MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Frankia sp. EAN1pec chromosome

Total Repeats: 6202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009921	CCCG	2	8	32	39	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_009921	GGCC	2	8	2431	2438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009921	TCGG	2	8	2687	2694	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009921	GCGG	2	8	7411	7418	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009921	GGCC	2	8	14825	14832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009921	TGCG	2	8	14929	14936	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009921	CGGG	2	8	15169	15176	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009921	GTCC	2	8	19465	19472	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009921	CGGC	2	8	21500	21507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009921	CCGA	2	8	21610	21617	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009921	CGGG	2	8	23193	23200	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009921	CGCT	2	8	24345	24352	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009921	CCGG	5	20	25750	25769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009921	GCCG	2	8	26060	26067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009921	GTCC	2	8	26119	26126	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009921	GCCC	2	8	30695	30702	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_009921	CGGC	2	8	30771	30778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009921	CGGG	2	8	30844	30851	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009921	GCGG	2	8	30855	30862	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009921	CGGG	2	8	30872	30879	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009921	GCCT	2	8	32017	32024	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009921	CTCG	2	8	32120	32127	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009921	GCTT	2	8	32171	32178	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009921	TTGC	2	8	32621	32628	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009921	GAGT	2	8	32693	32700	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009921	GGCC	2	8	32996	33003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009921	GTGG	2	8	33534	33541	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009921	GCCG	2	8	33760	33767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009921	GTGC	2	8	34018	34025	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009921	CCGG	2	8	34595	34602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009921	CGGG	2	8	34614	34621	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009921	GCCT	2	8	34801	34808	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009921	ACAT	2	8	34875	34882	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009921	GCCG	2	8	34969	34976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009921	GGCT	2	8	35328	35335	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009921	CTAT	2	8	35508	35515	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009921	TCTG	2	8	35543	35550	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009921	ACGG	2	8	37110	37117	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009921	CCGG	2	8	37252	37259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009921	TTCA	2	8	38950	38957	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009921	CCGG	2	8	39121	39128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009921	TGCC	2	8	41907	41914	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009921	GGGT	2	8	41993	42000	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009921	AGGG	2	8	43689	43696	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009921	CGCC	2	8	44877	44884	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_009921	TCCG	2	8	45070	45077	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009921	TCAG	2	8	45109	45116	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009921	CCTG	2	8	45249	45256	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009921	CGGG	2	8	45670	45677	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009921	TTCA	2	8	49807	49814	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009921	TTCT	2	8	50770	50777	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009921	CGGG	2	8	60894	60901	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009921	CACG	2	8	61132	61139	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009921	GGTG	2	8	62187	62194	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009921	GCTG	2	8	62241	62248	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009921	CGGG	2	8	72581	72588	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009921	GGGT	2	8	72836	72843	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009921	CGGG	2	8	74229	74236	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009921	GCCG	2	8	74571	74578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009921	ACGA	2	8	76507	76514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009921	GGGC	2	8	79874	79881	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009921	GCCA	2	8	80508	80515	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009921	CCGG	2	8	80544	80551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009921	CCTA	2	8	80971	80978	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009921	GCCA	2	8	83338	83345	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009921	TGCC	2	8	85730	85737	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009921	TGGG	2	8	85838	85845	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009921	CGGG	2	8	86450	86457	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009921	TGGG	2	8	86462	86469	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009921	CCGG	2	8	86485	86492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009921	GCCG	2	8	86643	86650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009921	CCGG	2	8	86715	86722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_009921	GGCC	2	8	91403	91410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009921	CCCG	2	8	93975	93982	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
75	NC_009921	CCGC	2	8	94211	94218	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76	NC_009921	TCCG	2	8	96895	96902	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009921	GTCG	2	8	97505	97512	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009921	CCAC	2	8	99806	99813	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_009921	GCTC	2	8	103634	103641	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009921	CTCA	2	8	103655	103662	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009921	CCCG	2	8	103711	103718	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_009921	TGTC	2	8	104340	104347	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009921	GGCC	2	8	111034	111041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009921	CGAT	2	8	111066	111073	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_009921	CGGG	2	8	111141	111148	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009921	AGGG	2	8	111199	111206	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009921	CACC	2	8	112778	112785	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
88	NC_009921	GCGG	2	8	113877	113884	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
89	NC_009921	GGTT	2	8	117189	117196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009921	GCCC	2	8	121251	121258	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
91	NC_009921	ACGG	2	8	121264	121271	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009921	GGGC	2	8	121426	121433	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009921	CCCA	2	8	122363	122370	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
94	NC_009921	AGGG	2	8	129746	129753	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009921	CGAT	2	8	130554	130561	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_009921	AGTC	2	8	132152	132159	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009921	GCCC	2	8	132229	132236	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_009921	GTCC	2	8	134903	134910	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_009921	GAGG	2	8	134965	134972	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009921	CGGG	2	8	135078	135085	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009921	CGTC	2	8	135185	135192	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009921	CGGC	2	8	135593	135600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009921	CTGG	2	8	138705	138712	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_009921	CTGT	2	8	138718	138725	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009921	GTCC	2	8	141819	141826	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_009921	CGGT	2	8	142662	142669	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_009921	CGCC	2	8	142716	142723	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
108	NC_009921	GACC	2	8	149542	149549	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009921	ATGA	2	8	157466	157473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009921	CCGG	2	8	157548	157555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009921	CAGG	2	8	158967	158974	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_009921	CCCG	2	8	159019	159026	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
113	NC_009921	CCCG	2	8	159730	159737	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
114	NC_009921	GGCG	2	8	159756	159763	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009921	CGGC	2	8	170121	170128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009921	GGCG	2	8	170620	170627	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_009921	GGGC	2	8	170850	170857	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_009921	GGAG	2	8	170996	171003	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009921	CCGG	2	8	171361	171368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009921	GGCC	2	8	172314	172321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_009921	TCCG	2	8	172340	172347	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009921	TGGC	2	8	176077	176084	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_009921	AGAA	2	8	176263	176270	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009921	CCAG	2	8	177981	177988	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_009921	CCCG	2	8	178778	178785	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
126	NC_009921	CGGG	2	8	182895	182902	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009921	ACCG	2	8	184319	184326	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_009921	CCCG	2	8	189008	189015	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
129	NC_009921	GCCG	2	8	190991	190998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_009921	GCAC	2	8	191183	191190	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_009921	TGGG	2	8	191216	191223	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009921	CGCC	2	8	191508	191515	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
133	NC_009921	CGGG	2	8	193831	193838	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
134	NC_009921	AGTC	2	8	196328	196335	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_009921	CGGT	2	8	197433	197440	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009921	CGGT	2	8	197450	197457	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_009921	GGCC	2	8	198484	198491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_009921	ACCG	2	8	199928	199935	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_009921	CGGA	2	8	199961	199968	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_009921	GTGG	2	8	200467	200474	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009921	CGGA	2	8	200498	200505	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_009921	GGCG	2	8	200568	200575	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009921	GCCG	2	8	204290	204297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_009921	CGGC	2	8	210258	210265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_009921	TCCG	2	8	210917	210924	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_009921	GGAC	2	8	211027	211034	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_009921	GGCT	2	8	211278	211285	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_009921	GACC	2	8	211298	211305	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_009921	GGAG	2	8	211353	211360	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009921	GACG	2	8	213327	213334	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_009921	CCGA	2	8	213621	213628	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_009921	TGTC	2	8	215220	215227	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_009921	CGTT	2	8	220307	220314	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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451	NC_009921	CTCG	2	8	640321	640328	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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477	NC_009921	TACG	2	8	686781	686788	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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485	NC_009921	CGGC	2	8	692810	692817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
486	NC_009921	TCGC	2	8	695822	695829	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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