MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ferrimonas balearica DSM 9799 chromosome

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014541	TGAAAT	2	12	43435	43446	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014541	GGCCAG	2	12	51731	51742	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014541	GTTCCC	2	12	80829	80840	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014541	AACGAT	2	12	218027	218038	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014541	CGTTTT	2	12	260386	260397	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014541	TGAAAT	2	12	267856	267867	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014541	GTCAAC	2	12	326188	326199	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014541	TGAAAT	2	12	336392	336403	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014541	TCCTGA	2	12	342207	342218	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014541	ATGACC	2	12	342407	342418	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014541	GATCCG	2	12	445303	445314	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014541	AACCGG	2	12	474318	474329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014541	AGAGCG	2	12	523218	523229	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014541	CAATTG	2	12	654007	654018	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014541	TGATCG	2	12	664804	664815	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014541	GATCAA	2	12	689650	689661	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014541	ATCCGG	2	12	695038	695049	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014541	GGGGCC	2	12	741939	741950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014541	CCTCGC	2	12	746324	746335	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_014541	TTGTGA	2	12	790566	790577	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014541	GATCGG	2	12	792522	792533	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014541	GTTGGC	2	12	848622	848633	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014541	ATCCTT	2	12	849982	849993	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014541	TGAAAT	2	12	882264	882275	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014541	GAATCC	2	12	883455	883466	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014541	ATCATT	2	12	909258	909269	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014541	TTTTTC	2	12	946076	946087	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014541	GTAAAG	2	12	981571	981582	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014541	GTTTTT	2	12	1015337	1015348	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014541	CATTGC	2	12	1026111	1026122	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014541	AAAAGG	2	12	1028811	1028822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014541	GTAAAG	2	12	1094299	1094310	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014541	AAAGAG	2	12	1127675	1127686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014541	TTAACG	2	12	1189844	1189855	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014541	GGAGCG	2	12	1238527	1238538	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014541	GAGCGA	2	12	1239802	1239813	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014541	ATAACA	2	12	1260667	1260678	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014541	CAAACG	2	12	1336362	1336373	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014541	TCGATT	2	12	1375390	1375401	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014541	AAACCC	2	12	1622893	1622904	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014541	ACCCTC	2	12	1761497	1761508	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_014541	CAAGAT	2	12	1761812	1761823	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014541	AAGAGC	2	12	1761880	1761891	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014541	TTCGCT	2	12	1783964	1783975	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014541	CATGCG	2	12	1787904	1787915	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014541	CCGGGG	2	12	1808322	1808333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014541	TGCCGC	2	12	1825307	1825318	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014541	TTCACC	2	12	1861414	1861425	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_014541	CAGTCA	2	12	1893771	1893782	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014541	ACGCGT	2	12	1955418	1955429	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014541	ATGAAT	2	12	2006767	2006778	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014541	ATTCAC	2	12	2014774	2014785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014541	CTGGCA	2	12	2021549	2021560	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014541	AGGGGA	2	12	2082564	2082575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014541	TCACCG	2	12	2114461	2114472	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014541	GAAAAA	2	12	2165635	2165646	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014541	TCCCAT	2	12	2317386	2317397	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014541	TTGTGG	2	12	2355728	2355739	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014541	TTGAAG	2	12	2400709	2400720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014541	ACAATG	2	12	2463535	2463546	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014541	AAAGCG	2	12	2465345	2465356	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014541	TCCCGT	2	12	2546336	2546347	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014541	AAAAGC	2	12	2549613	2549624	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014541	TTGTTT	2	12	2574302	2574313	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014541	GACAGG	2	12	2575674	2575685	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014541	GTTCCA	2	12	2649479	2649490	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014541	ATTTCA	2	12	2653256	2653267	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014541	CAAAAA	2	12	2681832	2681843	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_014541	CCCCCG	2	12	2703728	2703739	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
70	NC_014541	TACATA	2	12	2744654	2744665	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_014541	CCTTAC	2	12	2744988	2744999	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014541	CCTTAC	2	12	2745257	2745268	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014541	ATACAA	2	12	2773116	2773127	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_014541	ATATCA	2	12	2845054	2845065	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_014541	GGGACT	2	12	2852437	2852448	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014541	GAACGT	2	12	2985266	2985277	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014541	CCGAGC	2	12	3033024	3033035	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014541	CCGAGC	2	12	3033307	3033318	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_014541	CCGAGC	2	12	3033534	3033545	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_014541	CCGAGC	2	12	3033761	3033772	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014541	CAGCGG	2	12	3071407	3071418	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014541	AGGGCC	2	12	3072504	3072515	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014541	CTTGCC	2	12	3076698	3076709	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014541	TGGCTT	2	12	3091632	3091643	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014541	TGCGAT	2	12	3100927	3100938	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_014541	GCCTCC	2	12	3160347	3160358	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_014541	CCCTCC	2	12	3282014	3282025	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
88	NC_014541	TTGTGG	2	12	3352974	3352985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014541	GATCAA	2	12	3360100	3360111	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_014541	TTTCCT	2	12	3377584	3377595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014541	GCCTGA	2	12	3399215	3399226	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014541	GTCAAT	2	12	3444816	3444827	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014541	TGAACC	2	12	3528861	3528872	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014541	ATGAAT	2	12	3532945	3532956	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014541	TCGGCC	2	12	3602353	3602364	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
96	NC_014541	GTTATC	2	12	3616766	3616777	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014541	CTGGTA	2	12	3653549	3653560	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_014541	TCCCTT	2	12	3729361	3729372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014541	ATTTCA	2	12	3744667	3744678	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014541	TGGAGA	2	12	3779461	3779472	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014541	GATGCC	2	12	3779561	3779572	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014541	GCTCCA	2	12	3779842	3779853	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014541	TCCCAG	2	12	3789686	3789697	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014541	CAATAC	2	12	3936550	3936561	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014541	AAAATA	2	12	3936868	3936879	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014541	GACGAT	2	12	3940790	3940801	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014541	TTTTTG	2	12	3942664	3942675	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014541	ACTCTT	2	12	3965871	3965882	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014541	AGGAGA	2	12	4179134	4179145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014541	TTACGT	2	12	4191211	4191222	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_014541	ATTTCA	2	12	4251835	4251846	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.