MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella novicida U112 chromosome

Total Repeats: 229

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008601	TTTAG	2	10	8746	8755	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008601	TAGCT	2	10	15288	15297	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_008601	TTTCT	2	10	39689	39698	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_008601	ATTTT	2	10	46589	46598	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008601	ATTTT	2	10	46662	46671	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008601	AAATA	2	10	48992	49001	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008601	GATTT	2	10	75365	75374	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008601	TTTTA	2	10	78381	78390	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008601	TATAG	2	10	81336	81345	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008601	AATAA	2	10	83185	83194	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008601	TCAAG	2	10	88481	88490	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_008601	CTATA	2	10	92398	92407	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_008601	TATTT	2	10	93013	93022	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008601	TAGAA	2	10	104551	104560	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008601	AATTT	2	10	106981	106990	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008601	GATAA	2	10	111534	111543	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008601	AAAGT	2	10	121777	121786	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008601	GCCCT	2	10	125906	125915	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_008601	TTAAC	2	10	129038	129047	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_008601	TAAAC	2	10	130516	130525	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_008601	TAGCT	2	10	140406	140415	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_008601	TATAG	2	10	143434	143443	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008601	AAAAT	2	10	143562	143571	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008601	ATTTT	2	10	160846	160855	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008601	ATGTA	2	10	174525	174534	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008601	TTATC	2	10	174535	174544	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_008601	TTTAT	2	10	176628	176637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008601	TAATG	2	10	176662	176671	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008601	TAAAG	2	10	178009	178018	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008601	CTTTT	2	10	192912	192921	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_008601	TTAAG	2	10	213096	213105	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008601	AGATT	2	10	213190	213199	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008601	CCAAT	2	10	215646	215655	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_008601	AAAAC	2	10	221396	221405	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_008601	AGAAA	2	10	233387	233396	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008601	TTTCT	2	10	240338	240347	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_008601	AAAAT	2	10	241131	241140	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008601	AGAAA	2	10	245839	245848	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008601	TAATA	2	10	259374	259383	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008601	ATTTT	2	10	264048	264057	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008601	ATTTC	2	10	272764	272773	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_008601	CAAAC	2	10	290598	290607	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_008601	AACTA	2	10	291256	291265	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_008601	GTTTA	2	10	298796	298805	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008601	GTTTT	2	10	303443	303452	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008601	ATCTT	2	10	303540	303549	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_008601	AAATA	2	10	303612	303621	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008601	GATTT	2	10	333102	333111	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008601	TAATA	2	10	333204	333213	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008601	GTTTG	2	10	339445	339454	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008601	CAATT	2	10	339456	339465	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_008601	AATGA	2	10	342184	342193	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008601	AAGCA	2	10	343947	343956	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_008601	AAATT	2	10	344150	344159	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008601	ATTTA	2	10	356469	356478	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008601	AATCT	2	10	360869	360878	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_008601	TTAAT	2	10	370742	370751	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008601	AGAAA	2	10	372571	372580	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008601	TCATA	2	10	374392	374401	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_008601	GCAAA	2	10	378376	378385	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_008601	GCGAT	2	10	381925	381934	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_008601	AATCT	2	10	403223	403232	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_008601	ATTTA	2	10	409137	409146	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008601	TAGTT	2	10	414576	414585	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008601	TTAGA	2	10	414805	414814	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008601	GATTT	2	10	416655	416664	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008601	CTGTC	2	10	423326	423335	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_008601	TTTAT	2	10	425873	425882	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008601	AATAA	2	10	432160	432169	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008601	AATAT	2	10	452253	452262	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008601	TAACT	2	10	464253	464262	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_008601	CTAAA	2	10	468102	468111	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_008601	TGTTA	2	10	475765	475774	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008601	TTTTA	2	10	475779	475788	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008601	GAATA	2	10	477857	477866	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008601	TAATT	2	10	481293	481302	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008601	AGAAA	2	10	482438	482447	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008601	TAATT	2	10	483309	483318	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008601	TAATT	2	10	501148	501157	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008601	AGTTA	2	10	510191	510200	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008601	GTGTT	2	10	510430	510439	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008601	TTAAC	2	10	541854	541863	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_008601	AAACT	2	10	600427	600436	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_008601	AAATT	2	10	600492	600501	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008601	ATTAT	2	10	608721	608730	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008601	ATTTA	2	10	608738	608747	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008601	AGAAA	2	10	619437	619446	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008601	TTTAA	2	10	621536	621545	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008601	ACAAA	2	10	625804	625813	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_008601	ATTAT	2	10	633935	633944	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008601	TATCT	2	10	636330	636339	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_008601	TTAAT	2	10	641508	641517	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008601	TTTTA	2	10	650751	650760	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008601	TAAAA	2	10	668681	668690	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008601	TAGTT	2	10	672354	672363	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008601	TTTCT	2	10	673131	673140	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_008601	ATCTA	2	10	705537	705546	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_008601	ATTTT	2	10	712018	712027	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008601	TATTT	2	10	719072	719081	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008601	ATTAT	2	10	720662	720671	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008601	TTATT	2	10	720960	720969	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008601	ACAAA	2	10	726499	726508	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_008601	TAGTA	2	10	730286	730295	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008601	AACTT	2	10	745194	745203	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_008601	TTTTG	2	10	778535	778544	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008601	AAATA	2	10	785938	785947	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008601	TATAA	2	10	795666	795675	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008601	GTTTT	2	10	797915	797924	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008601	TTTTA	2	10	808122	808131	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008601	TTGAT	2	10	809529	809538	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008601	TAATA	2	10	827900	827909	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008601	TATGG	2	10	842403	842412	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008601	TTAGT	2	10	843290	843299	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008601	TTAAT	2	10	847242	847251	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008601	ATTTA	2	10	847497	847506	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008601	GTTAG	2	10	847617	847626	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008601	TATAG	2	10	850413	850422	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008601	TTTCT	2	10	851861	851870	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_008601	TAATA	2	10	856673	856682	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008601	AGAAA	2	10	856825	856834	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008601	TATAT	2	10	866164	866173	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008601	ATTAA	2	10	912933	912942	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008601	AATAA	2	10	914449	914458	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008601	AAATT	2	10	914492	914501	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008601	ACTTA	2	10	917795	917804	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_008601	TATTT	2	10	921066	921075	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008601	TATTT	2	10	921078	921087	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008601	ATATA	2	10	942970	942979	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008601	CTCAT	2	10	942984	942993	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_008601	AATAA	2	10	945280	945289	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008601	GTTTT	2	10	981905	981914	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008601	AGAAA	2	10	986237	986246	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008601	CTAAT	2	10	987219	987228	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_008601	ATAGT	2	10	987967	987976	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008601	TTTAA	2	10	988330	988339	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008601	TGATT	2	10	988569	988578	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008601	ATTTT	2	10	988737	988746	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008601	AAATA	2	10	999945	999954	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008601	GCATA	2	10	1000407	1000416	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_008601	TTTAA	2	10	1001098	1001107	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008601	TTTGT	2	10	1013837	1013846	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008601	TAGTA	2	10	1034488	1034497	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008601	TTTCT	2	10	1056087	1056096	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_008601	TAAAT	2	10	1068014	1068023	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008601	TATAA	2	10	1071884	1071893	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008601	CAATA	2	10	1075821	1075830	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_008601	TACTT	2	10	1076100	1076109	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_008601	AAAAT	2	10	1079840	1079849	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.