MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Finegoldia magna ATCC 29328 chromosome

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010376	TGTTAA	2	12	37111	37122	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010376	ATAATT	2	12	73574	73585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010376	AAAACA	2	12	133676	133687	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_010376	AGCTTA	2	12	150804	150815	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_010376	TAAAAA	3	18	164505	164522	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010376	CTTCGT	2	12	169819	169830	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010376	CTGGAG	2	12	202256	202267	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010376	TAAATA	2	12	204491	204502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010376	AAAGGT	2	12	220052	220063	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010376	GACAGG	2	12	228185	228196	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_010376	GACAGG	2	12	228610	228621	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_010376	ACAGGG	2	12	243644	243655	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_010376	AAACGT	2	12	253102	253113	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_010376	TTTGTC	2	12	258131	258142	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010376	AAAATA	2	12	262412	262423	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010376	AATATA	2	12	266755	266766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010376	AATCAA	2	12	272742	272753	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_010376	TGAAAA	2	12	319931	319942	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010376	TTAATT	2	12	355851	355862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010376	ACTGGG	2	12	367394	367405	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_010376	AAATAA	2	12	383448	383459	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010376	ATTTGT	2	12	434615	434626	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010376	AAGAAA	2	12	447883	447894	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010376	TAAATT	2	12	486987	486998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010376	TAAATT	2	12	503546	503557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010376	TTGTCA	2	12	513202	513213	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_010376	AAGTAT	2	12	525322	525333	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010376	ATAAAA	2	12	566707	566718	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010376	TCAAAA	2	12	583732	583743	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_010376	GAAATA	2	12	606292	606303	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010376	CTGGAG	2	12	616214	616225	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_010376	TAAAGA	2	12	616811	616822	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010376	TAATAT	2	12	620937	620948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010376	TTTTTA	2	12	708461	708472	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010376	AAAATA	2	12	875141	875152	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010376	TGAATT	2	12	876418	876429	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010376	ATTATA	2	12	951180	951191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010376	ATTAGA	2	12	994285	994296	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010376	CTATTA	2	12	996224	996235	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010376	TCTTTT	2	12	1056749	1056760	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_010376	TAAAAA	2	12	1135096	1135107	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010376	TAATTT	2	12	1160904	1160915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010376	CTAAAT	2	12	1175837	1175848	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_010376	TAGGTC	2	12	1182671	1182682	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_010376	CTCCAG	2	12	1183269	1183280	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010376	AAAATA	2	12	1238474	1238485	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010376	TATTTT	2	12	1329782	1329793	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010376	ACTTAA	2	12	1436178	1436189	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_010376	CTCCAG	2	12	1442708	1442719	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010376	ACCAAA	2	12	1452800	1452811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010376	TATCAA	2	12	1452964	1452975	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_010376	ATAAAA	2	12	1466064	1466075	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010376	TGTGGT	2	12	1469635	1469646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010376	TTGTTT	2	12	1469760	1469771	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010376	ATTTTT	2	12	1469903	1469914	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010376	ATTGAA	2	12	1489462	1489473	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010376	ATTTTT	2	12	1506051	1506062	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010376	TTTCAA	2	12	1530898	1530909	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_010376	ATTTTT	2	12	1544740	1544751	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010376	TAGGGC	2	12	1556515	1556526	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_010376	CATTTT	2	12	1557132	1557143	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_010376	AAGCTA	2	12	1566432	1566443	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_010376	TTATCA	2	12	1610215	1610226	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_010376	AAATAA	2	12	1629322	1629333	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010376	AAATTT	2	12	1636193	1636204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010376	TTCTTA	2	12	1645373	1645384	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_010376	TGATAT	2	12	1701727	1701738	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010376	CTAGAA	2	12	1733883	1733894	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_010376	TTAAAC	2	12	1759134	1759145	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_010376	GAGCGA	2	12	1789273	1789284	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_010376	CAAAAA	2	12	1797506	1797517	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.