MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella novicida U112 chromosome

Total Repeats: 766

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008601	GCTT	2	8	23	30	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008601	TTAT	2	8	43	50	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008601	AAAT	2	8	7348	7355	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008601	TTTA	2	8	9020	9027	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008601	TTTA	2	8	9258	9265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008601	CAAC	2	8	9903	9910	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008601	TGTA	2	8	10471	10478	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008601	GTTA	2	8	10488	10495	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008601	TTTA	2	8	10600	10607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008601	GTTG	2	8	10638	10645	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008601	AATA	2	8	10875	10882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008601	AAGA	2	8	15414	15421	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008601	TAAA	2	8	16919	16926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008601	TAAT	2	8	16981	16988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008601	TATT	2	8	17996	18003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008601	ATTA	2	8	22962	22969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008601	TTGT	2	8	24750	24757	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008601	ACTA	2	8	24773	24780	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008601	TAAA	2	8	26849	26856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008601	ATTT	2	8	26882	26889	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008601	ATTT	2	8	26936	26943	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008601	ATTG	2	8	26965	26972	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008601	TATT	2	8	27335	27342	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008601	GCTT	2	8	27925	27932	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008601	GCTA	2	8	28684	28691	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008601	TTAT	2	8	30733	30740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008601	CAAA	2	8	32940	32947	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008601	ACCT	2	8	36957	36964	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008601	AGTT	2	8	37048	37055	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008601	CTTT	2	8	38717	38724	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008601	GTAT	2	8	38727	38734	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008601	TTAT	2	8	38757	38764	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008601	AATA	2	8	39034	39041	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008601	AAGA	2	8	39667	39674	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008601	ATTT	2	8	39803	39810	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008601	TTAT	2	8	44357	44364	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008601	ATTT	2	8	64804	64811	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008601	AAGT	2	8	64838	64845	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008601	ATTT	2	8	65906	65913	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008601	ATCT	2	8	65932	65939	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008601	TAAT	2	8	66629	66636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008601	TAAT	2	8	75596	75603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008601	AATT	2	8	78305	78312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008601	GATA	2	8	78363	78370	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008601	TCTT	2	8	78478	78485	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_008601	ATTA	2	8	78870	78877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008601	ATAA	2	8	78904	78911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008601	AAAG	2	8	81353	81360	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008601	TTTA	2	8	87899	87906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008601	ATCA	2	8	88439	88446	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008601	ATTT	2	8	88461	88468	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008601	TTAA	2	8	96577	96584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008601	TGTT	2	8	96600	96607	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008601	AGTA	2	8	96629	96636	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008601	TAAA	2	8	97565	97572	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008601	TAAA	2	8	102594	102601	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008601	AGTT	2	8	102832	102839	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008601	AAAT	2	8	112467	112474	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008601	TTTA	2	8	116101	116108	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008601	TAAA	2	8	117798	117805	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008601	TTAC	2	8	125670	125677	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_008601	GAAG	2	8	125692	125699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008601	AAAT	2	8	125953	125960	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008601	TTTA	2	8	125981	125988	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008601	ATTA	2	8	131196	131203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008601	ATTT	2	8	133753	133760	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008601	ATTT	2	8	139144	139151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008601	TTTG	2	8	140434	140441	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008601	ATCT	2	8	143506	143513	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008601	AATA	2	8	144938	144945	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008601	TAAT	2	8	146364	146371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008601	GGTA	2	8	150164	150171	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008601	ATAA	2	8	150993	151000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008601	TATT	2	8	156845	156852	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008601	AATT	2	8	165834	165841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008601	TAAT	2	8	171085	171092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008601	TAAA	2	8	171278	171285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008601	TAAG	2	8	172732	172739	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008601	TGGT	2	8	174460	174467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008601	TTTG	2	8	181801	181808	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008601	AAGA	2	8	181955	181962	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008601	TTTA	2	8	184849	184856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008601	AATA	2	8	185815	185822	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008601	AGTT	2	8	190519	190526	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008601	TTTA	2	8	192951	192958	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008601	AATA	2	8	194316	194323	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008601	TTTA	2	8	195922	195929	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008601	GATT	2	8	207610	207617	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008601	AGAT	2	8	208816	208823	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008601	TGAT	2	8	209694	209701	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008601	ATTT	2	8	212761	212768	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008601	ATTA	2	8	212897	212904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008601	ATTT	2	8	213123	213130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008601	TAAT	2	8	214620	214627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008601	TCAA	2	8	215624	215631	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_008601	GAAA	2	8	215690	215697	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008601	AAGT	2	8	215879	215886	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008601	GTTG	2	8	215896	215903	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008601	ATTA	2	8	215943	215950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008601	TAAA	2	8	216238	216245	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008601	TAGA	2	8	221507	221514	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008601	AAAT	2	8	233275	233282	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008601	TCTT	2	8	233411	233418	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_008601	GTAT	2	8	233955	233962	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008601	CTAA	2	8	237992	237999	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_008601	TTTA	2	8	238046	238053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008601	GATA	2	8	239596	239603	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008601	AATA	2	8	239683	239690	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008601	AAGA	2	8	240316	240323	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008601	ATTT	2	8	240452	240459	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008601	GAAA	2	8	243281	243288	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008601	TCTT	2	8	245863	245870	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_008601	TGTA	2	8	246299	246306	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008601	TAAT	2	8	248223	248230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008601	TAAT	2	8	250088	250095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008601	AAAC	2	8	250912	250919	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_008601	ATTA	2	8	258971	258978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008601	ATTA	2	8	259336	259343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008601	ATTA	2	8	260044	260051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008601	TTAT	2	8	264500	264507	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008601	TAAA	2	8	269706	269713	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008601	GCAT	2	8	274846	274853	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_008601	ATTA	2	8	275447	275454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008601	CTTG	2	8	275886	275893	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008601	ATTT	2	8	277430	277437	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008601	TAAA	2	8	277474	277481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008601	TTAA	2	8	279425	279432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008601	AGTC	2	8	286756	286763	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_008601	GATG	2	8	290209	290216	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008601	TCTA	2	8	290579	290586	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_008601	GATA	2	8	290647	290654	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008601	AATC	2	8	291092	291099	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_008601	CTTG	2	8	291529	291536	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_008601	TAAA	2	8	295646	295653	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008601	ATTA	2	8	295885	295892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008601	ATTT	2	8	306739	306746	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008601	TTTA	2	8	306833	306840	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008601	AAAC	2	8	306969	306976	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_008601	ATTA	2	8	308505	308512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008601	ATTA	2	8	325686	325693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008601	CAAT	2	8	333145	333152	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_008601	CCCT	2	8	338925	338932	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
143	NC_008601	TTTA	2	8	339503	339510	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008601	TAGT	2	8	342087	342094	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008601	TAGT	2	8	343918	343925	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008601	ATTT	2	8	344242	344249	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008601	TTTA	2	8	345895	345902	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008601	TAAT	2	8	353480	353487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008601	CAAA	2	8	353524	353531	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_008601	TAAT	2	8	356518	356525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008601	ATAA	2	8	356544	356551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008601	ATTG	2	8	371133	371140	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008601	TAAT	2	8	371373	371380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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