MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. mediasiatica FSC147 chromosome

Total Repeats: 245

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010677	TATTTC	2	12	2865	2876	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_010677	AAGGTT	2	12	6290	6301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010677	ATAAGT	2	12	19514	19525	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010677	CTTGAG	2	12	43912	43923	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_010677	CTTTTT	2	12	58868	58879	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_010677	AATCAC	2	12	61145	61156	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010677	GATATT	2	12	61381	61392	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010677	GTAACT	2	12	71967	71978	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_010677	GTTTTA	2	12	80310	80321	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010677	TATATC	2	12	83873	83884	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_010677	TTTATC	2	12	84540	84551	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_010677	ATGATA	2	12	96434	96445	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010677	ATGATA	2	12	102125	102136	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010677	TCCATG	2	12	118786	118797	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010677	AGCTTG	2	12	167012	167023	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_010677	GTTGAG	2	12	172598	172609	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010677	AAAAAC	2	12	172815	172826	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_010677	TAGTGC	2	12	208246	208257	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_010677	ATTTTT	2	12	208905	208916	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010677	AGCAAC	2	12	221031	221042	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010677	TAGATC	2	12	221994	222005	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_010677	TCCACA	2	12	237345	237356	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010677	TGATTT	2	12	245144	245155	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010677	ATAAAC	2	12	246574	246585	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_010677	TGTTTT	2	12	254862	254873	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010677	GTTTTA	2	12	258954	258965	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010677	AAAATA	2	12	263566	263577	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010677	AGTATG	2	12	265371	265382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010677	AATATA	2	12	284135	284146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010677	GTCAAG	2	12	286416	286427	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_010677	GGTAAT	2	12	287276	287287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010677	TTATAA	2	12	292867	292878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010677	TTCCCA	2	12	302478	302489	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010677	CAAAAG	2	12	305657	305668	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_010677	ACTCTA	2	12	306824	306835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010677	TAAGAT	2	12	307906	307917	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010677	TGGGCT	2	12	311312	311323	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_010677	GTTTTA	2	12	315809	315820	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010677	GTTTTA	2	12	331199	331210	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010677	CTTCTA	2	12	349581	349592	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010677	GTTTTA	2	12	350092	350103	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010677	TAATCT	2	12	350759	350770	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_010677	AAGATA	2	12	352362	352373	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010677	TAAATT	2	12	370796	370807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010677	TTTCAT	2	12	388765	388776	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_010677	ACTTTA	2	12	403198	403209	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_010677	TGATAA	2	12	425161	425172	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010677	AAATGC	2	12	425858	425869	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_010677	GCTTTA	2	12	433175	433186	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_010677	TACTAT	2	12	441125	441136	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_010677	ATTTTA	2	12	441343	441354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010677	TTAGTT	2	12	465516	465527	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010677	GTTTTA	2	12	466131	466142	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010677	TTAGAT	2	12	500328	500339	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010677	TATAGC	2	12	502576	502587	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_010677	ATATTT	2	12	502964	502975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010677	GTCTTG	2	12	521537	521548	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_010677	AGTAAC	2	12	555676	555687	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_010677	GTTTTA	2	12	556078	556089	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010677	TATTTG	2	12	556660	556671	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010677	TTTAAA	2	12	564691	564702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010677	CTTTTT	2	12	572974	572985	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_010677	ATAGTA	2	12	575355	575366	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010677	AGAATA	2	12	577744	577755	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010677	TGAAAT	2	12	580050	580061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010677	TAAAAT	2	12	585730	585741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010677	ATTTTT	2	12	586308	586319	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010677	AAGTTA	2	12	606403	606414	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010677	TATTTA	2	12	615058	615069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010677	AGTTGA	2	12	645601	645612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010677	AAAAGT	2	12	649745	649756	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010677	TTGATT	2	12	661778	661789	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010677	AAAACT	2	12	662103	662114	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_010677	TAAAAA	2	12	669050	669061	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010677	ATGTTA	2	12	677841	677852	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010677	CATAGC	2	12	705084	705095	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010677	CTATCT	2	12	705394	705405	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010677	GTTTTA	2	12	723870	723881	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010677	TAAATA	2	12	731809	731820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010677	CTTATA	2	12	731829	731840	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_010677	TATAGT	2	12	760140	760151	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010677	AGTATA	2	12	796528	796539	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010677	GTTTTA	2	12	797574	797585	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010677	AAACTC	2	12	820210	820221	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010677	CATATT	2	12	821546	821557	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_010677	TATCAA	2	12	821939	821950	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_010677	TTGCTT	2	12	830321	830332	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_010677	GTTTTA	2	12	844776	844787	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010677	TAGAAT	2	12	866657	866668	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010677	ATTTTG	2	12	869444	869455	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010677	TAAAAT	2	12	870817	870828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010677	ACAGGT	2	12	883305	883316	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_010677	TTGCAG	2	12	885093	885104	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_010677	ATTGAA	2	12	885755	885766	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010677	TCCCAC	2	12	887476	887487	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_010677	TAGTTT	2	12	891338	891349	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010677	AACAAA	2	12	899306	899317	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_010677	GATTAT	2	12	899329	899340	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010677	TAGAAA	2	12	899687	899698	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010677	GTTTTA	2	12	920589	920600	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010677	AGTAAT	2	12	922306	922317	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010677	ACCTAT	2	12	930994	931005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010677	AATAAG	2	12	931242	931253	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010677	TAATTT	2	12	947548	947559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010677	CACAAC	2	12	952178	952189	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_010677	GTTTTA	2	12	958370	958381	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010677	GTTTTA	2	12	969967	969978	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010677	GTTAAA	2	12	970693	970704	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010677	CTTTAG	2	12	971007	971018	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_010677	AAGAAA	2	12	980309	980320	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010677	TTGATT	2	12	981387	981398	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010677	ACAAAC	2	12	982753	982764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010677	CTATAA	2	12	983234	983245	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_010677	AAAATT	2	12	985879	985890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010677	AGTATT	4	24	1000967	1000990	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010677	CCAAAT	2	12	1002123	1002134	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010677	ATATAA	2	12	1023716	1023727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010677	TCCATC	2	12	1024282	1024293	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_010677	AAAAAT	2	12	1037040	1037051	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010677	AGATTA	2	12	1044826	1044837	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010677	TTTATA	2	12	1046900	1046911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010677	CTAAAT	2	12	1047264	1047275	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_010677	ATAAAG	2	12	1048680	1048691	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010677	TAATTA	2	12	1066293	1066304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010677	AATATT	2	12	1070759	1070770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010677	ATCTGT	2	12	1072148	1072159	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_010677	AATTTA	2	12	1092553	1092564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010677	GTTTTA	2	12	1093255	1093266	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.