MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Frankia sp. EAN1pec chromosome

Total Repeats: 2003

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009921	TGGCA	2	10	2240913	2240922	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
502	NC_009921	TCACC	2	10	2241565	2241574	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
503	NC_009921	CACAA	2	10	2241847	2241856	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
504	NC_009921	CCCAT	2	10	2242657	2242666	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
505	NC_009921	GGGGT	2	10	2243309	2243318	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
506	NC_009921	GACAC	2	10	2243580	2243589	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
507	NC_009921	TCGGG	2	10	2250745	2250754	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
508	NC_009921	CGGGG	2	10	2252151	2252160	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
509	NC_009921	GCCGG	2	10	2262134	2262143	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
510	NC_009921	CCGGC	2	10	2262148	2262157	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
511	NC_009921	CGGAG	2	10	2271570	2271579	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
512	NC_009921	GTTCC	2	10	2273749	2273758	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
513	NC_009921	CGGCC	2	10	2279053	2279062	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
514	NC_009921	CGCTC	2	10	2279212	2279221	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
515	NC_009921	GAGCG	2	10	2280096	2280105	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
516	NC_009921	CCGTC	2	10	2289789	2289798	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
517	NC_009921	GACAG	2	10	2295202	2295211	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
518	NC_009921	CGACC	3	15	2299685	2299699	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
519	NC_009921	GCCGG	2	10	2305663	2305672	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
520	NC_009921	GGACA	2	10	2318983	2318992	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
521	NC_009921	CGCGT	2	10	2325580	2325589	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
522	NC_009921	CGGAG	2	10	2326527	2326536	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
523	NC_009921	CGGGT	2	10	2329959	2329968	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
524	NC_009921	CGGGC	2	10	2330034	2330043	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
525	NC_009921	CGGCG	2	10	2352087	2352096	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
526	NC_009921	CGCGC	2	10	2359387	2359396	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
527	NC_009921	TCGGC	2	10	2364675	2364684	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
528	NC_009921	GGGAC	2	10	2364777	2364786	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
529	NC_009921	GACAG	2	10	2366973	2366982	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
530	NC_009921	GAGGC	2	10	2373752	2373761	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
531	NC_009921	GGCTG	2	10	2374720	2374729	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
532	NC_009921	GTCCG	2	10	2376123	2376132	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
533	NC_009921	GGTCG	2	10	2376133	2376142	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
534	NC_009921	GGTGC	2	10	2376273	2376282	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
535	NC_009921	TAGGG	2	10	2382195	2382204	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
536	NC_009921	TCGGG	2	10	2385697	2385706	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
537	NC_009921	CGAGG	2	10	2396046	2396055	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
538	NC_009921	CGGGC	2	10	2397469	2397478	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
539	NC_009921	GGCCC	2	10	2407267	2407276	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
540	NC_009921	CCGGG	2	10	2407927	2407936	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
541	NC_009921	TGGGC	2	10	2408631	2408640	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
542	NC_009921	TCAGG	2	10	2408641	2408650	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
543	NC_009921	AGTGG	2	10	2411612	2411621	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
544	NC_009921	TGGTC	2	10	2420262	2420271	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
545	NC_009921	CGTGG	2	10	2429999	2430008	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
546	NC_009921	CGGCG	2	10	2430193	2430202	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
547	NC_009921	CGAGG	2	10	2430239	2430248	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
548	NC_009921	ACGTC	3	15	2439189	2439203	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
549	NC_009921	GGACC	2	10	2440800	2440809	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
550	NC_009921	GTCAG	2	10	2446283	2446292	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
551	NC_009921	CGGTC	2	10	2451394	2451403	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
552	NC_009921	CCGGC	2	10	2462491	2462500	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
553	NC_009921	CCGGC	2	10	2467574	2467583	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
554	NC_009921	GGCCC	2	10	2467606	2467615	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
555	NC_009921	GCCCA	2	10	2471766	2471775	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
556	NC_009921	GGCTC	2	10	2481384	2481393	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
557	NC_009921	GGAAG	2	10	2488970	2488979	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
558	NC_009921	GACGA	2	10	2492329	2492338	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
559	NC_009921	GGCGT	2	10	2496748	2496757	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
560	NC_009921	CGCGG	2	10	2500554	2500563	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
561	NC_009921	GCCAC	2	10	2503455	2503464	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
562	NC_009921	GACCC	2	10	2509901	2509910	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
563	NC_009921	TGACC	2	10	2516700	2516709	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
564	NC_009921	GTGCA	2	10	2519966	2519975	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
565	NC_009921	TCCGC	2	10	2526255	2526264	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
566	NC_009921	CGGGC	2	10	2533582	2533591	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
567	NC_009921	GCCCC	2	10	2538506	2538515	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
568	NC_009921	CACGC	2	10	2546107	2546116	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
569	NC_009921	GGCGA	2	10	2552592	2552601	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
570	NC_009921	GCTTA	2	10	2553058	2553067	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
571	NC_009921	TGGGA	2	10	2555381	2555390	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
572	NC_009921	AAGTG	2	10	2567902	2567911	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
573	NC_009921	CGGCA	2	10	2593386	2593395	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
574	NC_009921	GCCGA	2	10	2598923	2598932	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
575	NC_009921	CCTGG	2	10	2606769	2606778	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
576	NC_009921	CCGTA	2	10	2607312	2607321	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
577	NC_009921	TCGGA	2	10	2607379	2607388	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
578	NC_009921	ACCCG	2	10	2612980	2612989	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
579	NC_009921	CAGCC	2	10	2618884	2618893	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
580	NC_009921	CGGCA	2	10	2624713	2624722	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
581	NC_009921	CCGAA	2	10	2626232	2626241	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
582	NC_009921	CGCGC	2	10	2640537	2640546	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
583	NC_009921	ACGGC	2	10	2652039	2652048	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
584	NC_009921	GGCCG	3	15	2654840	2654854	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
585	NC_009921	CCGGC	2	10	2657289	2657298	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
586	NC_009921	ACCGG	3	15	2660701	2660715	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
587	NC_009921	CAGTT	2	10	2663625	2663634	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
588	NC_009921	CCCGG	2	10	2664693	2664702	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
589	NC_009921	GCGCG	2	10	2669086	2669095	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
590	NC_009921	CGGCG	2	10	2672681	2672690	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
591	NC_009921	GCGGG	2	10	2680982	2680991	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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597	NC_009921	TCCCG	2	10	2718297	2718306	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
598	NC_009921	GCCGC	2	10	2730998	2731007	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
599	NC_009921	CGGCG	2	10	2732380	2732389	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
600	NC_009921	AGCCG	2	10	2733683	2733692	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
601	NC_009921	TGGCT	2	10	2734970	2734979	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
602	NC_009921	CCGCC	2	10	2737647	2737656	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
603	NC_009921	TCCCG	2	10	2755601	2755610	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
604	NC_009921	CCGAC	2	10	2757522	2757531	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
605	NC_009921	CCGGC	2	10	2761233	2761242	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
606	NC_009921	CGGTC	2	10	2767198	2767207	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
607	NC_009921	CCGGC	2	10	2773965	2773974	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
608	NC_009921	GCTGA	2	10	2776070	2776079	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
609	NC_009921	GCCTC	2	10	2776747	2776756	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
610	NC_009921	TCGAC	2	10	2777783	2777792	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
611	NC_009921	GCCGA	2	10	2779665	2779674	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
612	NC_009921	GGCCA	2	10	2780921	2780930	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
613	NC_009921	CGCTG	2	10	2781592	2781601	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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615	NC_009921	GCGCC	2	10	2793835	2793844	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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618	NC_009921	GGCCG	2	10	2813938	2813947	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
619	NC_009921	CCGGC	2	10	2816661	2816670	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
620	NC_009921	GATCG	2	10	2819084	2819093	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
621	NC_009921	GACCC	2	10	2822227	2822236	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
622	NC_009921	CGGCC	2	10	2822237	2822246	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
623	NC_009921	TCGCG	2	10	2823991	2824000	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
624	NC_009921	CGGCG	2	10	2828029	2828038	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
625	NC_009921	GGCGC	2	10	2829761	2829770	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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627	NC_009921	CCGGG	2	10	2845580	2845589	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
628	NC_009921	GCCGA	2	10	2851615	2851624	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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630	NC_009921	CCCGG	2	10	2862493	2862502	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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637	NC_009921	CGGGC	2	10	2882738	2882747	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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