MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Ferroglobus placidus DSM 10642 chromosome

Total Repeats: 195

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013849	AATCT	2	10	32987	32996	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013849	TCTGC	2	10	43692	43701	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_013849	AAAAT	2	10	49192	49201	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013849	GCAAA	2	10	57813	57822	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_013849	TAAAT	2	10	69705	69714	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013849	GTAAA	2	10	76871	76880	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013849	TAATT	2	10	84718	84727	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013849	TTTCC	2	10	93839	93848	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_013849	GGTTT	2	10	94436	94445	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013849	ATACA	2	10	160312	160321	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_013849	TCATT	2	10	161737	161746	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013849	AGGAG	2	10	176552	176561	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013849	TTTAA	2	10	199419	199428	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013849	TCTCC	2	10	200239	200248	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
15	NC_013849	CGTCT	2	10	200744	200753	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_013849	ATCTA	2	10	201081	201090	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013849	AAATT	2	10	201854	201863	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013849	AAAAG	2	10	201883	201892	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013849	CGGCA	2	10	208021	208030	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_013849	CGAAT	2	10	209721	209730	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_013849	CTCTC	2	10	223862	223871	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
22	NC_013849	ACGGG	2	10	225315	225324	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_013849	TTCTT	2	10	225455	225464	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_013849	TCTAA	2	10	225563	225572	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_013849	TTTCA	2	10	227137	227146	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_013849	AGCTG	2	10	227812	227821	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_013849	ACGGG	2	10	227941	227950	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_013849	TAAAA	2	10	230433	230442	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013849	GAGGT	2	10	234528	234537	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013849	TCTCC	2	10	287742	287751	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_013849	GAAAA	2	10	291656	291665	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013849	CCCCT	2	10	298043	298052	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
33	NC_013849	ATATT	2	10	343388	343397	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013849	TGAAA	2	10	362162	362171	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013849	GCAAA	2	10	373960	373969	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_013849	GGATG	2	10	395350	395359	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013849	ATGAA	2	10	407928	407937	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013849	ACCTG	2	10	409933	409942	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_013849	AGCTG	2	10	415814	415823	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_013849	TAGGG	2	10	415912	415921	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013849	GGGTT	2	10	416159	416168	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013849	ATAAA	2	10	426616	426625	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013849	TAAGA	2	10	432281	432290	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013849	TTAAC	2	10	433792	433801	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_013849	GAGAA	2	10	440139	440148	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013849	TGTAG	2	10	441223	441232	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013849	CTCCC	2	10	441740	441749	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
48	NC_013849	TTTGG	2	10	443982	443991	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013849	GAGGT	2	10	444734	444743	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013849	CCCGG	2	10	447408	447417	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
51	NC_013849	TGGTT	2	10	466060	466069	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013849	CTTTT	2	10	467059	467068	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_013849	GGTGA	2	10	468159	468168	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013849	GATGT	2	10	499761	499770	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013849	GAGTT	2	10	500765	500774	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013849	ATCTC	2	10	504812	504821	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_013849	AGATT	2	10	545022	545031	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013849	ATTTT	2	10	545046	545055	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013849	GCTCC	2	10	557612	557621	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
60	NC_013849	AATTA	2	10	566138	566147	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013849	TTTTG	2	10	569118	569127	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013849	TCTCC	2	10	605887	605896	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_013849	TTAAA	2	10	618683	618692	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013849	CTAAT	2	10	676079	676088	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_013849	GAGGG	2	10	676525	676534	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013849	GAGAA	2	10	677097	677106	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013849	GGCGA	2	10	677509	677518	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
68	NC_013849	GAAAA	2	10	681950	681959	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013849	GTTCC	2	10	684565	684574	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_013849	GAGGT	2	10	684691	684700	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013849	ATAAA	2	10	703764	703773	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013849	AGGGA	2	10	708455	708464	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013849	TACTT	2	10	745405	745414	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_013849	TAAAC	2	10	766169	766178	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_013849	CGTTA	2	10	788971	788980	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_013849	TTGGA	2	10	818029	818038	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013849	GCCGT	2	10	824236	824245	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_013849	GAGAA	2	10	833922	833931	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013849	TTTTG	2	10	833972	833981	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013849	TGCCC	2	10	849104	849113	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
81	NC_013849	ATTAA	2	10	850693	850702	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013849	CATTA	2	10	862535	862544	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_013849	ATTTG	2	10	869264	869273	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013849	ACTCC	2	10	869294	869303	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
85	NC_013849	TTAAT	2	10	877061	877070	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013849	CTGAA	2	10	877147	877156	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_013849	AAACT	2	10	893036	893045	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_013849	TAAAA	2	10	899995	900004	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013849	TAAAA	2	10	901970	901979	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013849	AATAG	2	10	932882	932891	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013849	GTTTC	2	10	933265	933274	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_013849	AAGTA	2	10	933420	933429	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013849	TAGAA	2	10	933760	933769	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013849	TCGAT	2	10	937144	937153	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_013849	GATCA	2	10	970531	970540	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_013849	TCTCT	2	10	971862	971871	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_013849	AATAA	2	10	1019014	1019023	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013849	GGGTG	2	10	1027456	1027465	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013849	ATTTT	2	10	1038240	1038249	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013849	AAAGA	2	10	1042519	1042528	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013849	AAAAT	2	10	1048776	1048785	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013849	TTCTC	2	10	1085800	1085809	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_013849	AAAAT	2	10	1107219	1107228	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013849	AGAAA	2	10	1121835	1121844	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013849	ATCGG	2	10	1138788	1138797	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_013849	TATCT	2	10	1138942	1138951	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_013849	ATATA	2	10	1167501	1167510	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013849	TAGCT	2	10	1175835	1175844	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_013849	TTTTA	2	10	1193476	1193485	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013849	ACTAT	2	10	1200392	1200401	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_013849	AAATT	2	10	1232539	1232548	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013849	CTTTT	2	10	1319599	1319608	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_013849	TTAAA	2	10	1321287	1321296	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013849	TTTGG	2	10	1341791	1341800	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013849	CCAAC	2	10	1341862	1341871	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
116	NC_013849	AGCGA	2	10	1341903	1341912	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_013849	GTGAG	2	10	1341943	1341952	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013849	GAAAA	2	10	1345642	1345651	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013849	TCGCT	2	10	1345855	1345864	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_013849	GAAAA	2	10	1357857	1357866	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013849	TTAAA	2	10	1359894	1359903	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013849	TTTCG	2	10	1377988	1377997	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_013849	GGCTC	2	10	1405766	1405775	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
124	NC_013849	GGAAA	2	10	1405905	1405914	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013849	CCGGG	2	10	1407976	1407985	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
126	NC_013849	TAAAT	2	10	1410314	1410323	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013849	ACAAA	2	10	1427282	1427291	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_013849	AAAAT	2	10	1463563	1463572	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013849	ACCCC	2	10	1475817	1475826	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
130	NC_013849	TTTTA	2	10	1507709	1507718	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013849	CCGTT	2	10	1539301	1539310	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_013849	TGATT	2	10	1555224	1555233	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013849	TTCGA	2	10	1567529	1567538	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_013849	TTAAG	2	10	1568059	1568068	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013849	TCCCT	2	10	1597530	1597539	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
136	NC_013849	TTCTT	2	10	1611863	1611872	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_013849	TTTTC	2	10	1612070	1612079	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_013849	ATTTT	2	10	1612197	1612206	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013849	CCTTT	2	10	1612354	1612363	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_013849	AAAGT	2	10	1624187	1624196	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013849	TAAAA	2	10	1625683	1625692	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013849	ATGAA	2	10	1645892	1645901	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013849	TAAAT	2	10	1647579	1647588	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013849	GAACA	2	10	1663156	1663165	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_013849	GATTT	2	10	1691678	1691687	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_013849	AAGGG	2	10	2078809	2078818	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
189	NC_013849	GTTAA	2	10	2117057	2117066	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
190	NC_013849	TGGAC	2	10	2134115	2134124	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
191	NC_013849	AGAGG	2	10	2134314	2134323	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
192	NC_013849	TCCTT	2	10	2167571	2167580	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
193	NC_013849	CCAGT	2	10	2171358	2171367	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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195	NC_013849	AATTA	2	10	2176965	2176974	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.