MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella philomiragia subsp. philomiragia ATCC 25017 chromosome

Total Repeats: 192

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010336	TAAAT	2	10	18666	18675	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010336	TATAT	2	10	25190	25199	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010336	TTCTT	2	10	46460	46469	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_010336	AATAA	2	10	54063	54072	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010336	AAAAT	2	10	54161	54170	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010336	ATTTA	2	10	67241	67250	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010336	AAATA	2	10	77328	77337	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010336	TTCAA	2	10	89756	89765	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_010336	AATTA	2	10	95099	95108	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010336	ATATA	2	10	104319	104328	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010336	TATAT	2	10	110265	110274	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010336	AAAAT	2	10	110369	110378	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010336	ATTAA	2	10	112483	112492	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010336	AAAGT	2	10	120938	120947	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010336	ATAAA	2	10	121000	121009	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010336	TTTAT	2	10	122219	122228	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010336	TAAAG	2	10	144291	144300	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010336	CTATA	2	10	170880	170889	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_010336	AAAAT	2	10	173032	173041	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010336	CATTT	2	10	176316	176325	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_010336	ACGCA	2	10	188598	188607	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_010336	ATCTC	2	10	188917	188926	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_010336	TTTAG	2	10	189229	189238	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010336	TCTGT	2	10	189334	189343	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_010336	CATTG	2	10	191867	191876	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_010336	TAAAC	2	10	205574	205583	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_010336	ATTTT	2	10	207800	207809	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010336	AAGAT	2	10	207811	207820	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010336	CAAAG	2	10	221545	221554	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_010336	GATTA	2	10	223464	223473	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010336	ATTAA	2	10	225109	225118	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010336	ATATA	2	10	228362	228371	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010336	ATTAT	2	10	240451	240460	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010336	TTATT	2	10	260078	260087	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010336	AAGAT	2	10	275614	275623	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010336	AATAA	2	10	355497	355506	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010336	ATCAA	2	10	365404	365413	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_010336	TATAT	2	10	380634	380643	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010336	GTATA	2	10	383805	383814	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010336	AATTA	2	10	412450	412459	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010336	TATTT	2	10	416196	416205	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010336	TATAA	2	10	417985	417994	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010336	TTTTC	2	10	423575	423584	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_010336	GATTT	2	10	424668	424677	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010336	TAACA	2	10	448050	448059	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_010336	ATTTT	2	10	448091	448100	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010336	GATAT	2	10	473948	473957	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010336	AATAT	2	10	475301	475310	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010336	AATTC	2	10	475851	475860	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_010336	ATCTA	2	10	476470	476479	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_010336	ACAGC	2	10	478203	478212	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_010336	CATTA	2	10	503635	503644	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_010336	ATTTT	2	10	504033	504042	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010336	TAAAT	2	10	509978	509987	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010336	TAAAT	2	10	520018	520027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010336	AATTT	2	10	531269	531278	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010336	AAATA	3	15	533366	533380	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010336	TTCCT	2	10	536103	536112	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_010336	TGAAT	2	10	538266	538275	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010336	CAATT	2	10	538301	538310	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_010336	TAAAT	2	10	543264	543273	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010336	ACCCT	2	10	547460	547469	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_010336	TATAA	2	10	560432	560441	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010336	TTTTA	2	10	579620	579629	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010336	ACTAA	2	10	581600	581609	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_010336	TTTAT	2	10	584389	584398	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010336	TACTT	2	10	587870	587879	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_010336	GAAAA	2	10	626865	626874	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010336	ATATA	2	10	634814	634823	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010336	ATTAA	2	10	636469	636478	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010336	AAAAT	2	10	636697	636706	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010336	AATTT	2	10	666387	666396	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010336	TATTT	2	10	669635	669644	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010336	TCATA	2	10	689837	689846	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_010336	AAACG	2	10	696841	696850	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_010336	AATAA	2	10	699497	699506	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010336	AGATA	2	10	701593	701602	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010336	TACAT	2	10	701604	701613	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_010336	ACATA	2	10	719624	719633	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_010336	AAACT	2	10	728105	728114	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_010336	AAATT	2	10	735662	735671	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010336	TATAT	2	10	744798	744807	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010336	TTTCC	2	10	748577	748586	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_010336	GTTTA	2	10	748595	748604	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010336	CAGGG	2	10	754485	754494	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_010336	TTTTC	2	10	775037	775046	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_010336	TTTAA	2	10	788918	788927	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010336	AAATA	2	10	793482	793491	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010336	TATAG	2	10	794096	794105	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010336	TGAAA	2	10	798046	798055	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010336	TTTAA	2	10	801963	801972	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010336	TTATT	2	10	827118	827127	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010336	TCAAA	2	10	834534	834543	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_010336	GATAT	2	10	834996	835005	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010336	AAAAT	2	10	836369	836378	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010336	TTTTA	2	10	838241	838250	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010336	TTTAT	2	10	846093	846102	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010336	CAATT	2	10	851710	851719	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_010336	ACAAT	2	10	859537	859546	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_010336	TAGAA	2	10	860791	860800	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010336	TTTCT	2	10	895671	895680	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_010336	TTAAA	2	10	896049	896058	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010336	AAATA	2	10	901853	901862	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010336	ATAAG	2	10	914347	914356	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010336	TAAAT	2	10	924743	924752	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010336	CTTAA	2	10	962866	962875	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_010336	TAATA	2	10	965426	965435	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010336	TTAGC	2	10	989790	989799	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_010336	TTTTA	2	10	1020744	1020753	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010336	TAATG	2	10	1038770	1038779	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010336	TAGAA	2	10	1044370	1044379	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010336	ATAAC	2	10	1066451	1066460	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_010336	ATTTT	2	10	1073430	1073439	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010336	GCAAA	2	10	1125132	1125141	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_010336	ATTTA	2	10	1125482	1125491	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010336	GTGTT	2	10	1126821	1126830	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010336	TAAAA	2	10	1134512	1134521	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010336	AATGT	2	10	1141665	1141674	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010336	TTTTA	2	10	1156294	1156303	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010336	TAAGT	2	10	1157615	1157624	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010336	AAATT	2	10	1163050	1163059	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010336	AATGT	2	10	1163130	1163139	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010336	TGATA	2	10	1182946	1182955	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010336	TTCAT	2	10	1192468	1192477	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_010336	TTAAA	2	10	1199045	1199054	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010336	ATTAT	2	10	1224270	1224279	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010336	AAAAT	2	10	1233448	1233457	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010336	TAATG	2	10	1235137	1235146	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010336	TCAAG	2	10	1246621	1246630	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_010336	AGAAA	2	10	1246656	1246665	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010336	AATTT	2	10	1259965	1259974	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010336	AGCAG	2	10	1281266	1281275	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_010336	TAAAG	2	10	1281934	1281943	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010336	CTTTT	2	10	1301351	1301360	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_010336	TTTTA	2	10	1312359	1312368	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010336	TTTTA	2	10	1316579	1316588	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010336	AAAGC	2	10	1338113	1338122	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_010336	CAAAA	2	10	1364860	1364869	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_010336	TCAAG	2	10	1368911	1368920	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_010336	TTTTG	2	10	1389729	1389738	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010336	TAGTT	2	10	1392048	1392057	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010336	TTTAA	2	10	1399733	1399742	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010336	TCACA	2	10	1408185	1408194	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_010336	ATTAT	2	10	1409590	1409599	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010336	AAAAG	2	10	1414918	1414927	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010336	ATTAT	2	10	1429054	1429063	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_010336	ATTTT	2	10	2045166	2045175	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.