MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Francisella philomiragia subsp. philomiragia ATCC 25017 chromosome

Total Repeats: 4820

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010336	AT	4	8	6	13	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010336	ACC	2	6	121	126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_010336	AGA	2	6	130	135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010336	ATA	2	6	147	152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010336	GTA	2	6	155	160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010336	CTC	2	6	180	185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_010336	AT	3	6	190	195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010336	GCA	3	9	197	205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010336	ACC	3	9	229	237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_010336	GAT	2	6	287	292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010336	A	6	6	383	388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010336	GTA	2	6	413	418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010336	ATA	2	6	458	463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010336	GAA	2	6	479	484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010336	AC	3	6	1097	1102	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_010336	A	6	6	1137	1142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010336	ATATTA	2	12	1165	1176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010336	TAT	2	6	1184	1189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010336	AT	3	6	5764	5769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010336	GTTT	2	8	5772	5779	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010336	AGAA	2	8	9222	9229	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010336	AT	3	6	9237	9242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010336	TGA	2	6	9246	9251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010336	ATA	2	6	10621	10626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010336	AGA	2	6	10687	10692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010336	T	6	6	14560	14565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010336	TTTA	2	8	15490	15497	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010336	AAT	2	6	18538	18543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010336	AAC	2	6	18642	18647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010336	TAAAT	2	10	18666	18675	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010336	GTAA	2	8	23841	23848	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010336	TAA	2	6	24359	24364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010336	T	6	6	24417	24422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010336	CTT	2	6	25164	25169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010336	TA	3	6	25183	25188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010336	TATAT	2	10	25190	25199	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010336	ATTA	2	8	25200	25207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010336	GCA	2	6	25215	25220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010336	A	6	6	25237	25242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010336	ATG	2	6	25251	25256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010336	TAT	2	6	25305	25310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010336	AT	3	6	25323	25328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010336	T	6	6	27286	27291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010336	A	6	6	27348	27353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010336	AT	3	6	29164	29169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010336	A	6	6	31114	31119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010336	TTATAT	2	12	31120	31131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010336	AAT	2	6	31137	31142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010336	ATC	2	6	31172	31177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010336	A	6	6	32618	32623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010336	CAG	2	6	32691	32696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010336	TCA	2	6	32702	32707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010336	TA	3	6	32763	32768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010336	ATA	2	6	34433	34438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010336	TAA	2	6	34441	34446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010336	ATT	2	6	34468	34473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010336	A	7	7	35903	35909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010336	TGA	2	6	36982	36987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010336	T	8	8	37021	37028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010336	GTA	2	6	37105	37110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010336	ATA	2	6	39908	39913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010336	TAA	2	6	40595	40600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010336	TTTA	2	8	40645	40652	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010336	T	7	7	40660	40666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010336	AG	3	6	42467	42472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010336	TTA	2	6	42486	42491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010336	TAAA	2	8	42505	42512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010336	TTA	2	6	44357	44362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010336	TAA	2	6	44396	44401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010336	ACA	2	6	44437	44442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010336	TAT	2	6	44453	44458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010336	ATT	2	6	44464	44469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010336	AT	3	6	44477	44482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010336	GAT	2	6	44492	44497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010336	AT	3	6	44508	44513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010336	ACT	2	6	44526	44531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010336	T	7	7	44550	44556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010336	TTA	2	6	44572	44577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010336	TTG	2	6	44586	44591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010336	TTCTT	2	10	46460	46469	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_010336	TAA	2	6	49092	49097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010336	ATT	2	6	49107	49112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010336	ATA	2	6	49121	49126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010336	A	6	6	49140	49145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010336	A	7	7	49155	49161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010336	T	6	6	49185	49190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010336	TTA	2	6	50134	50139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010336	A	6	6	50150	50155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010336	AAT	2	6	50172	50177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010336	TA	4	8	50181	50188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010336	ATA	2	6	52718	52723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010336	TA	3	6	52722	52727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010336	A	6	6	52751	52756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010336	TAA	2	6	52757	52762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010336	CTAT	2	8	54027	54034	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_010336	TAT	3	9	54037	54045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010336	AATAA	2	10	54063	54072	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010336	ATA	2	6	54082	54087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010336	AATT	2	8	54098	54105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010336	AT	3	6	54109	54114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010336	ATT	2	6	54153	54158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010336	AAAAT	2	10	54161	54170	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010336	TAC	2	6	54186	54191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010336	GTA	2	6	54202	54207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010336	CAT	2	6	54271	54276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010336	T	6	6	54276	54281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010336	AG	3	6	54371	54376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010336	TTA	2	6	54390	54395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010336	TAAA	2	8	54409	54416	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010336	TTTA	2	8	57201	57208	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010336	TAA	2	6	57222	57227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010336	CT	3	6	57241	57246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_010336	T	7	7	64496	64502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010336	ACT	2	6	64512	64517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010336	AGCCAT	2	12	64529	64540	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010336	A	7	7	64569	64575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010336	CAG	2	6	64588	64593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010336	ATT	2	6	64640	64645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010336	T	6	6	64644	64649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010336	TTA	2	6	64684	64689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010336	CAAATA	2	12	64720	64731	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_010336	AT	3	6	64750	64755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010336	TTAT	2	8	64756	64763	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010336	A	6	6	64766	64771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010336	TCA	2	6	66063	66068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010336	ATTT	2	8	66076	66083	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010336	ATTTA	2	10	67241	67250	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010336	T	6	6	67258	67263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010336	ATC	2	6	67266	67271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010336	AGT	2	6	71302	71307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010336	TAA	2	6	71350	71355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010336	ACTATA	2	12	71361	71372	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_010336	AAATA	2	10	77328	77337	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010336	TAA	2	6	77357	77362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010336	ACTT	2	8	77385	77392	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_010336	A	6	6	77399	77404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010336	TAT	2	6	77440	77445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010336	ATA	2	6	77470	77475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010336	ACTT	2	8	82579	82586	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_010336	TAA	2	6	82587	82592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010336	T	7	7	82614	82620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010336	TTTA	2	8	82624	82631	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010336	GAA	2	6	82632	82637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010336	AG	3	6	82681	82686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010336	TTA	2	6	82700	82705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010336	TAAA	2	8	82719	82726	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010336	A	6	6	83696	83701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010336	TTCAA	2	10	89756	89765	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_010336	A	8	8	89910	89917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_010336	T	6	6	95966	95971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_010336	TTA	2	6	96018	96023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_010336	ATT	2	6	105459	105464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_010336	A	6	6	107104	107109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_010336	AT	3	6	110344	110349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_010336	TGT	2	6	145938	145943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_010336	TAAC	2	8	149413	149420	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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412	NC_010336	ATA	2	6	188835	188840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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414	NC_010336	T	6	6	189063	189068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
415	NC_010336	TCA	2	6	189127	189132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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427	NC_010336	ATA	2	6	189519	189524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_010336	CTA	2	6	189599	189604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
432	NC_010336	TC	3	6	189606	189611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
433	NC_010336	TTC	2	6	189683	189688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
434	NC_010336	TTA	2	6	189736	189741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_010336	CA	3	6	189756	189761	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
436	NC_010336	TCT	2	6	189795	189800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
437	NC_010336	CTT	2	6	189842	189847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
438	NC_010336	ACT	2	6	189874	189879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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440	NC_010336	ATT	2	6	189963	189968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_010336	TCT	2	6	190024	190029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
442	NC_010336	GAT	2	6	190119	190124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_010336	TCT	2	6	190294	190299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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453	NC_010336	A	6	6	190463	190468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_010336	TAA	2	6	190488	190493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_010336	AT	3	6	190500	190505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_010336	ATT	2	6	190532	190537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_010336	TAA	2	6	190560	190565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_010336	CAA	2	6	190585	190590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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461	NC_010336	T	7	7	191451	191457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_010336	ATT	2	6	191506	191511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_010336	TA	3	6	191524	191529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_010336	TTTC	2	8	191575	191582	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
465	NC_010336	TTC	3	9	191587	191595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
466	NC_010336	TA	3	6	191606	191611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_010336	AAT	2	6	191680	191685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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469	NC_010336	AT	3	6	191732	191737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_010336	TTA	2	6	191747	191752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_010336	CAT	2	6	191835	191840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
472	NC_010336	CATTG	2	10	191867	191876	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
473	NC_010336	T	6	6	191883	191888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_010336	A	6	6	191910	191915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
475	NC_010336	TAT	2	6	191956	191961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_010336	TCA	2	6	192003	192008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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480	NC_010336	TAT	2	6	192151	192156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
481	NC_010336	CT	3	6	192216	192221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
482	NC_010336	TAT	2	6	192244	192249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_010336	AGC	2	6	192260	192265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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491	NC_010336	TA	3	6	196246	196251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
492	NC_010336	TTGCTA	2	12	196281	196292	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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494	NC_010336	AT	3	6	197606	197611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
495	NC_010336	TA	3	6	197614	197619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
496	NC_010336	ATA	2	6	197675	197680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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