12	574148	574159	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015672	ATACCG	2	12	586937	586948	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015672	TCTGCT	2	12	631825	631836	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015672	TATGAA	2	12	647130	647141	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015672	AAGGTA	2	12	654963	654974	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015672	CTTTTC	2	12	660112	660123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015672	TGTTTA	2	12	677307	677318	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015672	TTAGGT	2	12	681447	681458	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015672	CAATAG	2	12	681968	681979	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015672	AAATTT	2	12	726782	726793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015672	CTTTAA	2	12	727252	727263	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_015672	AGTGGC	2	12	753512	753523	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_015672	TTGTGT	2	12	753723	753734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015672	GTTTTG	2	12	759720	759731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015672	TGAAGA	2	12	760562	760573	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015672	GTGATG	2	12	777783	777794	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015672	TAAAAC	2	12	796798	796809	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_015672	AGGTAG	3	18	796896	796913	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015672	CAAAGG	2	12	796965	796976	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_015672	GCAAAG	2	12	807674	807685	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_015672	AGGTAG	2	12	807787	807798	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015672	AGGCAA	3	18	807812	807829	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015672	GAAGTG	2	12	808098	808109	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015672	CCTCAA	4	24	811496	811519	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015672	AGGTAG	2	12	859958	859969	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015672	CAGATG	2	12	867521	867532	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_015672	AGTGAA	4	24	874860	874883	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015672	TTTCAC	2	12	882290	882301	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015672	AGTATT	2	12	882532	882543	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015672	TTTGTT	2	12	884766	884777	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015672	AAAAGC	2	12	893578	893589	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_015672	ATTGAA	2	12	922689	922700	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015672	TAAAAT	2	12	957365	957376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015672	AAGTGC	2	12	976204	976215	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_015672	TAACTC	2	12	982023	982034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015672	ATTTTT	2	12	989779	989790	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015672	AATGCA	2	12	990031	990042	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_015672	ATATTT	2	12	1004520	1004531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015672	GTAAGT	2	12	1006508	1006519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015672	GTGTGG	2	12	1008044	1008055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015672	AACTAA	2	12	1011645	1011656	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_015672	AAAAGC	2	12	1122087	1122098	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_015672	AAAAGC	2	12	1123784	1123795	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_015672	AAGTGC	2	12	1144946	1144957	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_015672	TTTCCC	2	12	1156793	1156804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015672	AGGTTT	2	12	1168316	1168327	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015672	TATCAA	2	12	1204685	1204696	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_015672	CCTCTA	4	24	1208840	1208863	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015672	CTTCTG	2	12	1227906	1227917	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015672	TTTACC	2	12	1230761	1230772	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015672	TTTCAT	2	12	1230954	1230965	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_015672	TAGAGG	3	18	1236236	1236253	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015672	GTATTG	2	12	1258551	1258562	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015672	TAAAAA	2	12	1299656	1299667	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015672	TACCTA	3	18	1309811	1309828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015672	CTTTAC	2	12	1327927	1327938	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015672	AGTGAA	2	12	1339073	1339084	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015672	ACCTTT	2	12	1342459	1342470	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015672	CCTTTG	2	12	1342478	1342489	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015672	CCTTTA	3	18	1342490	1342507	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015672	CCTTTG	2	12	1342508	1342519	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015672	GAAAAG	2	12	1361087	1361098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015672	AAAAGC	2	12	1361141	1361152	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_015672	TAACTT	2	12	1395329	1395340	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_015672	TAAAGG	3	18	1397693	1397710	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015672	TAGAGG	2	12	1397711	1397722	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015672	TCCACA	2	12	1397826	1397837	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_015672	AGCACC	2	12	1397852	1397863	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015672	ACCTTT	3	18	1426462	1426479	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015672	AATTCC	2	12	1429494	1429505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015672	AATTCC	2	12	1430308	1430319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015672	GTTATT	2	12	1437203	1437214	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015672	ACCTTT	4	24	1449222	1449245	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015672	GCCTTT	3	18	1449246	1449263	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015672	GCCTCT	2	12	1449264	1449275	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015672	TTTTAA	2	12	1453926	1453937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015672	TTTTTA	2	12	1554958	1554969	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015672	TTTACC	3	18	1591640	1591657	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015672	TGCCTC	3	18	1591660	1591677	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015672	TGCTTT	2	12	1591690	1591701	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_015672	TTACCT	2	12	1621880	1621891	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015672	ATCATA	2	12	1655733	1655744	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_015672	AATTTA	2	12	1698461	1698472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015672	TTTGTT	2	12	1730742	1730753	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015672	CAAAAA	2	12	1738096	1738107	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_015672	GGTTTT	2	12	1744419	1744430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015672	CTGATT	2	12	1744445	1744456	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_015672	ACCTTT	2	12	1755450	1755461	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015672	TCATCT	2	12	1770329	1770340	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015672	TGTCAT	2	12	1777138	1777149	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_015672	TAATCA	2	12	1846329	1846340	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_015672	CCTTTG	2	12	1853199	1853210	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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140	NC_015672	AAGTGA	2	12	1862386	1862397	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015672	AGTGAG	2	12	1866067	1866078	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015672	GAAGGT	2	12	1902016	1902027	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015672	ACCTTT	2	12	1929191	1929202	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_015672	TAGTCA	2	12	1988011	1988022	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_015672	ATTTTA	2	12	2008014	2008025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015672	TACCTC	2	12	2008213	2008224	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_015672	ACTGTC	2	12	2015856	2015867	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_015672	CCTTAA	3	18	2020264	2020281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_015672	CCTTTG	2	12	2020282	2020293	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_015672	CCTTTG	2	12	2021735	2021746	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_015672	GAAGTA	2	12	2032112	2032123	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015672	AGTGAC	2	12	2032188	2032199	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_015672	AACACC	2	12	2032259	2032270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_015672	ACCTTT	2	12	2032362	2032373	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_015672	CTTTGC	2	12	2032421	2032432	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_015672	AGAAAA	2	12	2052213	2052224	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015672	TGCAGA	2	12	2057647	2057658	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
158	NC_015672	GACAAA	2	12	2057850	2057861	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_015672	AACCTT	2	12	2087414	2087425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_015672	CCTATA	2	12	2092864	2092875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_015672	TTTTGT	2	12	2100221	2100232	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015672	AAGTGC	2	12	2101736	2101747	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_015672	ACATAA	2	12	2111577	2111588	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
164	NC_015672	CCTTTA	2	12	2122004	2122015	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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166	NC_015672	CCTTTA	2	12	2122356	2122367	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_015672	CCTTTA	2	12	2122476	2122487	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_015672	CCTTTA	3	18	2124805	2124822	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_015672	CCTTTG	3	18	2124841	2124858	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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172	NC_015672	AGGTTG	2	12	2126703	2126714	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_015672	CCTTTA	5	30	2127211	2127240	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.