MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. tularensis WY96-3418 chromosome

Total Repeats: 164

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009257	TATTTC	2	12	2865	2876	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_009257	CTTTTT	2	12	6039	6050	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_009257	GAAGCT	2	12	16249	16260	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_009257	TTTTGA	2	12	16863	16874	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009257	AGCAAA	2	12	28961	28972	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_009257	AGCTTT	2	12	28973	28984	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_009257	CATATC	2	12	29254	29265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009257	GATAAA	2	12	29625	29636	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009257	AGAATA	2	12	57402	57413	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009257	TGAAAT	2	12	59708	59719	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009257	GATGGT	2	12	61309	61320	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009257	ATGGTG	2	12	71200	71211	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009257	TAACTA	2	12	77733	77744	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_009257	ATGATA	2	12	109492	109503	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009257	ATGATA	2	12	115183	115194	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009257	TCCATG	2	12	131848	131859	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009257	AGCTTG	2	12	179247	179258	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_009257	TAGTGC	2	12	220138	220149	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_009257	ATTTTT	2	12	220796	220807	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009257	TCCACA	2	12	249177	249188	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009257	ATAAAC	2	12	258405	258416	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_009257	TGTTTT	2	12	266693	266704	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009257	AAAATA	2	12	275463	275474	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009257	AGTATG	2	12	277366	277377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009257	GGTAAT	2	12	299270	299281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009257	CAAAAA	2	12	301837	301848	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_009257	TTATAA	2	12	304945	304956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009257	AAGATA	2	12	337447	337458	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009257	GAAAAT	2	12	340551	340562	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009257	ATAAAA	2	12	340912	340923	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009257	TAAATT	2	12	356099	356110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009257	TTTCAT	2	12	374648	374659	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_009257	ACTTTA	2	12	389079	389090	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_009257	AGATAA	2	12	404169	404180	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009257	CATTAA	2	12	433091	433102	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_009257	AATCCA	2	12	437209	437220	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009257	ATACAA	2	12	439777	439788	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_009257	TAAAAA	2	12	462170	462181	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009257	ATGTTA	2	12	470962	470973	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009257	AAACTT	2	12	499862	499873	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_009257	ACTAAG	2	12	499931	499942	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_009257	TAGTTA	2	12	516895	516906	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009257	AGCAAA	2	12	518674	518685	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_009257	AGCTTT	2	12	518686	518697	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_009257	AGAATA	2	12	547115	547126	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009257	TGAAAT	2	12	549421	549432	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009257	ACAATT	2	12	551609	551620	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_009257	TGTATA	2	12	593891	593902	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009257	AAACTC	2	12	633324	633335	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009257	CATATT	2	12	634669	634680	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_009257	TATCAA	2	12	635062	635073	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_009257	GGTGGG	2	12	680897	680908	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009257	TATTTG	2	12	715538	715549	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009257	TTTAAA	2	12	723679	723690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009257	TATTAA	2	12	729014	729025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009257	AGAATA	2	12	736730	736741	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009257	TGAAAT	2	12	739036	739047	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009257	CTAAAG	2	12	751940	751951	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_009257	ATAACA	2	12	752512	752523	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_009257	ATTTTA	2	12	766645	766656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009257	AGTAAT	2	12	803562	803573	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009257	TTAAAT	2	12	812735	812746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009257	ACCAGC	2	12	838355	838366	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009257	ATAAAG	2	12	838368	838379	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009257	TGCTAA	2	12	838620	838631	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_009257	TAATTA	2	12	839004	839015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009257	TATTAA	2	12	839806	839817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009257	CTTTAT	2	12	856641	856652	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_009257	ATATAA	2	12	858436	858447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009257	TAATCT	2	12	860513	860524	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_009257	ATTTTT	2	12	868293	868304	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009257	ATTTGG	2	12	903221	903232	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009257	TAATAC	2	12	904363	904374	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_009257	AATTTT	2	12	919431	919442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009257	AATCAA	2	12	923930	923941	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_009257	CTAAAG	2	12	934307	934318	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_009257	TTTAAC	2	12	934621	934632	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_009257	AATTAT	2	12	956371	956382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009257	AAGTAG	2	12	963588	963599	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009257	TCCTTG	2	12	968472	968483	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009257	TAGCTA	2	12	973258	973269	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_009257	TCTAAT	2	12	977023	977034	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_009257	AACTAA	2	12	987770	987781	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_009257	CTAATG	2	12	1009438	1009449	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_009257	TCTTGG	2	12	1017222	1017233	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_009257	TATTTT	2	12	1049151	1049162	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009257	CATATA	2	12	1065678	1065689	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_009257	TATAAG	2	12	1078918	1078929	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009257	TATTTA	2	12	1078938	1078949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009257	AACTAA	2	12	1092688	1092699	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_009257	AAATTA	2	12	1111162	1111173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009257	AAATAT	2	12	1127080	1127091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009257	ATGATA	2	12	1136068	1136079	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009257	TTTTTG	2	12	1136616	1136627	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009257	CTGCAA	2	12	1150834	1150845	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009257	TACCTG	2	12	1152621	1152632	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009257	ATTTTA	2	12	1165152	1165163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009257	CTTTTT	2	12	1188560	1188571	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_009257	TGTTAC	2	12	1190545	1190556	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_009257	CAAGAC	2	12	1224698	1224709	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009257	TATCAA	2	12	1229737	1229748	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_009257	AAATAT	2	12	1244904	1244915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009257	GCTATA	2	12	1245292	1245303	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_009257	TAAATC	2	12	1247536	1247547	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_009257	AAACTA	2	12	1255407	1255418	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_009257	CATTAC	2	12	1259723	1259734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009257	CTCTCA	2	12	1282649	1282660	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_009257	CAAAGT	2	12	1283808	1283819	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_009257	AAATTA	2	12	1292470	1292481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009257	TCCATC	2	12	1297330	1297341	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009257	TGATAT	2	12	1306757	1306768	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009257	ACAAGT	4	24	1321981	1322004	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_009257	TAATGT	2	12	1322260	1322271	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009257	ATTAAT	2	12	1322438	1322449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009257	TATCAA	2	12	1323226	1323237	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_009257	AAAATC	2	12	1335945	1335956	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_009257	TAAATC	2	12	1343951	1343962	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_009257	TAAAAA	2	12	1344676	1344687	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009257	ATCAAA	2	12	1361717	1361728	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_009257	ATCAAA	2	12	1378247	1378258	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_009257	TTTTGT	2	12	1397080	1397091	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009257	TATAAA	2	12	1400385	1400396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009257	TTATTT	2	12	1403308	1403319	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009257	TTTATG	2	12	1429483	1429494	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009257	ATCTTT	2	12	1429500	1429511	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_009257	CTTGAC	2	12	1431375	1431386	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009257	TCAATA	2	12	1432940	1432951	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_009257	TAAAGC	2	12	1433858	1433869	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_009257	TAATAT	2	12	1443113	1443124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.