MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Fervidobacterium nodosum Rt17-B1 chromosome

Total Repeats: 231

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009718	ATTAG	2	10	1664	1673	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009718	ATATA	2	10	1878	1887	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009718	TTATT	2	10	1903	1912	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009718	TGGTA	2	10	24120	24129	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009718	CTTTC	2	10	31296	31305	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_009718	TGCTC	2	10	31781	31790	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_009718	TTTAT	2	10	33317	33326	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009718	TTGAC	2	10	36313	36322	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_009718	AGAGT	2	10	41201	41210	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009718	TTTAT	2	10	41838	41847	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009718	GACCA	2	10	63622	63631	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_009718	ATAGG	2	10	64364	64373	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009718	ATTTG	2	10	64421	64430	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009718	TTCCT	2	10	64893	64902	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_009718	TTTTC	2	10	73862	73871	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009718	TTTTA	2	10	103610	103619	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009718	ATTAT	2	10	105888	105897	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009718	AAATT	2	10	105930	105939	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009718	ATTAT	2	10	108339	108348	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009718	ATCAA	2	10	116435	116444	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_009718	GTAAA	2	10	122803	122812	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009718	TTTTA	2	10	133468	133477	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009718	TTATT	2	10	192937	192946	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009718	AAAAT	2	10	201634	201643	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009718	ATCAA	2	10	214849	214858	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009718	TATTT	2	10	241558	241567	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009718	AATTA	2	10	249885	249894	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009718	GTGAT	2	10	253690	253699	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009718	TGGTT	2	10	258106	258115	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009718	GAGAG	2	10	258668	258677	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009718	ATTTT	2	10	276073	276082	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009718	ACTAT	2	10	276153	276162	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009718	TAAGA	2	10	408728	408737	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009718	ATAGA	2	10	437950	437959	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009718	TTTTA	2	10	458116	458125	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009718	TGTTT	2	10	463906	463915	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009718	CCCTC	2	10	474729	474738	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
38	NC_009718	ATTTT	2	10	475214	475223	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009718	GATTT	2	10	476941	476950	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009718	ATTTT	2	10	481740	481749	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009718	CAGTT	2	10	489230	489239	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_009718	TAAAA	2	10	500767	500776	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009718	TTTAT	2	10	501272	501281	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009718	ATTTT	2	10	533028	533037	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009718	AAATA	2	10	533073	533082	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009718	TATAA	2	10	533263	533272	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009718	TATTT	2	10	559260	559269	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009718	ATTAT	2	10	560829	560838	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009718	TAATT	2	10	560878	560887	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009718	ATTTT	2	10	568425	568434	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009718	CTTAT	2	10	576931	576940	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_009718	TTTCA	2	10	591269	591278	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_009718	ATTTT	2	10	599305	599314	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009718	TCTTG	2	10	606202	606211	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_009718	ATTAT	2	10	614900	614909	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009718	AGAAA	2	10	616421	616430	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009718	TTTAA	2	10	619318	619327	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009718	AATTC	2	10	623217	623226	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_009718	AATAA	2	10	625335	625344	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009718	TATAA	2	10	625817	625826	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009718	TTAAT	2	10	625920	625929	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009718	ATTAT	2	10	626064	626073	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009718	AAAGG	2	10	631073	631082	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009718	ATATT	2	10	632864	632873	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009718	AATTA	2	10	633874	633883	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009718	ATTTA	2	10	636602	636611	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009718	AAGTA	2	10	640905	640914	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009718	TTAAA	2	10	643152	643161	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009718	TTCCG	2	10	645489	645498	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_009718	TAATT	2	10	660353	660362	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009718	CACAT	2	10	660478	660487	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_009718	TAAAG	2	10	661337	661346	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009718	AAAAG	2	10	683653	683662	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009718	TTGTA	2	10	689080	689089	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009718	GTTAC	2	10	690638	690647	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_009718	TTTAA	2	10	700867	700876	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009718	TAAAT	2	10	720936	720945	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009718	AAGTT	2	10	724121	724130	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009718	ATTAA	2	10	724207	724216	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009718	ATAAA	2	10	737019	737028	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009718	GTTTA	2	10	738898	738907	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009718	ATAGA	2	10	750111	750120	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009718	TCAAC	2	10	769088	769097	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_009718	TACAA	2	10	803861	803870	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_009718	GGATG	2	10	808994	809003	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009718	TTCGG	2	10	809627	809636	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_009718	CCCCT	2	10	809645	809654	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
88	NC_009718	GCTCA	2	10	810009	810018	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_009718	CCACA	2	10	810490	810499	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
90	NC_009718	CTTCA	2	10	814441	814450	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_009718	GCTTT	2	10	814624	814633	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_009718	TTAAA	2	10	826935	826944	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009718	ATTTA	2	10	827028	827037	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009718	TGTAT	2	10	827073	827082	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009718	ATTTC	2	10	829277	829286	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_009718	ATCCA	2	10	829319	829328	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_009718	TACAC	2	10	829451	829460	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_009718	TTTCT	2	10	838944	838953	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_009718	AATAT	2	10	846222	846231	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009718	ATTTT	2	10	863969	863978	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009718	TAAAT	2	10	871875	871884	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009718	CAAAA	2	10	873946	873955	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_009718	TTTTA	2	10	884902	884911	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009718	AAATT	2	10	884928	884937	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009718	TTTTG	2	10	884954	884963	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009718	AATAT	2	10	932235	932244	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009718	AAACT	2	10	935653	935662	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_009718	TAAAA	2	10	936353	936362	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009718	TATTT	2	10	937427	937436	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009718	CCTTT	2	10	944177	944186	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_009718	TAAAT	2	10	946878	946887	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009718	CCTCA	2	10	950995	951004	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
113	NC_009718	AATAC	2	10	978767	978776	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_009718	ATTAG	2	10	979744	979753	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009718	CGATT	2	10	979974	979983	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_009718	TCATT	2	10	980781	980790	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_009718	ACTGC	2	10	981565	981574	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_009718	TAAAA	2	10	994640	994649	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009718	CAATA	2	10	1009667	1009676	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_009718	GGTGG	2	10	1009686	1009695	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009718	ATATA	2	10	1019306	1019315	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009718	CTTCT	2	10	1021160	1021169	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_009718	AGAAA	2	10	1022016	1022025	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009718	TGGCT	2	10	1022564	1022573	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_009718	GTACT	2	10	1024220	1024229	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_009718	GAAAA	3	15	1025883	1025897	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009718	AATAC	2	10	1027138	1027147	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_009718	ACATA	2	10	1027739	1027748	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_009718	ACATA	2	10	1029664	1029673	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_009718	TTTTA	2	10	1031331	1031340	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009718	AAAAG	2	10	1033355	1033364	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009718	GAGAG	2	10	1034236	1034245	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009718	AAGTT	2	10	1064969	1064978	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009718	CTTTT	2	10	1074695	1074704	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_009718	TTAAA	2	10	1085003	1085012	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009718	TTTTA	2	10	1100395	1100404	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009718	TCTAA	2	10	1104150	1104159	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_009718	CAATA	2	10	1106049	1106058	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_009718	CAAAA	2	10	1118579	1118588	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_009718	AGATG	2	10	1121339	1121348	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009718	ATAAA	2	10	1121594	1121603	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009718	CTTAC	2	10	1132977	1132986	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_009718	TTTTC	2	10	1136746	1136755	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_009718	AATTA	2	10	1139554	1139563	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009718	ATATT	2	10	1139568	1139577	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009718	AATAA	2	10	1139702	1139711	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009718	TAAAA	2	10	1144769	1144778	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.